国家高技术研究发展计划(102-10-01-05) 作品数:14 被引量:110 H指数:6 相关作者: 李桂源 李伟芳 张小慧 张必成 向娟娟 更多>> 相关机构: 中南大学 湖南医科大学 中国人民解放军第一军医大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家重点基础研究发展计划 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
鼻咽癌细胞中表达上调的新基因NAG23(FBXO30)的克隆与分析 被引量:9 2001年 目的:分离位于6号染色体长臂鼻咽癌高频等位基因不平衡位点D6S1581(6q25.3-27)附近与鼻咽癌相关的新基因。方法:运用差异RT-PCR检测定位于D6S1581附近的11个表达序列标签(expressedsequencetags,EST)在正常人鼻咽上皮细胞和鼻咽癌细胞系中的表达水平,并对其中一个表达上调的EST在鼻咽癌组织和正常鼻咽组织中的表达情况进行分析。用Northern杂交验证其表达差异并检测其在多脏器中的表达及其所代表基因的转录本大小。利用生物信息学资源克隆并获得其全长cDNA,对该序列进行初步分析。结果:获得了一个位于6q25.3-27的在鼻咽癌中表达上调的新基因,命名为NAG23(FBXO30)(GenBank收录编号:AF248640)。该基因在68.9%的鼻咽癌活检组织中表达上调,cDNA全长3301bp,预测其开放阅读框编码一个含390个氨基酸的胞浆蛋白,该蛋白含一个F-box基序。结论:NAG23基因是一个在鼻咽癌中表达上调的新基因,很可能编码一新的F-box蛋白。NAG23可能参与了鼻咽癌的发生发展。 李忠花 曹利 向娟娟 张必成 向秋 唐珂 周鸣 李小玲 李伟芳 李桂源关键词:鼻咽肿瘤 基因克隆 F-BOX蛋白 Detailed Deletion Mapping of Chromosome 9p21-22 in Nasopharyngeal Carcinoma 2000年 Objective: To further refine the extent of deletion on chromosome 9p21-22 in nasopharyngeal carcinoma (NPC) and provide evidence for discovering new tumor suppressor gene. Methods: Loss of heterozygosity (LOH) on chromosome 9p21-22 was analyzed in 25 paired blood and tumor samples by using 11 high-density microsatellite polymorphic markers. Results: 17 of 25 cases (68.0%) showed LOH at one or more loci. Higher frequencies of LOH were found at four loci: D9S161 (35.0%), D9S1678 (31.5%), D9S263 (33.3%) and D9S1853 (33.3%), where 6 cases had a contiguous stretch of allelic loss. Conclusion: The minimal common region of deletion might be defined between D9S161 and D9S1853 (estimated about 2.7 cM in extent) at 9p21.1, suggesting that inactivation of one or more tumor suppressor genes located in this region may be an important step in NPC. 阳剑波应用酵母双杂交系统筛选BRD7相互作用的蛋白质 被引量:14 2002年 BRD7基因是鼻咽癌组织表达下调/缺失的基因,有强烈的鼻咽癌细胞系HNE1生长抑制作用.利用酵母双杂交系统筛选与BRD7蛋白相互作用的蛋白,首先将BRD7基因的完整阅读框架部分亚克隆至pAS2载体(BRD7-BD),然后以BRD7-BD为靶蛋白,筛选人胎脑cDNA文库,在4.8×106个转化子中筛选到11个阳性克隆,序列测定表明,分离到溴区包含蛋由3,溴区包含蛋白2,β-IκB激酶,KIAA1375蛋白,白介素7和接头相关蛋白复合物3δ-1亚单位等与BRD7相互作用蛋白,说明BRD7可能与BRD3或BRD2蛋白形成异源二聚体或三聚体发挥核内转录调节功能. 余鹰 朱诗国 张必成 周鸣 李小玲 李桂源关键词:酵母双杂交系统 相互作用蛋白 鼻咽癌 BRD7基因转染对鼻咽癌细胞生长的抑制作用 被引量:25 2001年 目的:探讨鼻咽癌负相关基因BRD7对鼻咽癌细胞系HNEI生长的影响。方法:构建BRD7基因真核表达载体pcDNA3.1(+)/BRD7重组体,采用脂质体介导转染技术,将BRD7真核表达重组质粒和空载体质粒分别导入鼻咽癌细胞系HNE1,Southern杂交和RT-PCR分别检测外源性DNA的整合和BRD7基因的表达,并借助细胞生长曲线、软琼脂集落形成试验、流式细胞计数和裸鼠接种方法对转染细胞的生物学行为进行了检测。结果:转染BRD7基因的 HNE1生长倍增时间为53 h,较HNE1(23.9h)和空载体转染 HNE1(24.1h)明显延长,流式细胞仪表明,BRD7表达升高延缓细胞由G0-G1期进人S期,BRD7转染HNE1在软琼脂中集落形成率较对照组显著下降(P<0.01),裸鼠接种试验显示BRD7基因转染细胞HNE1生长速度受到抑制。