国家重点基础研究发展计划(2010CB134505)
- 作品数：11 被引量：64H指数：5
- 相关作者：张利莉夏占峰关统伟张飞万传星更多>>
- 相关机构：塔里木大学新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室中国科学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 拜城盐山免培养放线菌多样性研究被引量：2
- 2012年
- [目的]研究新疆拜城盐山高盐环境中的放线菌多样性,为今后的开发和利用奠定基础。[方法]应用基于16S rRNA基因序列的免培养技术和系统发育分析方法对拜城盐山样品中的放线菌多样性进行研究。采用SDS-CTAB方法提取样品中的总DNA,利用特异性引物扩增样品DNA中的放线菌16S rRNA基因,并构建放线菌16S rRNA基因克隆文库;通过比较酶切图谱,挑选克隆文库中的代表克隆,进行序列测定和BLAST比对分析。[结果]构建的放线菌克隆文库共包含216个放线菌克隆。克隆序列经过BLAST比对分析,放线菌亚纲中的克隆有171个,占总克隆数的79.2%。酸微菌亚纲45个克隆,占总克隆数的20.8%,与GenBank中已知的微球菌16S rRNA基因序列最大相似度小于92%,是酸微菌亚纲中新的类群。优势放线菌为放线菌亚纲棒杆菌亚目诺卡氏菌科(Nocardiaceae)的红球菌属(Rhodococcus),占克隆总数的51.9%。有24.5%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。[结论]拜城盐山存在着较为丰富的放线菌种类,并且潜藏着新类型的放线菌资源。
- 周慧杰周慧杰夏占峰张娇张瑶张利莉
- 关键词：放线菌多样性
- 新疆红井子盐碱土壤非培养放线菌多样性被引量：9
- 2012年
- 【目的】研究新疆红井子盐碱土壤中的放线菌物种多样性。【方法】应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法进行放线菌物种多样性分析。利用放线菌特异性引物,以土壤样品总DNA为模板,扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库,并对文库中的插入序列进行RFLP分析。【结果】随机挑选的246个阳性克隆通过酶切筛选出61个不同图谱的重组克隆并测序。分析结果显示这61个克隆序列分属于42个OTUs,分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae);该环境中有71.4%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,代表着放线菌新类群,其中部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表更高级的新分类单元。【结论】红井子土壤中的放线菌组成具有丰富的多样性,并有新放线菌分类单位的潜在资源,值得进一步进行开发研究。
- 贾晓宇贺江舟关统伟孙红专夏占峰张利莉
- 关键词：盐碱土放线菌多样性系统发育
- 塔里木盆地5个生态小区稀有放线菌分离及合成抗生素基因分布被引量：4
- 2018年
- 为调查塔里木盆地5个代表性生态小区的稀有放线菌分布,并评估它们产生抗生素类活性物质的潜力。采集塔里木盆地5个生态小区混合土样5份,采用7种培养基分离样品中的稀有放线菌。通过检测分析I型PKS、Ⅱ型PKS、NRPS、APH、HMG-CoA五种抗生素合成相关基因的分布,评估该地区稀有放线菌产生抗生素的潜力。结果表明:(1)基于分子鉴定,经合并重复,共分离得到18种稀有放线菌,属于放线菌的10个属。(2)塔里木河河岸林生态小区土样稀有放线菌分离种类最多(10种),为8个属,塔克拉玛干沙漠塔里木河东部生态小区最少(4种),为4个属。(3)18株稀有放线菌中有9株含有I型PKS基因、4株菌含有Ⅱ型PKS基因、4株菌含有APH基因、3株菌含有NRPS基因,有一株链孢囊菌同时含有I型PKS、Ⅱ型PKS、NRPS、APH 4种基因。5个生态小区稀有放线菌种类较多,并含有较为丰富的与抗生素合成相关的基因。
- 朱荣贵关统伟姜秀娟
- 关键词：塔里木盆地生态小区稀有放线菌功能基因筛选
- 胡杨林土壤放线菌TRM 43006分类鉴定及其次级代谢产物研究
- 2015年
