国家自然科学基金(30670082)
- 作品数：13 被引量：18H指数：3
- 相关作者：李轶女唐平张志芳沈桂芳张寰更多>>
- 相关机构：中国农业科学院生物技术研究所江苏科技大学中国科学院更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 棉铃虫多核型多角体病毒A1和蓓带夜蛾多角体病毒B基因组结构的初步比较与分析
- 2008年
- 通过半补齐法建立棉铃虫多核衣壳型多角体病毒A1 HearMNPV—A1（Helicoverpa armigera multiple nucleocapsid nucleopolyhedrovirus-A1）的质粒基因组文库，拼接了一个24553bp的片断，推测含有26个ORFs，与蓓带夜蛾B多角体病毒MaeoNPV—B（Mamestra configurata Nucleopolyhedrovirus—B）进行基因对等图分析，表明HearMNPV基因片断缺失了一段5466bp的序列，与八字地老虎颗粒体病毒XecnGV（Xestia c—nigrum granulovirus）的orf 60～65基因簇氨基酸序列有高度一致性，基因信息分析表明HearMNPV和XecnGV可发生重组，为杆状病毒在自然界中的基因流向提供了更多的信息．
- 唐平易咏竹郭锡杰李轶女单晓红张寰
- 关键词：棉铃虫基因排列
- 棉铃虫多核衣壳型多角体病毒fp25 K基因的克隆及分析
- 2008年
- [目的]克隆棉铃虫多核衣壳型多角体病毒(HearMNPV) fp25 K基因,为深入研究杆状病毒的进化机制提供依据。[方法]通过半补齐法建立HearMNPV的质粒基因组文库,对插入片段进行鉴定和序列分析获取HearMNPV fp25 K基因。[结果]HearMNPV fp25 K基因的读码框由588个核苷酸组成,编码195个氨基酸;该基因上游具有晚期调控保守序列ATAAG,是一个晚期表达基因;HearMNPV fp25 K存在5个α-螺旋,8个β-折叠;HearMNPV与蓓带夜蛾核型多角体一致性最高,达97.0%,与舞毒蛾多核衣壳型多角体的FP’同源性最低,仅为19.3%。HearMNPV与GroupⅠNPVs、GroupⅡNPVs及GVs的fp25K同源基因间氨基酸平均相似性分别为55.6%、69.4%和29.3%,推测其与Ⅱ类NPVs的亲缘关系较近。[结论]该研究为杆状病毒分子进化、生物防治奠定了基础。
- 唐平王永杰李轶女张寰易咏竹秦启联
- 高温超氧化物歧化酶基因的克隆及真核重组转移载体pVL-sod的构建
- 2009年
- 从高温塘泥中分离得到一株耐高温菌株,推定其属于Geobacillus属,根据该属已知的超氧化物歧化酶基因(sod)序列,用PCR的方法扩增得到该菌的sod基因。序列分析表明,该基因全长1236bp,编码411个氨基酸。本试验构建了用于家蚕杆状病毒表达的重组转移载体pVL-sod,为下一步在家蚕杆状病毒中高效表达超氧化物歧化酶奠定了基础。
- 杨灵翟秋征邹媛媛张志芳
- 关键词：超氧化物歧化酶基因扩增基因克隆
- Geobacillus sp.POT5 α-淀粉酶基因的克隆及表达被引量：3
- 2007年
- 从高温环境土壤中分离到1株能在75℃生长并产生α-淀粉酶的菌株(POT5),扩增了其16Sr DNA核苷酸序列,序列分析表明该菌属于Geobacillus属.根据该属全基因序列测定数据中推定的α-淀粉酶基因,利用PCR方法从G.sp.POT5基因组中扩增得到该菌α-淀粉酶基因(amyP).序列分析表明该基因全长1.545 kb、G+C含量51.33%,编码514个氨基酸.构建重组表达质粒pET22b(+)-amyP,转化Escherichia coliBL21系统,表达产物经SDS-PAGE分析、活性染色及淀粉酶活力分析,表明amyP基因得到了表达,且产物具有生物学活性.
