国家自然科学基金(U1036601) 作品数:8 被引量:79 H指数:5 相关作者: 何彪 涂长春 张海林 张富强 胡挺松 更多>> 相关机构: 军事医学科学院 成都军区疾病预防控制中心 云南省地方病防治所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 中美新发和再发传染病合作项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
云南一种新型蝙蝠博卡病毒的鉴定与分析 被引量:3 2016年 目的进一步发现云南新型蝙蝠病毒,并鉴定云南省蝙蝠携带博卡病毒(bocavirus)的遗传多样性。方法对采自景洪市的26只三叶蹄蝠进行了病毒宏基因组学分析,根据其结果对博卡病毒进行了PCR检测和全基因分析。结果与结论根据检测结果,从3只(11.5%)蝙蝠的肠道中发现了一种新型博卡病毒;通过全基因组扩增和分析,发现该病毒全长5203 nt,编码NS1、NP和VP1/VP2蛋白,分析显示该病毒NS1和VP1基因分别与博卡病毒代表种犬博卡病毒(canine bocavirus)1和犬微小病毒(canine minute virus)有最高的氨基酸序列相似性,达到58.7%和53.3%。依据国际病毒分类委员会病毒新种判断标准,NS1蛋白基因氨基酸序列相似性低于85%,为博卡细小病毒属新种,因而该病毒是一新博卡病毒种;该研究为进一步了解我国蝙蝠携带病毒的多样性提供了参考,同时为研究博卡病毒的宿主范围和进化关系提供了重要的基础数据。 李兴宇 陈刚 夏乐乐 周卫国 徐琳 余静 邱薇 张富强 范泉水 涂长春 胡挺松 何彪关键词:蝙蝠 博卡病毒 进化分析 1株蝙蝠来源细小病毒的分离鉴定 被引量:3 2014年 目的对1株蝙蝠来源病毒进行分离鉴定,进行简单的基因分析。方法从云南沧源县8个居民地附近捕获50只棕果蝠并制作组织标本,采用细胞培养分离病毒,采用cDNA-RAPD方法扩增序列,采用分子克隆进一步扩增序列,将序列在NCBI上进行BLAST比对,采用DNAMAN5.0进行同源性分析,采用MEGA 5建序列进化树。结果 50份接毒细胞中,6份细胞出现细胞病变,cDNA-RAPD扩增得到1份阳性片段,测序大小为614 bp,经比对该病毒株是细小病毒科细小病毒亚科博卡病毒属牛细小病毒种的一个毒株。结论成功分离并鉴定该毒株,确定该病毒是牛细小病毒的一个新的基因型。 陈刚 马俊兴 邱薇 梁栋 张富强 袁贵红 闫芳 胡挺松 范泉水关键词:蝙蝠 细小病毒 基因型 云南蚊虫中阿卡斑病毒的分离和鉴定 被引量:16 2015年 为掌握云南省德宏州芒市和瑞丽市蚊媒病毒分布状况,2010年8月用诱蚊灯采集蚊虫17种2 149只,用金黄地鼠肾细胞(Baby hamster kidney cell,BHK-21)培养法分离病毒,阳性分离物用阿卡斑病毒(Akabane virus,AKV)S和M片段特异性引物的RT-PCR法鉴定。从采集蚊虫中分离到能引起BHK-21细胞病变和致乳小白鼠发病死亡的2株病毒,其中DHL10M110株分离自瑞丽市迷糊按蚊(Anopheles vagas),DHL10M117株分离自芒市三带喙库蚊(Culex tritaeniorhynchus)。RT-PCR扩增获得S片段的702bp序列和M片段的456bp序列,系统进化树分析表明DHL10M110和DHL10M117株与肯尼亚和澳大利亚AKV分离株进化关系较远;与日本、韩国和中国台湾的AKV分离株亲缘关系较近,但云南株形成一个独立的小分支。2株新分离病毒的S片段与中国台湾CY-77株的核苷酸(96.6%和96.7%)和氨基酸(99.6%和100%)同源性最高;M片段与日本Iriki株的核苷酸同源性最高(93.2%和93.6%),与中国台湾CY-77株氨基酸同源性最高(99.6%和100%);与肯尼亚MP496株核苷酸(69.7%和70.0%)和氨基酸(91.0%)同源性最低。本研究证实云南省德宏州存在AKV的流行,与亚洲流行株具有较近的亲缘关系。三带喙库蚊和迷糊按蚊可传播该病毒。 冯云 何彪 付士红 杨卫红 章域震 涂长春 梁国栋 张海林关键词:蚊虫 系统进化树 同源性分析 云南省蝙蝠携带重要人兽共患病相关病毒病原的研究进展 被引量:7 2017年 蝙蝠是一些重要病毒的自然储存宿主。