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国家自然科技资源平台项目(2004DKA30460)

作品数:8 被引量:37H指数:3
相关作者:邢秀梅杨福合涂剑锋李一清杨颖更多>>
相关机构:中国农业科学院特产研究所中国农业科学江苏科技大学更多>>
发文基金:国家自然科技资源平台项目国家科技支撑计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 7篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 5篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 5篇控制区
  • 3篇全序列
  • 3篇线粒体
  • 3篇线粒体DNA
  • 3篇线粒体控制区
  • 2篇系统发育
  • 2篇系统发育分析
  • 2篇绿头鸭
  • 2篇马鹿
  • 2篇发育分析
  • 1篇遗传分化
  • 1篇系统进化
  • 1篇系统进化关系
  • 1篇系统进化树
  • 1篇线粒体DNA...
  • 1篇进化
  • 1篇进化树
  • 1篇MTDNA
  • 1篇MTDNA控...
  • 1篇PHYLOG...

机构

  • 6篇中国农业科学...
  • 1篇江苏科技大学
  • 1篇中国农业科学

作者

  • 7篇杨福合
  • 7篇邢秀梅
  • 6篇涂剑锋
  • 2篇鲁晓萍
  • 2篇徐佳萍
  • 2篇杨颖
  • 2篇刘琳玲
  • 2篇李一清
  • 1篇司方方
  • 1篇查代明
  • 1篇苏伟林

