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鲫鱼GABAARβ_3亚基生物信息学分析与同源建模被引量：1: 2014年; A型γ-氨基丁酸（aminobutyric acid，GABA）是一类配体门控离子通道型受体，亦为脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统内最主要的抑制性神经递质GABA的受体，其离子通道上存在氟虫腈等杀虫剂的作用靶点，是医药和农药工作者研究的重点。通过RACE—PCR技术成功获取新基因鲫鱼GABAARβ3的全长（GenBank登录号：KC964110）。序列分析显示该基因核苷酸序列共2767bp，含有1个由502个氨基酸残基组成的开放阅读框，编码蛋白分子量约为56KD。报道了该基因的生物信息学分析和三维结构模拟及其与氟虫腈作用情况，BLAST结果表明，氨基酸序列与其他已知GABAAR岛基因家族成员间序列相似性介于76％～89％之间，并与其他亚族蛋白基因存在很高的同源性。以线虫体内对阿维菌素敏感的谷氨酸门控氯离子通道受体蛋白的a亚基（PDBID：3RHW）作为模板，用DS（Discovery Studio）模拟鲫鱼GABAA鼠亚基的同源五聚体结构，优化结构模型，与农药配体分子做分子对接，计算作用模式和结合能力。研究鱼类GABAAR亚基与农药分子的作用。; 秦菠张博周艳芬汪小芬曹振龙任天瑞王振山; 关键词：鲫鱼污染克隆

氨基酸突变对GABAa受体结合能力的影响: 2012年; 采用同源建模技术构建了大鼠γ-氨基丁酸a型受体(GABAaR)模型,并将氨基酸残基β157Tyr和β205Tyr突变为相应的突变受体模型.使用分子对接方法计算了γ-氨基丁酸(GABA)与突变前后受体的相互作用.对接计算结果显示,Tyr突变为Phe后,两种突变受体的对接能量大幅提高,GABA生物活性降低;当Phe的对位引入氟原子后,对接能量与未突变受体相比更低.另外,与β205Tyr突变相比,与配体距离较近的β157Tyr突变,对受体与配体作用的影响更大.; 温夏夏南士滨黄迎任天瑞姚建华; 关键词：同源建模活性位点分子对接

虚拟技术与化学研究: <正>化学(chemistry)是研究物质的组成、结构、性质和变化规律的科学[1],其研究内容主要可归纳为三部分:分子设计、合成设计和结构确定。利用相关技术设计具有特定功能的化合物即为分子设计[2]。利用相关技术设计特定...; 李佳黄迎徐雯丽胡静姚建华; 关键词：虚拟技术化学信息学化学研究; 文献传递

γ-氨基丁酸与其突变受体的作用研究: γ-氨基丁酸(GABA)是哺乳动物中枢神经系统的抑制性神经递质,其主要作用的受体为γ-氨基丁酸a型受体(GABAaR)。GABAaR属于配体门控通道超家族(LGIC),这个家族同时包括烟碱型乙酰胆碱受体,甘氨酸受体和血清...; 温夏夏南士滨黄迎任天瑞姚建华; 关键词：活性位点同源建模分子对接

计算机辅助化学品风险评估: <正>化学品是指纯化合物或混合的化合物,它遍布于人类的生存环境,同时存在于人类生活的必需品中,如食品、药品、化妆品、服装和建筑材料等。为此,我们在关注化学品的功能的同时,必须关注它对人类可能产生的威胁。; 黄迎李佳徐雯丽冯樑凌敏胡静陈碧玲周红高映新姚建华; 关键词：化学信息学化学品风险评估; 文献传递

CISOC-LSS的设计和开发: 研究表明，在农药和医药的研发过程中，大量的化合物由于某些性质不符合相关标准而被淘汰。因而，如果能够在研发初期就将那些性质不合适的化合物筛除，将能在研发过程中，节约大量的时间和经费。目前，有大量的描述符与化合物的各类性质相...; 刘斌黄迎姚建华; 关键词：LEAD COMPOUNDS VIRTUAL SCREENING DESCRIPTORS

虚拟技术与化学研究: 2014年; 介绍了虚拟技术和化学信息等概念、内容以及两者的关系。提出了化学研究的现代模式的理念。列举两种模式的分子设计流程,显示虚拟技术在化学研究中的重要作用。实践证明,应用虚拟技术可以在一定程度上提高化学研究效率,降低研究过程中产生的污染。; 姚建华李佳黄迎徐雯丽蒋舒仰胡静; 关键词：虚拟技术化学信息学化学研究

基于密度泛函理论的2,4-二氯苯氧乙酸水解机理研究: 2,4－二氯苯氧乙酸(2,4-Dichlorophenoxy acetic acid)(2,4-D)(CAS：94-75-7)是一种应用广泛的农用除草剂和植物生长调节剂。低浓度时,对植物生长具有刺激作用,促进作物早熟增产...; 李佳姚建华; 关键词：HYDROLYSIS

2,4-二氯苯氧乙酸代谢中的水解反应机理被引量：7: 2013年; 2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D)是应用广泛的农用除草剂和植物生长素,在它的代谢过程中,涉及多种化学反应.本文采用密度泛函理论B3LYP方法,分别研究了它在代谢过程中的三条水解反应途径的机理.研究结果表明:(Ⅰ)2,4-D水解反应有两种模式,C(1)―O键解离的氢转移和C―Cl键解离的氯被取代.(II)C―Cl键的解离能垒明显低于C(1)―O键的解离能垒,即水解速率较快,反应动力学占优势.在三条反应途径中,途径(2)和(3)优先水解C―Cl键,再水解C(1)―O键.由于受反应速率的影响,不同中间体在降解过程中的浓度有明显区别.(Ⅲ)对于水解反应,采用导体极化连续模型(CPCM)考虑溶剂化效应,可更合理地阐述水解反应机理.; 李佳徐雯丽胡静凌敏姚建华; 关键词：2,4-二氯苯氧乙酸密度泛函理论反应机理势能面溶剂化效应

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国家自然科学基金(21072216)