国家自然科学基金(20773136)
- 作品数：3 被引量：5H指数：2
- 相关作者：王建平王桂秀赵娟蔡开聪更多>>
- 相关机构：中国科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院“百人计划”中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- β-二肽的红外光谱研究
- 用β-homoalanine dipeptide为模型分子,利用量子化学计算和Morse势拟合的方法,研究了酰胺-Ⅰ带的谐性及非谐性振动特性与分子构象的关系。研究发现,两个模式的频率与结构的相关图不同,但每个模式的非谐性...
- 赵娟王建平
- 关键词：红外MORSE势
- 文献传递
- Aβ体片段分子动力学模拟研究
- 阿尔茨海默病是老年人常见的神经系统变性疾病,是痴呆中最常见的一种类型。目前认为淀粉样β-蛋白质(AmyloidβProtein,Aβ体)的异常沉积是阿尔茨海默病主要发病机制之一。Aβ片段是一种含有11个氨基酸残基的蛋白质...
- 郭扬眉蔡开聪王建平
- 关键词：分子动力学模拟
- 文献传递
- Anharmonic Vibrational Signatures of DNA Bases and Watson-Crick Base Pairs被引量：3
- 2009年
- Gui-xiu Wang Xiao-yan Ma Jian-ping Wang
- 关键词：碱基对克里克沃森静电相互作用
- 含有非天然氨基酸的三肽分子构象的酰胺-I带研究
- 研究了非天然氨基酸Pra分子中C=O基团在不同溶剂环境中的红外吸收峰变化。利用红外光谱实验、量子化学计算及分子动力学模拟等手段研究了一种含Pra的三肽分子(Ac-Pra-Pra-NH
- 韩晨王建平
- 关键词：非天然氨基酸红外光谱分子动力学模拟
- 文献传递
- 凝聚相中线性邻二醇和二硫醇分子的动态结构
- 利用分子动力学模拟比较研究了1,2-乙二醇和1,2-乙二硫醇在CCl中的骨架构象和分子内氢键动力学,并对其所含的一对O-H或S—H伸缩振动频率及其分布进行了预测。
- 王建平
- 关键词：二醇二硫醇分子动力学模拟
- 文献传递
- 乙醇醛的分子动态结构被引量：1
- 2009年
- 以量子化学计算作为起点,为最简单的糖类分子——乙醇醛开发了两套分子力学力场参数:基于肽类的力场和基于醛类的力场.分子动力学模拟结果表明,所开发的类醛力场参数能够较好地描述乙醇醛分子在水中的结构以及水分子在其周围的分布.通过瞬时简正模式分析,得到了3N-6个模式的瞬时振动频率和振动跃迁偶极矩等振动光谱参数的统计分布及其相关性.结合量子化学计算和分子动力学模拟对生物分子体系的多元振动光谱参数进行预测和评估,为从化学键水平出发模拟宽带飞秒二维红外相关光谱提供了一个新方法.
- 蔡开聪王建平
- 关键词：分子动力学模拟红外光谱
- Aβ体片段的IR光谱与分子动力学模拟研究
- 淀粉样β-蛋白质(AmyloidβProtein,Aβ体),是一种产生在人脑中的非正常聚集体,Aβ体以多肽链间的β折叠形成纤维状沉积物与阿尔茨海默氏病的发生有关。我们拟通过研究蛋白质自身的骨架振动模式酰胺-Ⅰ带的傅里叶变...
- 郭扬眉蔡开聪王建平
- 关键词：FTIR分子动力学模拟
- 文献传递
- DNA Watson-Crick碱基对的非谐性相互作用
- 量子化学从头算方法结合振动二阶微扰理论使我们对DNA的Watson-Crick配对中分子内和分子间相互作用有了新的认识。研究发现,参与氢键或邻近的N—H和C=O等基团的伸缩振动频率与单体相比发生明显红移,其对角和非对角非...
- 王桂秀王建平
- 文献传递
- 甘氨酸较高振动激发态的特征
- 红外光谱是研究肽分子结构动力学的一个重要手段。本文利用振动自洽场方法结合密度泛函电子结构理论计算了甘氨酸振动模式的基频、倍频和二倍频的红外光谱特征。同时,我们计算了从基态到第一、第二和第三激发态的振动跃迁偶极矩,分析了高...
- 孟阔王建平
- 关键词：红外光谱
- 文献传递
- NH伸缩振动与β-二肽的构象关系研究
- ＜正＞振动光谱如红外光谱被广泛用于生物分子的结构研究。酰胺-A带的振动特性在α-peptide中与结构的关系研究已有报道,而关于其在β-peptide中的研究尚未见报道。本文以β-homoalanine dipeptid...
- 赵娟王建平
- 关键词：红外MORSE势
- 文献传递