传媒

  • 2篇安徽农业科学
  • 1篇西北农业学报
  • 1篇草食家畜
  • 1篇吉林农业大学...
  • 1篇Agricu...
  • 1篇家畜生态学报

年份

  • 1篇2016
  • 2篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2010
  • 2篇2009
  • 1篇2006
8 条 记 录,以下是 1-8
排序方式:
基于线粒体控制区全序列的鹿亚科系统发育分析被引量:8
2012年
测定13种鹿亚科动物线粒体DNA控制区全序列,并结合从GenBank获得的12种鹿亚科动物同源序列进行分析,进一步研究鹿亚科物种的分类和系统进化。结果显示,25种鹿亚科动物线粒体控制区序列全长为914~1 072bp,个体间序列差异为0.1%~12.2%,4个属间差异为8.0%~12.2%。构建的系统发育树结果表明,马鹿分为2个不同类群,麋鹿属的麋鹿、斑鹿属的豚鹿以及黇鹿属的黇鹿与鹿属的分化处于属间差异,支持将其并入鹿属的观点,坡鹿为鹿属中最原始的种。
涂剑锋邢秀梅刘琳玲鲁晓萍杨福合
关键词:线粒体DNA控制区系统发育
中国鹿亚科动物mtDNA控制区序列差异及其遗传分化被引量:3
2012年
[目的]探讨中国鹿亚科动物的遗传分化。[方法]通过PCR直接测序的方法获得我国鹿亚科物种线粒体DNA控制区(D-loop)全序列,结合GenBank检索到的鹿亚科其他动物同源序列,用生物软件进行统计分析。[结果]我国鹿亚科动物D-loop区序列全长在921~1 072 bp,碱基T、A、C、G的平均含量分别为32.1%、30.2%、22.7%及15.0%,各物种间的遗传距离范围在0.062~0.106之间,处于属间差异。系统进化树结果表明梅花鹿、马鹿和白唇鹿亲缘关系较近,它们与水鹿构成一组进化枝,坡鹿与麋鹿构成一组进化枝,豚鹿单独构成一个进化枝。[结论]该研究支持麋鹿和豚鹿并入鹿属的观点,我国的鹿亚科动物的分化时间约为155~260万年。
涂剑锋邢秀梅徐佳萍杨颖杨福合
关键词:控制区遗传分化
Sequence Difference of Mitochondrial DNA Control Region and Genetic Differentiation of Cervinae in China被引量:1
2011年
[Objective] The study aimed at analyzing Genetic Differentiation of Cervinae. [Method] The complete mitochondrial DNA control region of five species of Cervinae was determined by direct DNA sequencing. Homologous sequences of others Cervinae were gained from GenBank, and then analyzed through biology software. [Result] The lengths of their control region were 921-1 072 bp, the nucleotide content of T, A, C, and G was 32.1%, 30.2%, 22.7% and 15.0% separately. Genetic distance of each species ranged from 0.062-0.106, which belonged to level of inter-genus. The molecular phylogenetic tree indicated that red deer, skia deer and White-lipped Deer had close relationship, and they constituted one branch with sambar deer. Eld's deer and elk deer constituted the second branch, and hog deer constituted the third branch alone. [Conclusion] Hog deer and fallow deer should be incorporated in Cervus, divergence time is about 1.55-2.60 million years among Cervinae in China.
涂剑锋邢秀梅徐佳萍杨颖杨福合
关键词:PHYLOGENY
基于线粒体控制区全序列的鹿亚科系统发育分析
测定了13种鹿亚科动物线粒体DNA控制区全序列,并结合从GenBank获得的12种鹿亚科动物同源序列进行分析。结果显示:25种鹿亚科动物线粒体控制区序列全长在914 072之间,个体间序列差异范围在0.1%2.2%,4个...
涂剑锋邢秀梅刘琳玲鲁晓萍杨福合
关键词:线粒体DNA控制区系统发育
文献传递
基于线粒体控制区序列分析我国马鹿亚种的系统进化关系被引量:1
2010年
测定了6个马鹿亚种和左家型马鹿线粒体控制区全序列,并结合GenBank中四川和西藏马鹿亚种序列进行分析。结果显示:马鹿亚种的控制区序列长度在916~995bp之间,碱基A+T含量明显高于G+C,发现117个多态位点和长为37~39 bp重复单元,平均核苷酸多样度为0.0478,这些表明我国马鹿亚种间控制区遗传多样性较为丰富。通过邻接法和最大似然法构建马鹿系统进化树,其结果表明:我国马鹿亚种明显分为两个进化枝,亚种间的进化关系与其地理位置密切相关。
涂剑锋杨福合邢秀梅查代明李一清
关键词:马鹿线粒体控制区系统进化
马鹿线粒体DNA序列多态性分析被引量:18
2006年
采用聚合酶链式反应(PCR)技术对40只马鹿mtDNA细胞色素b序列进行扩增,对所得PCR产物测序,测得405 bp的核甘酸片段序列,统计分析了6个品种或类型间的遗传关系,通过遗传关系建立了系统发育树。结果表明:天山马鹿和东北马鹿的亲缘关系较近,塔里木马鹿同天山马鹿、阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、东北马鹿、左家马鹿的亲缘关系较远,塔里木马鹿和天山马鹿的亲缘关系最远。将6个马鹿品种(或类型)重新划分为4大类群:东北马鹿和左家马鹿为一类,天山马鹿和阿尔泰马鹿为一类,塔里木马鹿为一类,甘肃马鹿为一类。
邢秀梅杨福合苏伟林李一清
关键词:马鹿MTDNA
绿头鸭线粒体DNA控制区全序列测定及分析被引量:1
2009年
用PCR产物直接测序法,获得5只绿头鸭线粒体DNA控制区(D-loop)全序列。序列分析显示:绿头鸭D-loop区全长为1051bp,碱基A、G、T、C含量分别为27.97%、15.51%、25.21%、31.30%,A+T含量大于C+G;共检测到11个多态位点,其中转换10个,颠换1个,没有发现插入和缺失,核苷酸多样度为0.0046。结合GenBank已公布河鸭属鸭类D-loop区序列,基于邻接法和最小进化法构建河鸭属鸭类系统进化树。结果表明,绿头鸭、斑嘴鸭及家鸭三者关系密切,它们共同构成进化枝A,推测在家鸭的形成过程中,绿头鸭和斑嘴鸭都作出了贡献;其它河鸭类聚为进化枝B。
涂剑锋司方方邢秀梅杨福合
关键词:绿头鸭D-LOOP区
绿头鸭线粒体ND2基因全序列测定及其研究被引量:5
2009年
[目的]分析绿头鸭的系统进化关系。[方法]用PCR产物直接测序的方法,测得4只绿头鸭线粒体ND2基因全序列,结合Gen-Bank中已公布河鸭属野鸭ND2基因全序列,基于N-J法和MP法构建河鸭属野鸭系统进化树。[结果]4只绿头鸭ND2基因序列完全一致,其全长为1 041 bp,碱基A、G、T、C含量分别为28.91%、13.35%、20.75%和36.98%,A+T含量约等于C+G;绿头鸭ND2基因序列与斑嘴鸭完全相同,与其他野鸭的同源性较高。系统进化树结果表明,绿头鸭与斑嘴鸭关系密切,两者共享一个单倍型,它们与棕颈鸭、针尾鸭及绿翅鸭同属于进化枝A。[结论]家鸭可能由绿头鸭和斑嘴鸭驯化而来。
涂剑锋司方方邢秀梅杨福合
关键词:绿头鸭系统进化树
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