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广东省科技计划工业攻关项目(2006835502002)

作品数：1 被引量：4H指数：1
相关作者：王波张纯青胡兢晶周天鸿田传军更多>>
相关机构：广东省妇幼保健院广州医学院第一附属医院暨南大学更多>>
发文基金：广东省科技计划工业攻关项目国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇人巨细胞病毒
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇细胞
  • 1篇巨细胞
  • 1篇巨细胞病毒
  • 1篇基因
  • 1篇核苷
  • 1篇核苷酸
  • 1篇病毒

机构

  • 1篇广州医学院第...
  • 1篇广东省妇幼保...
  • 1篇暨南大学

作者

  • 1篇苏海浩
  • 1篇丁俊彩
  • 1篇李月琴
  • 1篇田传军
  • 1篇周天鸿
  • 1篇胡兢晶
  • 1篇张纯青
  • 1篇王波

传媒

  • 1篇中华生物医学...

年份

  • 1篇2009
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
广州地区人巨细胞病毒临床低传代株UL136基因的序列特征及多态性被引量：4
2009年
目的研究广州地区新生儿感染人巨细胞病毒（HCMV）临床低传代株UL136基因的序列特征与基因多态性。方法从10例广州感染新生儿体内分离获得2株（D2、D3）临床HCMV分离株，经多重PCR鉴定后进行UL136基斟全序列扩增。PCR产物纯化后进行基因克隆，构建HCMVUL136-pMD18-T重组质粒。经基冈测序及应用生物信息学分析方法，分析其核酸序列稳定性、编码蛋白质的二级结构与特衙。结果成功分离2株HCMV临床分离株，测序结果显示，D2、1）3及与GenBank中公布的11株临床分离株（4J、51C、39J、33J、63J、22M、10J、32C、29C、27C、Toledo）中，UL136序列高度保守。同源性分析显示在UL136全基因序列1019个核苷酸中，存在30个位点变异，所有的变异均为碱基替换，无插入及缺失突变。编码蛋白的氨基酸序列也高度保守，240个氨基酸残基巾，不同临床分离株氨基酸变异率为1．6％～3．7％。不同分离株的UL136蛋白巾参与形成二级结构的氨基酸数目及等电点不同。进化树分析结果显示D2和D3均属于1a群。结论广州地区临床低传代分离株HCMVUL136基因核苷酸序列及其氨基酸序列极为保守，但仍存在一定多念性。其基因的稳定性提示HCMVUL136开放阅读框（ORF）可能是一个具有重要功能的基因。其编码后修饰位点提示UL136可能与膜受体介导的细胞信号转导通路有关。
王波李月琴胡兢晶苏海浩丁俊彩田传军张纯青周天鸿
关键词：巨细胞病毒多态性单核苷酸基因生物信息学
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