国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS48)
- 作品数：7 被引量：20H指数：2
- 相关作者：王世会成永旭吴旭干吴曼喻达辉更多>>
- 相关机构：上海海洋大学中国水产科学研究院黄海水产研究所中国水产科学研究院黑龙江水产研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球更多>>
- 患铁虾综合征罗氏沼虾眼柄转录组研究被引量：2
- 2022年
- 为探索罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)铁虾综合征(IPS)的分子机制,采用高通量测序平台(Illumina Hiseq-2500)分别对患IPS罗氏沼虾(IPS虾)和正常罗氏沼虾开展转录组测序,进行生物信息学分析。结果显示,高通量测序共获得56.42 G高质量数据,拼接后得到221901条单基因序列(unigene),长度范围为201~30985 bp,平均长度为1572 bp,N50长度为2867 bp,N90长度为646 bp。将单基因序列分别在Nr、Nt、Swissprot、KEGG、KOG、GO、PFAM数据库进行序列比对及功能注释,103570条得到注释,其中,GO数据库注释到的单基因序列最多。差异表达分析显示,2003个基因在IPS虾眼柄中差异表达,包括1209个上调基因和794个下调基因,516个基因被注释到242条KEGG通路中,翻译、信号转导和免疫系统富集的差异基因数目最多。催乳素、雌激素、胰岛素、促性腺激素释放激素、胰高血糖素、催产素、谷氨酸能突触、血清素能突触等与生殖调控相关激素的代谢过程在IPS虾与正常虾眼柄之间存在差异。此外,一些已被证明在免疫反应中起重要作用的基因在IPS虾眼柄中显著上调,如血管内皮生长因子受体1、丝氨酸蛋白酶抑制剂6、C型凝集素、芳基硫酸酯酶B、酚氧化酶原激活酶2a、组织蛋白酶B、组织蛋白酶L、甲壳类抗菌肽4等。同时,注释到溶酶体、吞噬体、抗原处理与呈递、细胞凋亡、内吞作用等多条与免疫相关的途径,支持近期研究得出的罗氏沼虾IPS与病原感染相关的结论。本研究为解析罗氏沼虾IPS的成因和分子机制提供了数据支撑。
- 王国浩董宣王一婷郭晓萌王德浩孟凡增黄倢
- 关键词：罗氏沼虾眼柄转录组
- 合浦珠母贝不同生长阶段的基因型与环境互作效应被引量：3
- 2015年
- 为了研究合浦珠母贝（Pinctada fucata）不同生长阶段基因型与环境的互作效应,从2012年1月在海南构建的家系中选取生长快、中、慢3个典型家系（分别编号为 F1、F2和 F3）,于海南陵水黎安、广东湛江覃斗和广西防城白龙3个不同海区进行养殖试验,每个海区每个家系的放养数量为800个,养殖1年。采用方差和加性主效应乘积交互作用（additive main effects and multiplicative interaction, AMMI）模型对各家系不同生长阶段壳长、壳高、壳宽和体重4个性状的基因型与环境互作效应进行分析。结果显示,不同海区间合浦珠母贝的生长差异显著（P〈0.05）,其中海南黎安的生长较快,广西白龙较慢；家系间, F2家系的壳长、壳高、壳宽生长速度最快, F1家系体重生长速度最快。整个试验阶段总体上4个性状的基因型方差占变异总方差的比例为72.47%~88.55%,环境方差占9%~24.13%,基因型×环境互作方差占3.32%~4.04%。随着生长的进行,4个性状的基因型方差所占比例由最早阶段的92.32%~98.66%下降到最后阶段的32.45%~68.10%,环境方差由0.11%~1.27%增加到24.41%~62.26%,家系×环境互作方差由0.79%~3.9%增加到3.84%~7.51%。AMMI模型双标图分析表明, F1家系与覃斗、F2家系与黎安存在一定的互作,而F3家系的稳定性最好。上述结果显示,基因型与环境互作效应较小,家系对表型变异的贡献较大,表明家系的选择非常重要。该结果对合浦珠母贝优良品系的选育与推广具有重要指导意义。
- 吴曼刘宝锁黄桂菊陈明强范嗣刚喻达辉
- 关键词：合浦珠母贝基因型与环境互作多因素方差分析AMMI模型
- 中国明对虾Dscam基因的克隆及其在免疫致敏(类免疫)诱导反应中的表达分析
- 2018年
- 为了研究对虾免疫致敏过程中Dscam基因的表达规律,实验采用同源克隆和RACE技术获得了中国明对虾Dscam基因c DNA全长序列,并对该序列进行生物信息学分析。结果显示,中国明对虾Dscam基因的c DNA全长为6 624 bp,其中包括171 bp的5′端非编码区,459 bp的3′端非编码区,开放阅读框的长度为5 994 bp,编码1 996个氨基酸。推测该基因编码的蛋白含有一个信号肽、10个Ig结构域、6个FNIII功能区、1个胞质尾区和1个跨膜结构域。同源性分析及系统进化分析表明,Dscam基因与节肢动物的Dscam基因首先聚为一类,且与凡纳滨对虾的同源性最高,为92.4%。连续投喂6 d热灭活白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)饵料来诱导免疫致敏反应,在0、6和12 d及二次感染后的12、24、48、72和168 h分别取样,用RT-PCR的方法检测中国明对虾Dscam的相对表达量。结果显示,诱导感染组Dscam基因在第12天开始上调,且与阴性对照组和未诱导感染组差异显著;二次感染后24 h,Dscam基因的相对表达量达到最大值,与阴性对照组和未诱导感染组差异显著;48 h后基因表达量开始下降,但表达量仍高于阴性对照组和未诱导感染组。实验表明,中国明对虾存在Dscam基因,并在免疫致敏过程中发挥重要作用。