- 对一株分离自和田地区胡杨林土壤且具有较好抗菌活性的放线菌TRM 43006进行了分类鉴定及次级代谢产物研究。经菌落形态和显微结构观察,该菌株具有链霉菌的典型特征;经16S r DNA序列比对分析,该菌与玫瑰丁香链霉菌(Streptomyces roseolilacinus)NBRC 12815(T)最大相似度为98.64%,初步判断该放线菌为链霉菌属的潜在新种;应用大孔树脂富集、硅胶柱色谱、Sephadex LH-20凝胶柱色谱等方法对该菌株代谢产物进行分离纯化,获得3个化合物,通过1D&2D NMR波谱数据分析,鉴定化合物结构分别为β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛(1)、邻苯二甲酸二(2-乙基)已酯(2)、13-甲基肉豆蔻酸(3),均首次从链霉菌分离获得,其中化合物(3)对表皮葡萄球菌生物膜形成具有较强抑制作用。
- 孙勇万传星张利莉
- 关键词：STREPTOMYCES次级代谢产物
- 艾丁湖沉积物放线菌多样性被引量：22
- 2011年
- 【目的】为了研究新疆艾丁湖低海拔、高盐环境中的放线菌多样性。【方法】本研究应用基于16S rRNA基因序列系统发育分析的免培养方法和选择性分离培养方法相结合的方式对艾丁湖沉积物样品进行放线菌多样性分析。利用放线菌特异性引物扩增16S rRNA基因并构建了16S rRNA基因克隆文库,对文库中的插入序列进行RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism限制性片段长度多态性)分析。采用不同盐浓度的9种选择性培养基分离样品中的放线菌。【结果】通过对16S rRNA基因克隆文库分析,273个克隆分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae 208个)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae 13个)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae 52个)。该环境中优势放线菌为微球菌科的罗斯氏菌属(Rothia),占到克隆总数的37%。有45.8%的序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,部分序列形成了几个独立的进化分支,可能代表着放线菌新的类群。通过分离培养,共得到55株放线菌,分布在放线菌目的6个亚目中,以链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)为主要类群。有6株菌的16S rRNA基因序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,为潜在的放线菌新分类单元。【结论】研究表明,艾丁湖中的放线菌具有较高的多样性,并蕴藏着多种新类型,有进一步研究价值。
- 夏占峰关统伟阮继生黄英张利莉
- 关键词：放线菌多样性
- DNA提取方法对盐环境放线菌多样性分析的影响被引量：6
- 2013年
- 【目的】研究DNA提取方法对盐环境中放线菌的16S rDNA RFLP(Restriction Fragment LengthPolymorphism,限制性片段长度多态性)多样性分析结果的影响。【方法】采用CTAB-SDS法、玻璃珠法和反复冻融法3种方法提取焉耆盐场土壤样品DNA,利用放线菌特异性引物扩增16S rDNA并分别构建文库。采用HaeⅢ限制性内切酶对阳性克隆进行RFLP分析,选取不同的克隆进行测序、比对并构建16S rDNA序列系统发育树。【结果】3种DNA提取方法构建的16S rDNA克隆文库OTUs-(Operational Taxonomic Unit)数不同,其中CTAB-SDS法获得35个OTUs,玻璃珠法获得19个OTUs,反复冻融法获得14个OTUs。3种方法中有52%的OTUs序列与已知可培养的放线菌或未发表的克隆子序列相似性较低,可能代表着放线菌新的类群;3种方法得到的放线菌均分布于放线菌纲(Actinobacteria)的放线菌亚纲(Actinobacteridae)、酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)和红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)。【结论】DNA提取方法是影响评价放线菌多样性的重要因素。本研究所采用的DNA提取方法各自存在一些优缺点,因此评估盐环境中的微生物多样性时建议采用几种方法组合。而焉耆盐场这一盐环境可能存在丰富的放线菌物种多样性,并蕴藏着新的分类单元有待进一步研究。
- 张娇夏占峰贺江舟孙红专张利莉
