中央高校基金(GK201403007)
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
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- 棉花蔗糖合成酶基因家族在纤维发育期时空表达模式分析被引量：4
- 2015年
- 蔗糖合成酶（Sucrose Synthase）是调控植物糖类代谢的关键酶之一,在植物生长发育及渗透调节过程中起着重要的作用。该酶为多基因家族,各成员在植物不同组织及不同发育阶段发挥不同的作用。陆地棉（Gossypium hirsutum）中有15个Sus成员,本研究利用转录组高通量测序及实时定量PCR技术,检测了该基因家族的表达模式。结果表明,Gh Sus1D、Gh Sus3A、Gh Sus3D和Gh Sus6D在起始期（0~3 DPA）大量表达;GhSus7D在10 DPA的纤维中表达量快速增加,达到同期突变体胚珠的4.7倍;Gh Sus1A、Gh Sus5D在纤维伸长期（5~15 DPA）表达量显著高于胚珠,分别在10 DPA、15 DPA时达到峰值;Gh Sus3A、Gh Sus3D、和Gh Sus6D在纤维发育（15 DPA）时表达量重新上升,且在20 DPA时仍处于较高表达水平。Sus基因家族组织表达模式分析表明,它们在陆地棉品种徐州142野生型和突变体中的组织表达模式基本相同,根、茎、叶、花中没有显著差异。但不同Sus基因具有不同的组织表达特异性。
- 黄圣何鹏田莉莉俞嘉宁
- 关键词：棉花纤维棉花基因表达模式蔗糖合成酶
- 11个棉花核基因RNA编辑位点的分析及测定
- A编辑是转录后在RNA成熟过程中的加工与修饰现象,广泛存在于各种生物中.在高等植物中,RNA编辑主要存在于线粒体、叶绿体基因中,核基因中还鲜有报道.本实验以棉花(徐州142)作为实验材料,筛选了棉纤维生长发育过程中11个...
- 蔡云巧冀亚萍何鹏俞嘉宁
- 关键词：棉花纤维核基因组核糖核酸生长发育
- 棉花GhPPR9基因的克隆及表达模式分析
- R蛋白在植物生长发育过程中具有重要作用,大多数PPR蛋白定位在叶绿体或者线粒体中,通过与其转录本的结合,在线粒体和叶绿体中起到调控的作用,包括转录、RNA剪接、RNA编辑以及翻译等.研究表明植物中PPR基因缺失后会导致叶...
- 陈慧何鹏俞嘉宁
- 关键词：棉花克隆技术生长发育逆境胁迫
- 棉花2个新的PPR基因的克隆及表达模式分析
- 2014年
- 【目的】从棉花中克隆2个新的PPR基因,分析其序列结构、基因表达和亚细胞定位,为深入研究这2个基因在棉花中的功能提供依据。【方法】利用棉花EST库,通过RT-PCR从陆地棉徐州142中克隆得到2个PPR基因:GhPPRH1和GhPPRH2;应用生物信息学方法对2个基因编码蛋白序列进行预测分析,利用半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR的方法分析目的基因在不同组织及纤维不同发育时期的表达模式;利用棉花子叶瞬时表达系统对上述2个基因编码的蛋白进行亚细胞定位。【结果】GhPPRH1和GhPPRH2均属于PPR基因家族的PLS亚家族;GhPPRH1和GhPPRH2的开放读码框的长度分别为1 917和2 556 bp,编码638和851个氨基酸;GhPPRH1蛋白有18个PPR基序,包含1个E+结构域和1个DYW结构;GhPPRH2蛋白有17个PPR基序,包含1个E结构域,1个E+结构域和1个DYW结构;将GhPPRH1和GhPPRH2蛋白的氨基酸序列与GenBank数据库中的9条同源蛋白以及棉花中已经报道的5个PPR蛋白的氨基酸序列进行比对,构建系统进化树,结果显示,GhPPRH1与水稻RF1b蛋白亲缘关系较近,推测其可能与胞质雄性不育的育性恢复相关,而GhPPRH2与玉米PPR5蛋白亲缘关系最近,推测可能会影响细胞器一些转录本的RNA编辑;半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR的结果表明,GhPPRH1和GhPPRH2在根、茎、叶、花及纤维发育不同时期均有表达,GhPPRH1在根中表达较高,而GhPPRH2在根、叶及15 d的纤维中表达较高;亚细胞定位结果显示,GFP标记的GhPPRH1蛋白的绿色荧光与线粒体Marker的红色荧光重叠,表明该蛋白可能定位于线粒体,GFP标记的GhPPRH2蛋白的绿色荧光与叶绿体自发的红色荧光重叠,表明GhPPRH2可能定位在叶绿体。【结论】从棉花中获得2个新的PPR基因,均属于PLS亚家族成员,亚细胞定位显示可能在线粒体和叶绿体中,推测其功能可能与细胞器中RNA的加工、修饰等过程有关。
- 何鹏黄圣钱慧俞嘉宁
- 关键词：棉花基因克隆亚细胞定位