2010-2015年调查研究表明,云南省蝙蝠中广泛存在SARS样冠状病毒(SARS-like CoV)和其它多种类型冠状病毒(α-CoV和β-CoV)的自然感染,还从蝙蝠中分离或检测到新的呼肠孤病毒(Reovirus)、轮状病毒(Rotavirus)、肝炎病毒(Orthohepadnavirus)、丝状病毒(Filovirus)、副粘病毒(Paramyxovirus)、腺病毒(Adenovirus)、博卡病毒(Bocavirus)和圆形病毒(Circovirus)。本文对云南省自然界蝙蝠携带重要人兽共患病相关病毒病原的研究进展及其公共卫生意义做一综述。 张海林 张富强 胡挺松 余静 范泉水关键词:蝙蝠 病毒 储存宿主 云南省登革病毒血清型和基因型多样性及溯源研究 被引量:19 2017年 目的 阐明2013-2015年云南省登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株的血清型、基因型及传播来源.方法 从云南省登革热患者急性期血清中提取病毒核酸,通过RT-PCR扩增DENV包膜蛋白(Envelope protein,E)基因序列,采用Clustal X、DNAStar和MEGA5生物信息学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列同源性分析及系统进化分析.结果 经RT-PCR和序列测定获得了2013-2015年云南省40株DENV的E基因序列,系统进化和同源性分析表明,15株属于DENV血清型1型(DENV-1),其中14株(瑞丽市11株,临沧市1株,昆明市2株)为基因Ⅰ型(Genotype-Ⅰ,G-Ⅰ),1株(昆明)为G-V;22株属DENV血清型2型(DENV-2),其中瑞丽市10株为G-Ⅰ,西双版纳12株为G-Ⅳ;2株(西双版纳)属DENV血清型3型(DENV-3)的G-Ⅱ;1株(瑞丽市)属DENV血清型4型(DENV4)的G-Ⅰ,这些基因型均是东南亚地区的优势基因型.所有云南株DENV均与缅甸、老挝和泰国等东南亚流行株具有较高的同源性和较近的亲缘关系.结论 2013-2015年云南省存在DENV四种血清型及其多种基因型的流行.云南省登革热的传播来源主要为相邻的东南亚国家.应加强云南省边境地区输入性病例的监测和管理. 冯云 张海林 潘虹 范建华 刘永华 李鸿斌 尹小雄 朱进 李华昌 黄瑛关键词:登革病毒 E基因 血清型 基因型 系统进化分析 Detection and characterization of diverse alpha-and betacoronaviruses from bats in China 被引量:6 2016年 Bats have been implicated as important reservoir hosts of alpha- and betacoronaviruses. In this study, diverse coronaviruses(CoVs) were detected in 50 of 951(positive rate 5.3%) intestinal specimens of eight bat species collected in four provinces and the Tibet Autonomous Region of China by pan-coronavirus RT-PCR screening. Based on 400-nt RNA-dependent RNA polymerase(Rd RP) sequence analysis, eight belonged to genus Alphacoronavirus and 42 to Betacoronavirus.Among the 50 positive specimens, thirteen gave rise to CoV full-length Rd RP gene amplification for further sequence comparison, of which three divergent