甘肃省科技重大专项计划(1102NKDH023)
- 作品数：7 被引量：33H指数：4
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- 绵羊BMP15基因特征、组织表达及其与产羔数性状的关联性分析被引量：10
- 2015年
- 为了解绵羊BMP15基因序列特征和组织表达特征,SNP筛查及其与产羔数性状关联性分析,采用生物信息学方法分析绵羊BMP15基因序列特征;利用qRT-PCR检测BMP15基因在‘湖羊’下丘脑、垂体、心等13个组织中mRNA的分布;通过测序验证了绵羊BMP15基因B2突变位点并与产羔数进行关联性分析.结果表明:绵羊BMP15基因ORF全长1 377bp,编码393个氨基酸残基,包括transforming growth factor-beta(TGF-beta)家族和低复杂性区段(low complexity region).Protfun分析结果显示,绵羊BMP15基因作为激素参与生物学过程的可能性最高.绵羊BMP15基因在公羊十二指肠中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05),而在母羊中,卵巢组织的表达量最高,且显著高于其他组织(P<0.05).B2突变位点于BMP15基因编码区外显子Ⅱ的第718bp处,该突变为C→T突变.绵羊产羔数相关联分析结果显示:该位点与产羔数呈显著相关,其中G+型绵羊产羔数为(2.00±0.78),显著高于++型绵羊产羔数(P<0.05),为(1.38±0.54).绵羊BMP15基因B2突变位点与绵羊产羔数呈显著相关,可用作为提高绵羊产羔数性状的分子标记应用于育种.
- 刘世佳潘香羽李发弟王维民李廷福
- 关键词：绵羊BMP15基因特征产羔数
- 绵羊ESR基因生物信息学分析被引量：9
- 2014年
- 利用生物基因组学数据库,对绵羊雌激素受体(estrogen receptor,ESR)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊ESR基因含有1个1 413 bp的开放阅读框,编码470个氨基酸;ESR蛋白分子质量为53 393.85D。ESR基因主要位于细胞核中,参与机体转录调控过程。
- 张小雪潘香羽李发弟王维民
- 关键词：绵羊雌激素受体生物信息学分析
- 绵羊GDF9基因生物信息学分析被引量：3
- 2014年
- 利用生物基因组学数据库,对生长分化因子9(Growth Differentiation Factor 9,GDF 9)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊GDF 9基因含有1个1 362 bp的开放阅读框,编码452个氨基酸;GDF 9蛋白分子质量为51 773.63 D;GDF 9基因主要位于细胞膜及膜外,参与机体的信号转导调控。
- 张小雪潘香羽李发弟王维民
- 关键词：绵羊生物信息学分析
- 绵羊RARG基因组织表达规律的研究被引量：2
- 2013年
- 根据GenBank中报道的绵羊视黄酸受体γ(retinoic acid receptor-gamma,RARG)基因mRNA序列,设计特异性引物,利用Real-time PCR技术对绵羊RARG基因的组织表达规律进行了研究,并对其进行了生物信息学分析,为进一步研究该基因的功能提供线索。结果表明,绵羊RARG基因共编码458个氨基酸,其中亮氨酸所占比例最高,为11.10%;该基因编码产物在系统进化树中与牛的亲缘关系最近;RARG基因编码产物二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主,主要位于细胞核中,是一种水溶性蛋白;Real-time PCR结果显示,绵羊RARG mRNA在心、肝、脾、肺、肾、瘤胃、十二指肠、淋巴、下丘脑、垂体、肌肉、睾丸等12个组织中均有表达,其中在睾丸中表达量最高,推测绵羊RARG基因可能参与机体繁殖机能的调控。
- 王维民李发弟潘香羽
- 关键词：绵羊PCR生物信息学分析
- 酵母β-葡聚糖对早期断奶羔羊瘤胃氮代谢的影响被引量：6
- 2013年
- 选用甘肃肉用绵羊新品种选育群初生公羔20只,随机分为5组,观测了饲粮中添加不同剂量(0、37.50、75.00、112.50、150.00 mg/kg)酵母β-葡聚糖对早期断奶羔羊瘤胃氮代谢参数的影响,结果表明,添加酵母β-葡聚糖对日龄82 d的羔羊瘤胃液中总氮、氨氮和蛋白氮含量均没有显著影响(P>0.05),75.00 mg/kg的添加剂量组尿素氮含量有高于对照组的趋势(P=0.091),食前150.00 mg/kg添加剂量组血清尿素氮显著低于对照组(P<0.05)。
- 李冲魏占虎李发弟马友记王维民姜仲文周勇
- 关键词：早期断奶羔羊酵母Β-葡聚糖血清尿素氮
- 绵羊LHβ基因生物信息学分析被引量：4
- 2013年
- 利用生物基因组学数据库,对绵羊促黄体生成素β(Luteinizing hormone beta,LHβ)基因进行生物信息学分析。结果表明,绵羊LHβ基因含有1个426 bp的开放阅读框,编码141个氨基酸;LHβ蛋白分子质量为15.2KD,理论等电点为7.47;LHβ编码产物的二级结构主要以β折叠和无规则卷曲为主,主要位于细胞质中,作为一种激素参与机体的生殖调控。
- 王维民李发弟潘香羽
- 关键词：绵羊生物信息学分析
- 绵羊IGF-Ⅰ和IGF-Ⅰ R基因特征分析及其在肌肉组织中的表达差异被引量：2
- 2015年
- 为了比较IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因在绵羊肌肉中的表达差异,根据GenBank公布的绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因mRNA序列设计特异性引物,采用实时定量PCR方法检测其在甘肃‘高山细毛羊’及其与南非肉用‘美利奴’杂交F1代（南甘F1代）羔羊肌肉组织中的表达量.利用生物信息学软件分析了绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因结构,并构建系统进化树,探讨了其生物学功能.结果表明：南甘F1代羔羊肌肉组织中IGF-Ⅰ基因的表达量显著高于‘甘肃高山细毛羊’（P〈0.05）,而IGF-ⅠR基因的表达量在南甘F1代羔羊和‘甘肃高山细毛羊’肌肉组织中没有显著变化（P〉0.05）.绵羊IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因分别含有465bp和4 518bp的完整开放阅读框,编码154个和1 505个氨基酸;其蛋白质分子量分别为17 011.71U和169 267.26U,等电点分别为9.36和6.70;IGF-Ⅰ基因信号肽切割点分别位于49～50位氨基酸之间,而IGF-ⅠR基因不含信号肽;IGF-Ⅰ基因编码产物的二级结构主要以无规则卷曲和α-螺旋为主,位于细胞核的可能性最高（62.5%）;IGF-ⅠR基因编码产物的二级结构主要以无规则卷曲为主,位于细胞质的可能性最高（34.8%）;IGF-Ⅰ和IGF-ⅠR基因分别作为激素和信号传感器参与机体生物学过程.
- 王冬李发弟王维民马友记李冲梁育林
- 关键词：绵羊RT-QPCR