- 曹家旺孟宪红孔杰孔杰栾生史晓丽董丽君栾生
- 关键词：中国明对虾
- 毛蚶对石油烃的生物富集与释放规律研究被引量：2
- 2018年
- 采用接触染毒法,将毛蚶暴露于含0.1、0.2、0.4、0.8、1.6、3.2mg/kg大港原油的海水中,以探讨毛蚶对石油烃的富集与释放规律,试验结果表明,富集10d后,毛蚶石油烃终含量分别为9.3、62.0、88.2、122.4、144.2、156.7、176.4mg/kg,吸收速率随海水石油类含量的变化关系为y=14.37+3.294logx(r^2=0.9766);释放10d后,毛蚶石油烃终含量分别为11.1、13.4、13.9、14.2、15.5、17.3mg/kg,释放速率与富集阶段海水石油类含量的关系为y=12.86+3.139logx(r^2=0.9734)。生物富集系数分别为619.7,441.2,305.9,180.2,97.9,55.1,与海水石油类含量的关系为y=14.37+3.294logx(r^2=0.9861)。
- 李永仁张超梁健郭永军
- 关键词：毛蚶石油烃
- 葡萄牙牡蛎外套膜转录组测序及壳色基因挖掘被引量：2
- 2016年
- 采用Illumina高通量测序平台对黑壳与金壳葡萄牙牡蛎(Crassostrea angulata)外套膜组织开展转录组测序研究,其中黑壳组总计产出5 857 718 092 nt数据,筛选后的干净阅读子58 004 560个;金壳组产出6 727 447 326 nt数据,干净阅读子66 614 854个。将发掘的新基因与COG、GO、KEGG、Swiss-Prot、NR数据库进行序列比对,最终得到各数据库注释的新基因数量分别为147、397、203、567、1 347个。通过对差异表达基因的序列进行生物学功能注释和聚类分析以及利用已知贝壳基质蛋白序列进行搜索,鉴定出14条可能与壳色表达有关的贝壳基质蛋白基因,其中5条下调基因可能与金壳基因表达相关。
- 严璐琪郭香巫旗生祁剑飞宁岳王晓清曾志南
- 关键词：壳色转录组
- 细菌鞭毛蛋白与Toll样受体5的互作关系研究进展被引量：2
- 2020年
- 鞭毛蛋白是细菌鞭毛的主成分,亦是Toll样受体5(TLR5)的特异性配体,在动物宿主识别肠道细菌的过程中发挥着重要的作用。迄今为止,有关鞭毛蛋白与TLR5互作关系的研究涉及医学、营养学、生物学和免疫学等领域,并且已经成为各学科的研究热点。本文主要就鞭毛蛋白的功能结构、菌体运动中的作用、免疫特性及其与肠道健康的关系、黏膜表皮细胞的免疫特征和药物研发展开了较为详细的综述,旨在为鞭毛蛋白与TLR5的功能研究与机理探索提供参考信息。
- 高权新邢钱钱唐琼英杨国梁
- 关键词：鞭毛蛋白肠道菌群疫苗
- 东营池塘养殖中华绒螯蟹生长性能、性腺发育及营养品质被引量：9
- 2020年
- 为了解不同地理纬度中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的养殖性能和常规营养成分差异,通过连续采样和生化分析研究山东东营池塘养殖中华绒螯蟹的生长性能、生殖蜕壳率、肝胰腺指数(HSI)、性腺指数(GSI),并进一步比较出肉率(MY)、总可食率(TEY)、肥满度(CF)和可食组织的常规营养成分。结果表明:(1)无论是雌体还是雄体,中华绒螯蟹体质量与头胸甲长和头胸甲宽均呈幂函数相关性,头胸甲长和头胸甲宽则呈线性函数相关。雌体平均体质量始终小于雄体,且7-9月差异显著(P<0.05);雌雄蟹增重率(WGR)和特定生长率(SGR)均无显著性差异(P>0.05)。(2)雌体生殖蜕壳略早于雄体,生殖蜕壳高峰出现在8-9月,9月中旬成蟹全部完成生殖蜕壳。8-10月,雌雄蟹GSI显著增加,HSI则为下降趋势(P<0.05)。9月上市成蟹雌体平均体质量集中于60.00~99.99 g,而雄体则集中于100.00~139.99 g。(3)10月上市成蟹雌体GSI和TEY显著高于雄体(P<0.05),而MY和CF则以雄体为高(P<0.05)。成蟹雌体可食组织中粗蛋白和总脂含量均高于雄体,而水分含量则以雄体为高,灰分含量两者差异不大。综上,山东东营池塘养殖中华绒螯蟹生殖蜕壳高峰集中于8-9月,雌雄成蟹总可食率均较高,分别为46.47%和44.81%,可食组织具有较高的营养价值。
- 王世会王世会吴旭干吴旭干
- 关键词：中华绒螯蟹性腺发育营养品质