sequences(two from a unreported province) were subjected to full genome sequencing. Two complete genomes of betacoronaviruses(JTMC15 and JPDB144) and one nearly-complete genome of alphacoronavirus(JTAC2) were sequenced and their genomic organization predicted. The present study has identified additional numbers of genetically diverse bat-borne coronaviruses with a wide distribution in China. Two new species of bat CoV, identified through sequence comparison and phylogenetic analysis, are proposed. Lin Xu Fuqiang Zhang Weihong Yang Tinglei Jiang Guanjun Lu Biao He Xingyu Li Tingsong Hu Gang Chen Yun Feng Yuzhen Zhang Quanshui Fan Jiang Feng Hailin Zhang Changchun Tu关键词:病毒学 药物学 蝙蝠病毒研究进展 蝙蝠作为世界上哺乳动物中的第二大类,因其能携带多种人兽共患病毒而在病原生态学上具有重要的意义。蝙蝠种类多、分布广,具有长距离飞翔能力,这些特性使得蝙蝠易于将病毒传播给人类和其他动物,同时蝙蝠冬眠、种群数量大,使得蝙蝠可以... 何彪 涂长春关键词:蝙蝠 文献传递 SV40 LT抗原介导的蝙蝠胎儿肾细胞永生化 被引量:1 2014年 蝙蝠是许多新发人兽共患病病毒的自然储存宿主,由于缺乏蝙蝠细胞系,只能利用其他哺乳动物细胞系来分离蝙蝠病毒,因此成功分离的几率较低。为建立稳定的蝙蝠细胞系,本研究利用胰酶消化法培养东亚水鼠耳蝠(Myotis petax)的胎儿原代肾细胞。利用重组逆转录病毒转导法将SV40 LT抗原基因转导入蝙蝠胎儿原代肾细胞,经嘌呤霉素筛选获得LT基因整合和表达的阳性细胞,并进行连续传代培养。RT-PCR和western blot检测表明转导的细胞中有SV40 LT基因的整合和表达。转导细胞在软琼脂中培养不能够形成克隆,表明其未发生癌性转化。对第33代的转导细胞进行单细胞克隆,获得了3个衍生的细胞系,其中Mp-Ki03细胞系已培养至第60代。病毒感染试验表明蝙蝠西江病毒和蝙蝠轮状病毒均可以感染该转导细胞系。本研究通过SV40 LT抗原建立了永生化的蝙蝠胎儿肾细胞系,并且该细胞系对蝙蝠病毒易感,对分离与鉴定蝙蝠病毒以及研究病毒感染蝙蝠细胞的机制具有重要的作用。 张思春 杨凡力 余乐 何彪 涂长春关键词:蝙蝠 肾细胞 SV40 永生化 病毒宏基因组学的研究现状及应用 被引量:29 2012年 病毒宏基因组学(Metagenomics)是一种新兴的病毒组学研究技术,它突破了传统技术方法的局限,而直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,可以快速地鉴定出环境中所有的病毒组成,从而是一种发现新病毒,监控病毒变异的分子流行病毒学研究的有力手段。在短短的几年里,人们用这种方法发现了很多有意义的病毒,并扩大了很多病毒的宿主范围,增强了人们对环境中包括各种媒介生物的病毒组成的了解,研究领域涉及到人类肠道、动物组织、血液、水体等,充分显示出其在病毒发现、病原溯源、微生物预警等方面的实用意义。笔者在本文中简要介绍了病毒宏基因组学的进展及应用前景。 何彪 涂长春关键词:高通量测序 蝙蝠病毒研究进展 蝙蝠作为世界上哺乳动物中的第二大类,因其能携带多种人兽共患病毒而在病原生态学上具有重要的意义。蝙蝠种类多、分布广,具有长距离飞翔能力,这些特性使得蝙蝠易于将病毒传播给人类和其他动物,同时蝙蝠冬眠、种群数量大,使得蝙蝠可以... 何彪 涂长春关键词:蝙蝠