- 关键词：DNA提取克隆文库放线菌多样性
- 响应面法优化棉花黄萎菌拮抗放线菌TRM42561菌株发酵条件研究被引量：1
- 2013年
- 应用响应面法对棉花黄萎菌拮抗放线菌TRM42561菌株的发酵条件进行优化。首先通过Plackett-Burman设计对影响抑菌活性的8因素进行筛选,获得两个关键因素:转速(X1)、玉米粉与蛋白胨(X2)。然后利用最陡爬坡试验逼近最大响应区域,并结合中心组合试验以及响应面分析法,建立了以对棉花黄萎菌抑菌圈直径为响应值的二次回归方程,即Y=-4036+31.5 X1+1014 X2-0.777 X1.X2-0.0796 X12-196 X22,该模型预测最大抑菌圈直径为33.52 mm。从中获得最佳发酵条件:玉米粉16.6 g·L-1,蛋白胨5.6 g·L-1,葡萄糖20 g·L-1,氯化钠40 g·L-1,碳酸钙1 g·L-1,转速187 r·min-1,初始pH 6.0,接种量6%,装液量80 mL/250mL,温度36℃。采用此发酵条件,供试菌抑菌圈直径达到33(±0.20)mm,与预测值基本相符。说明预测模型准确可靠,响应面分析法可用于TRM42561菌株发酵条件的优化。
- 柳成宾李艳宾张飞张利莉
- 关键词：放线菌拮抗棉花黄萎菌发酵条件优化响应面法
- 新疆盐环境棉花黄萎菌拮抗放线菌的筛选及菌株TRM42561的防效测定和鉴定被引量：15
- 2014年
- 为充分发掘新疆盐环境中生防活性放线菌,以棉花黄萎菌为靶标,从805株新疆盐环境放线菌中筛选获得14株拮抗菌,其中菌株TRM42561抑菌活性最强,其发酵液对棉花黄萎菌的抑菌圈直径达26.33 mm,且对6种常见植物病原真菌和4种细菌均有较好的抑制效果,抗菌谱广。室内抑菌活性表明,拮抗菌TRM42561发酵液对棉花黄萎菌菌丝生长抑制率为83.75%,孢子萌发抑制率为68.75%。田间试验结果表明,拮抗菌TRM42561对棉花黄萎病的田间防治效果显著,在3次施药后的第15和30 d,其防治效果分别达到33.06%和41.65%。通过菌株形态特征、培养特性、生理特性以及16S rDNA序列分析,确定拮抗菌TRM42561为娄彻氏链霉菌Streptomyces rochei。
- 柳成宾万传星贾晓宇张飞徐彪范瑛阁张利莉
- 关键词：拮抗放线菌棉花黄萎菌生物防治
- 携带NRPS基因的新疆嗜盐放线菌抑菌活性筛选
- 2014年
- 为了筛选具有抗生素产生潜能的放线菌菌株,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),表皮葡萄球菌(Staphylococcus pidermidis),大肠杆菌(Escherichia coli),白色念珠菌(Candida albican),热带念珠菌(Candida tropicalis)和克柔氏念珠菌(Candida krusei)为靶标菌,采用牛津杯法对48株携带NRPS基因的放线菌发酵液甲醇和乙酸乙酯萃取相进行了抑菌活性筛选。结果表明:共有18株菌表现出抑菌活性,其中抗金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的有15株,抗白色念珠菌的有10株,抗大肠杆菌的有3株;18株菌分属于放线多孢菌属(Actinopolyspora),拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)和链霉菌属(Streptomyces);且18株菌中有16株含有两种以上抗生素合成基因。菌株发酵液抗G+细菌的抑菌活性部位在乙酸乙酯萃取相中,抗白色念珠菌和大肠杆菌的抑菌活性部位在甲醇相中。
- 张飞吕玲玲万传星张利莉
- 关键词：放线菌NRPS抗菌活性筛选
- 新疆硝尔库勒盐湖放线菌分离方法的初步研究被引量：3
- 2012年
- 为了研究新疆硝尔库勒盐湖中的放线菌多样性,以微生物抗高渗透压的生理机制为指导,结合盐湖高盐、寡营养的特点,设计了含有在嗜盐微生物细胞中起渗透调节作用的多种碳源和氮源的分离培养基,以TP培养基、GW1培养基和F6培养基为对照,对新疆硝尔库勒湖沉积物样品进行分离。结果表明,海藻糖-肌酸培养基(B3)分离效果最好,能分离到10个属16个不同种的放线菌;海藻糖-天冬氨酸培养基(B1)和海藻糖-谷氨酸培养基(B2)分离效果次之,均能分离到5个属7个不同种的放线菌,并有2个潜在的放线菌新物种被发现(菌株编号为41376、41293)。这说明以渗透调节物作为碳源和氮源是高盐环境放线菌分离比较理想的选择,为以后高盐环境微生物的分离培养提供了理论指导。
- 陈正军关统伟张利莉
- 关键词：放线菌