结论:BRD7基因重表达有助于HNE1的恶性表型的逆转;BRD7是一个鼻咽癌相关的抑瘤基因良好的候选者。 余鹰 朱诗国 张必成 李忠花 向娟娟 周鸣 李小玲 李桂源关键词:鼻咽肿瘤 BRD7 抑瘤基因 基因转染 HNE1 NPC 鼻咽上皮组织定向cDNA文库的快速构建 被引量:6 2001年 目的 采用SMART (switchingmechanismat5′endofRNAtranscript)技术 ,快速构建了高质量的成人鼻咽上皮组织定向cDNA文库。方法 从成人正常鼻咽上皮组织分离总RNA ,利用经修饰的oligo(dT)引物 (含sfiIB酶切位点 )合成cDNA第一链 ,同时根据真核生物mRNA 5′端帽子结构特点 ,利用SMART核苷酸 (含sfiIA酶切位点 )作为cDNA第二链在mRNA 5′端延伸出去的模板 ,进而以此序列为引物利用LD PCR(Long distance PCR)合成双链cDNA ,双链cDNA经sfiI(IA&IB)酶切和过柱分级分离后 ,克隆入经sfiI酶切的λTripIEX2载体后经体外包装而成cDNA文库。结果 获得 1.5× 10 6个重组子 ,重组率达 10 0 %。文库扩增后 ,滴度达 3.8× 10 9pfu/ml,插入cDNA平均长度为 1.5kb。结论构建的成人鼻咽cDNA文库具有良好的质量 ,该cDNA文库为进一步筛选。 张必成 余鹰 邱元正 钱骏 周鸣 李忠花 张小慧 向娟娟 朱诗国 李桂源关键词:鼻咽肿瘤 DNA重组 基因文库 遗传学技术 CDNA SMART CK13基因与EB病毒DNA在鼻咽癌中的表达及临床意义 被引量:3 2001年 目的探讨细胞角蛋白基因13 (C 13)和EB病毒DNA在人鼻咽癌(NPC)组织中的表达及其意义。方法应用 Northern杂交对32例 NPC和 8例慢性鼻咽炎(CINE)组织进行CK13mRNA水平检测,同时应用PCR方法进行EB病毒DNA检测。结果CK13基因在鼻咽炎组织中高表达,在NPC组织中的表达显著下调,下调的频率达65.63%(21/32)。结论NPC组织的分化可能与CK13基因的表达下调有关。 邱元正 文忠 林功标 肖健云 田勇泉 赵素萍 陶正德 李桂源关键词:鼻咽癌 EB病毒 聚合酶链反应 NORTHERN杂交 间隙连接蛋白Cx43、Cx45在鼻咽癌组织中的表达 被引量:5 2002年 背景与目的:间隙连接在细胞间的营养物质、离子和细胞调节因子的交换中起重要作用。间隙连接异常,细胞间的物质交换障碍,往往导致细胞分裂失控。在有些癌组织和癌细胞中存在间隙连接的功能异常,恢复这些癌细胞的间隙连接功能,它们表现出正常细胞的生物学表型。因此,探讨细胞间隙连接蛋白在鼻咽癌中的表达,将有可能为临床诊断提供方法,为鼻咽癌的发病机理提供新思路。方法:采用免疫组化技术检测间隙连接蛋白Cx43、Cx45在鼻咽组织中的表达。结果:①Cx43、Cx45在鼻咽慢性炎症组织和鼻咽癌组织中有表达差异,在鼻咽癌中,Cx43、Cx45阳性率为44.8%、46.6%,与鼻咽慢性炎症柱状上皮细胞阳性率的86.5%和100%比较,显著性下降(P<0.01)。②鼻咽慢性炎症组织比鼻咽癌组织含鳞状细胞的百分率低(P<0.01),分别为29.7%和56.9%。③Cx43、Cx45在鼻咽癌旁柱状上皮细胞中的表达低于癌旁鳞状上皮细胞(P<0.001),高于癌细胞(P<0.01)。结论:Cx43、Cx45在鼻咽组织中的表达异常,可能与鼻咽组织鳞化和癌变有关。 向秋 范松青 李江 谭琛 向娟娟 张秋红 王蓉 李桂源关键词:间隙连接蛋白 CX43 CX45 鼻咽癌 鼻咽癌上皮细胞株HNE1 cDNA文库的构建及鼻咽癌表达上调基因的筛选 2002年 张必成 李忠花 朱诗国 曹利 余鹰 李伟芳 李桂源关键词:鼻咽肿瘤 CDNA克隆 NPC 上调基因 NAG14基因结构域蛋白的原核表达 被引量:1 2002年 董利 王洁如 钱骏 张小慧 谭琛 聂新民 李桂源关键词:基因表达 融合蛋白 染色体7q32-ter最小共同缺失区鼻咽癌抑瘤基因候选者的筛选 被引量:4 2000年 目的:在明确 7q32- ter区域等位基因杂合性丢失最小共同缺失区位于以 D7S509为中心的 D7S500- D7S509- D7S495的基础上,筛选和克隆位于该区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因。方法:应用定位—候选克隆策略筛选位于该最小共同缺失区的 3′末端 ESTs(expressed sequence tags,ESTs),RT- PCR和 Northern杂交筛选出在鼻咽癌细胞株和活检组织中表达下调的 ESTs,采用 cDNA克隆测序和生物信息学资源获取候选 EST的全长 cDNA。 Southern杂交和甲基化分析研究候选基因表达下调的机制。结果:筛选 D7S500- D7S495区域内的 12个代表新基因的 3′末端 ESTs序列,发现一个 EST( AI290024)在鼻咽癌细胞株及 50%( 6/12)的鼻咽癌活检组织中表达下调, Multiple Tissue Northern(MTNTM) Blot杂交结果显示该 EST在心、肝、肾等多种组织中存在大小 2.0 kb的转录本。通过测定包含该 EST的 cDNA克隆,获得该新基因(命名为 NAG- 22基因) 2.3 kb转录本的全长 cDNA(GenBank登录号: AF247820),编码 77AA,含有 disintegrin的结构域。 NAG22在 NPC中表达下调的机制不是高甲基化和基因拷贝数的丢失。结论: NAG22是定位于 7q32- ter最小共同缺失区的一个与鼻咽癌相关的抑瘤基因候选者。 张小慧 钱骏 王洁如 董利 曹利 周鸣 唐珂 李伟芳 李桂源关键词:鼻咽肿瘤