- 杨灵侯瑛余霖霖刘国生张志芳
- 关键词：GEOBACILLUS淀粉酶基因表达
- 棉铃虫多核型多角体病毒v-cath同源基因的克隆及序列分析被引量：1
- 2008年
- 为获得棉铃虫多核衣壳型多角体病毒(Helicoverpa armigera multiple nucleocapsid nucleopolyhedrovirus)基因组序列,采用随机克隆方法,建立HearMNPV的质粒基因文库,并通过对插入片段进行克隆鉴定和序列分析,获得编码组织蛋白酶基因v-cath。该基因阅读框为1026bp,共编码341个氨基酸。核苷酸和氨基酸同源性比较结果表明:HearMNPV的v-cath基因与蓓带夜蛾核型多角体病毒B(Mamestra configurata NPV-B)的同源性最高,而与苹果皮小卷蛾颗粒体病毒(Cydiapomonella GV CpGV)同源性最低,由此认为,杆状病毒科的v-cath基因在进化上存在2种进化方式:一类以点突变为主,基因长度变化不明显;另一类突变以小片段的碱基增减为特征。
- 唐平李轶女唐玉斌张寰易咏竹韩宾秦启联
- 棉铃虫多核型多角体病毒38k基因的克隆、序列分析及其蛋白高级结构的预测被引量：1
- 2009年
- 采用半补齐方法建立棉铃虫多核衣壳型多角体病毒基因组文库,通过对插入片段进行克隆鉴定和序列分析,获得了38k基因。该基因上游具有晚期调控保守序列TTAAG,是一个晚期表达基因,基因阅读框为903bp,共编码300个氨基酸,氨基酸序列同源性分析结果表明其与α类杆状病毒的同源性较高,有较近的亲缘关系。氨基酸高级结构的分析表明其与与磷酸酶结构相似性达到95%,与病毒核衣壳的组装有关。
- 唐平李轶女秦启联王春艳沈桂芳
- 东方粘虫颗粒体病毒超氧化物歧化酶基因的克隆与分析被引量：2
- 2008年
- 为获得东方粘虫颗粒体病毒(Pseudelatia separata granulovirus,PsGV)基因组序列,采用随机克隆方法,建立PsGV的质粒基因文库,并通过对插入片段进行克隆鉴定和序列分析,获得编码超氧化物歧化酶蛋白的基因(PsGV-sod)。该基因阅读框为462bp,共编码153个氨基酸。核苷酸和氨基酸同源性比较结果表明该基因与其他颗粒体病毒同源性较高,通过保守基序分析,认为其为铜锌超氧化物歧化酶。
- 邹媛媛李轶女朱越雄
- 关键词：粘虫颗粒体病毒SOD基因同源性分析
- 一种棉铃虫多角体病毒的纯化与鉴定
- 2009年
- 对一株纯化的棉铃虫多角体病毒进行电镜观察,形态呈不规则型,直径约2μm,命名为棉铃虫多角体-B(Heli-coverpa armigeranucleocapsid nucleopolyhedrovirus-B,HaNPV-B),它对东方粘虫有较好的感染性,与棉铃虫单核型多角体病毒(Helicoverpa armigerasingle nucleocapsid NPV,HaSNPV)有不同的宿主域。通过半补齐法建立HaNPV-B基因组文库,拼接了一个6035bp的核苷酸片段,推测包含6个ORF,其包含基因内容及基因结构与HaSNPV不同,分析表明两者是不同种病毒,这为杆状病毒与宿主的相互作用及共同进化提供了信息。
- 唐平李轶女张寰张志芳
- 关键词：棉铃虫杆状病毒基因
- 食品级乳酸菌基因表达系统的研究进展
- 2008年
- 本文从乳酸基因工程菌、载体选择标记和表达系统的构建方面介绍食品级乳酸菌表达系统,以及乳酸菌基因表达系统的应用前景。
- 唐平杨亚洲刘冠卉郭锡杰
- 关键词：乳酸菌食品级基因工程
- RNA扩增的研究进展被引量：3
- 2007年
- RNA扩增是伴随着基因芯片技术的应用而发展起来的一项技术,但不仅仅应用于芯片杂交。文章对RNA扩增的技术方法进行了综述,重点介绍了mRNA的线性扩增、指数扩增以及两者相结合的扩增方法以及优缺点,对microRNA的扩增方法也作了介绍,并对将来的发展作了展望。
- 李轶女胡英考张志芳沈桂芳
- 关键词：体外转录聚合酶链式反应基因芯片小RNA
