福建省科技计划重点项目(2008H0026)
- 作品数：12 被引量：13H指数：2
- 相关作者：刘秉瀚郭红朱敏琛李小梅吴恩生更多>>
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- 发文基金：福建省科技计划重点项目福建省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 基因表达数据的模糊聚类技术研究被引量：2
- 2010年
- 利用聚类分析工具可以从海量的、日益增长的基因表达数据中解析出其中可能的编码基因及其生理功能,这是生物信息学中一项很有意义的工作。模糊聚类算法是一种常用的基因表达数据聚类分析工具,可以发现重叠的基因簇,它不强制将每个基因归入某个具体的聚类中,而是计算每个基因对各个类的隶属度。本文分析了基因表达数据的模糊聚类分析方法及其重要应用。
- 李小梅郭红
- 关键词：生物信息学基因表达数据模糊聚类
- 基于实数结构元素的多角度边缘检测算法
- 2011年
- 由于传统的边缘提取方法如Sobel、Robert、Prewitt、Log和Canny等对噪声十分敏感,而基于传统数学形态学的边缘检测算法又不能很好地利用空间信息,很难对复杂边界进行有效的处理.本文提出基于实数结构元素的多角度边缘检测算法,该算法可以充分地反映空间距离以及各个角度对边缘检测的影响.最后通过实验说明该算法在复杂图像的边缘提取中不仅有很强的抗噪性,而且可以有效地提取图像边缘.
- 洪宗辉刘秉瀚
- 关键词：数学形态学边缘检测
- 一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法被引量：1
- 2011年
- 针对基因间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法的不足,提出一种基于广义信息论中二次互信息的广义相似性度量标准QMISM,并利用免疫遗传算法将高维样本映射到二维空间,进而实现动态模糊聚类和聚类结果可视化.对人工合成数据和真实的基因表达数据的实验结果表明,该算法能得到更好的聚类结果.
- 李小梅郭红吕暾
- 关键词：免疫遗传算法
- 基于微分进化的加权模糊C均值图像分割方法被引量：2
- 2010年
- 提出基于微分进化和加权模糊C均值的图像分割方法.鉴于加权模糊C均值算法对初始值敏感、容易陷入局部最优的缺点,采用微分进化进行全局寻优,能够找到全局最优的模糊划分;考虑到欧氏距离的局限性,实验中引入特征距离,改善了图像分割效果.实验结果表明,该方法的收敛速度更快、稳定性更好,所获得的适应度值更高.
- 陈育玲刘秉瀚
- 关键词：微分进化图像
- 一种确定肿瘤重要基因信息的有效算法
- 2010年
- 肿瘤基因微阵列数据对于肿瘤诊断具有重要意义,由于基因数据具有数据样本少、基因维数高的特点,传统的分类器方法在样本数量不足或远远小于属性维数的情况下,易于陷入"过学习",分类精度较低。本文采用T-test选取获选基因,选取分布差异较大的基因,剔除无关基因,提高实验的整体效率;将支持向量机SVM的惩罚因子加入粒子群算法PSO的粒子编码,PSO同时对候选基因组和SVM参数进行搜索,减少SVM参数的不确定性,以此得到更精确的基因标签,确定好的分类因素。文章最后验证了算法的有效性。
- 康雨生郭红
- 关键词：微阵列T-TESTPSOSVM
- 一种融合局部与全局信息的距离约束角点匹配算法被引量：2
- 2010年
- 图像匹配技术在众多领域中都有重要应用。针对既有平移又有旋转的情形,提出了基于距离约束的角点匹配方法,首先利用角点值进行匹配点对的粗选,然后利用局部角点间距离及全局角点间距离结合进行匹配点对的选取。实验结果表明,该方法可以实现无误匹配的匹配点对,准确性高,对噪声具有一定鲁棒性,且由于匹配过程中主要利用两点间的距离关系,而不需要进行复杂的运算,所以匹配时间大幅减少,在现实中有一定的实用性。
- 吴恩生朱敏琛
- 关键词：特征点提取角点匹配图像拼接
- 基于模糊理论的混沌变异粒子群算法被引量：1
- 2009年
- 针对粒子群算法易陷入局部极值的缺点,将模糊理论和混沌理论引入粒子群算法,进行模糊混沌变异,增加种群的多样性,以解决粒子群的早熟问题.利用模糊理论对粒子群建模并对处于α-截集中的粒子以概率的方式混沌变异,该概率和混沌变异的步长分别随着隶属度和粒子群迭代的代数的变大而变大,而α是随着平均适应度的减小而增大.数值仿真实验表明该方法能较好解决早熟问题,具有较好的全局搜索能力,提高了计算精度.
- 黄信想刘秉瀚
- 关键词：粒子群
- 基于监督学习的核拉普拉斯特征映射分类方法被引量：3
- 2011年
- 提出一种监督学习的核拉普拉斯特征映射方法(supervised kernel Laplacian eigenmap,SKLE),通过非线性核映射将样本数据投影到高维核特征空间,然后将流形结构和样本类别信息进行有效的结合后,提取嵌入在高维数据中的低维流形特征用于分类.实验表明,该方法对新样本具有泛化性,并且能有效提高分类的效能.
- 张建波朱敏琛
- 关键词：拉普拉斯特征映射流形学习核方法
- 一种采用自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法
- 2011年
- 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的重要组成部分。搜索算法和评分函数是当前分子对接研究的难点与热点。本文提出了一个基于自适应免疫遗传算法的分子对接构象搜索方法AutoDockAIGA。设计了基于自适应免疫遗传算法的构象搜索方法,运用此方法对蛋白质-配体复合物进行实验测试,实验结果与AutoDock3.05模拟退火算法和拉马克遗传算法在能量得分、对接精度和对接时间上进行对比分析,实验表明,AutoDockAIGA对接结果精确性高,收敛速度快,具有更高的寻优能力。
- 傅兵郭红
- 关键词：免疫遗传算法分子对接
- 一种混合编码的差分演化算法应用于特征选择问题
- 2010年
- 针对特征选择问题,引入一种具有混合编码的二进制差分演化算法,融合随机和优选两种方法自适应对特征子集个数进行控制,并在评价函数中引入权重和相关性抑制.利用淋巴瘤细胞核形态特征进行实验,结果表明该方法能有效进行特征选择.
- 吕月坪刘秉瀚
- 关键词：差分演化算法
