采用AFLP技术，对35个香牙蕉品种（系）进行了鉴别与分类。从AFLP试剂盒所提供的64对引物组织中选取两对引物组合EcoR I ACC+Mse I CAT和EcoR IACC+Mse I CAG对35份香牙蕉材料进行了AFLP分析，共得到扩增位点107个，其中多态性位点84个，多态性位点比例达到78.5%，对35个品种的区分率达到100％。各品种（系）多态性带数存在差别，多态性带数量多为海南红蕉（56条），多态性比例最高为0.6667，可见其杂合程度较高；多态性带最少的为大丰1－1号（33条），其多态性比例为0.3929。各品种（系）相互之间的相似系数介于0.71-1.00，表明香牙蕉品种（系）之间遗传关系相对较近，依相似系数0.88的水平，可以将供试的35个香牙蕉品种（单株）分为6个品种群，鉴别了3个引自不同国家的品种。几内亚、苹果以及阳江矮实际上为同一个香牙蕉品种，该研究结果基于AFLP分子标记，能从分子水平上反映香牙蕉地方品种之间的亲缘关系，可以作为香牙蕉品种（系）分类的依据。
