国家重点基础研究发展计划(02EFN216700794)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：董秀春于学宁曹帮华刘欣玲樊金会更多>>
- 相关机构：山东农业大学山东艺术学院更多>>
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- 刺槐Na^+/H^+逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析(英文)被引量：4
- 2007年
- 盐分胁迫严重影响植物生长和产量。为了研究木本植物对盐分的适应性,利用5'RACE技术,从刺槐中克隆得到液泡Na^+/H^+逆向转运蛋白基因RpNHX1。该基因长度为2281 bp,含有一个开放阅读框,编码535氨基酸残基组成的蛋白,该蛋白序列与大豆GmNHX1和拟南芥AtNHX1相似,氨基酸的同源性分别达85%和69%,RpNHX1属于NHX亚族的NHX-I分枝。用生物信息学的方法预测RpNHX1具有所有Na^+/H^+逆向转运蛋白共同的结构特点,即含有疏水的N末端,10个跨膜螺旋区域和一个具有调节功能的C端亲水区域,其中氨氯吡嗪咪敏感基序和CaM结合域也是保守的。在4和5的螺旋区域之间,存在有一串带负电荷氨基酸,显示出有规律的排列模式,这些模式在生物界中的Na^+/H^+转运蛋白中是保守的。结合亲疏水资料,我们认为Na^+/H^+转运通道结构可能存在于这一区域。另外,也分析了RpNHX1可能的糖基化、酰基化和磷酸化位点。从这些数据中可以看出,RpNHX1可能在细胞中起到Na^+区隔化作用。
- 于学宁刘欣玲董秀春樊金会曹帮华
- 关键词：NA^+/H^+逆向转运蛋白基因盐胁迫生物信息学分析刺槐
