广州市科技攻关项目(A2004378)
- 作品数：1 被引量：2H指数：1
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- 幽门螺杆菌napA基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2007年
- [目的]获取幽门螺杆菌NCTC 11639中性粒细胞激活蛋白基因(napA),预测其编码蛋白作为幽门螺杆菌疫苗候选抗原的可行性,为Hp疫苗研制奠定基础。[方法]提取幽门螺杆菌标准株NCTC 11639的基因组DNA,参照GeneBank中幽门螺杆菌标准株22695的序列设计引物PCR扩增napA基因,克隆入pMD18-T载体中,对重组质粒测序后进行生物信息学分析。[结果]克隆的napA基因全长为435bp,在GenBank上登录(No.DQ341279),与Gen-Bank公布的其它Hp菌株的核酸同源性为94%～98%,与国际测序模式株Hp26695、HpJ99同源性达97%。[结论]成功扩增Hp标准株NCTC 11639 napA基因,通过同源性检索分析表明Hp与人及其它哺乳动物的基因组DNA同源序列低,在不同Hp菌株中高度保守,符合疫苗候选抗原的基本特征;抗原表位预测显示有4条高抗原性肽段,其中118-140肽段抗原指数最强,可能存在良好的抗原表位,结合Hp-NAP二级结构、亲水性分析认为Hp-NAP是很有前景的幽门螺杆菌疫苗候选抗原。
- 罗军胡平赖建平李妍龙敏龙北国
- 关键词：幽门螺杆菌NAP克隆生物信息学
