河南省医学科技攻关计划项目(201201003)
- 作品数：4 被引量：23H指数：3
- 相关作者：黄学勇马红霞许汴利李幸乐康锴更多>>
- 相关机构：河南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：河南省医学科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 柯萨奇病毒B组4型河南分离株VP1区基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的 了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型（CoxB4） VP1区基因特征,并比较不同疾病来源CoxB4病毒分离株VP1区异同.方法 对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过设计CoxB4病毒VP1区特异性引物,对8株病毒进行PCR扩增,用生物学软件ATGC进行序列拼接,ClustalX1.83进行序列比对,BioEdit剪齐,MEGA4.0进行同源性分析和构建系统进化树.结果 CoxB4河南分离株VP1区长852 bp,与GenBank公布的其他分离株核苷酸相似性为80.3％ ～97.0％,氨基酸相似性96.1％～100％;与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异最大为19.7％,与手足口病分离株差异最小为3.0％.系统进化树显示CoxB4河南分离株属于Genotype Ⅴ型,手足口病分离株与脑膜炎分离株遗传距离较近,分布在一簇中,糖尿病患者分离株在另外一簇.结论 河南地区手足口病感染CoxB4病毒存在Genotype Ⅴ型传播和流行.
- 许玉玲王海霞卫海燕黄学勇
- 关键词：手足口病VP1基因系统进化树
- 引起河南省一起病毒性脑炎暴发的柯萨奇病毒B5的鉴定及其序列分析被引量：6
- 2012年
- 目的鉴定2011年引起河南省漯河地区一起病毒性脑炎（VE）暴发的病原体，并对分离的柯萨奇病毒B5（CVB5）进行基因特征分析。方法采集漯河地区病毒性脑炎暴发期间29例患者的5份咽拭子、21份粪便和14份脑脊液，采用实时荧光RT-PCR方法分别检测总肠道病毒（PE）、EV71及CA16病毒核酸。所有标本均进行病毒分离培养，对其中5例患者的2份粪便和3份脑脊液的阳性分离产物进行VP1和5′-UTR区核苷酸序列测定及亲缘进化分析。结果实时荧光RT-PCR结果显示，所有临床标本EV71和CA16病毒核酸检测均为阴性，咽拭子、粪便和脑脊液的PE核酸检测阳性率分别为60．0％（3／5）、61．9％（13／21）和85．7％（12／14）。咽拭子、粪便和脑脊液病毒分离率分别为20．O％（1／5）、25．0％（5／21）和29．0％（4／14）。VP1和5′-UTR区核苷酸序列BLAST分析及分子分型结果显示为CVB5，对其中5株分离毒株进行VP1全长基因分析显示彼此之间核苷酸同源性为97．9％～99．5％。与其同源性最近的毒株是2010年引起长春手足口病暴发的CVB5分离株CC10／10／Changchun，核苷酸同源性为97．1％～98．1％。与2010及2012年河南省平顶山地区的脑炎分离株COXB5／Henan／2010和0300IN／HN／CHN／2011／CB5的同源性分别为89．0％-89．6％和91．8％～92．5％。VP1区遗传进化树显示此次分离株为基因型D，且与长春株成一簇。结论导致此次病毒性脑炎暴发的病原体为肠道病毒CVB5，优势基因型的变迁可能与此次暴发相关。
- 马红霞穆玉姣李幸乐康锴黄学勇唐晓燕魏蔚许汴利
- 关键词：病毒性脑炎遗传进化分析
- 河南省2013年登革热暴发的登革热病毒基因组序列测定及分析被引量：12
- 2015年
- 登革热病毒（DENV）通过蚊虫叮咬进行传播,DENV感染后可引起登革热（DF）、登革出血热（DHF）和登革休克综合征（DSS）.在全世界范围内,主要分布在热带和亚热带地区.在我国主要分布在广东、福建、浙江和云南等地区.DENV属黄病毒科黄病毒属,是单股正链RNA病毒,基因组全长约11kb,包括4个血清型,每个血清型又分不同基因亚型.2013年以前河南省未发生过DF本地流行,偶有输入性病例报告.2013年河南省禹州市首次出现DF暴发疫情[1],共有73例确诊病例报告,本研究对这次暴发疫情的DENV基因组序列进行分析.
- 马红霞杜燕华黄学勇李幸乐许汴利
- 关键词：登革热病毒遗传进化分析
- 2011年河南省脑炎患者柯萨奇病毒B5型分离株基因组序列分析被引量：5
- 2013年
- 目的分析河南省柯萨奇病毒B5（CVB5）分离株全基因序列，了解其遗传特性。方法采集2例脑炎患者临床标本，分离病毒，提取病毒阳性分离物RNA，进行RT-PCR扩增，产物直接测序。利用DNAStar5．01和Mega5．05软件进行全基因序列拼接及亲缘进化分析。结果获得2株CVB5分离株（03001N和17Y）全基因组序列，核苷酸长度分别为7408bp和7404bp，两者核苷酸同源性为97％，同2010年河南CVB5分离株同源性最高，分别为98％和99％。5’-UTR分别为747bp和743bp；3’-UTR区均为103bp；病毒基因组编码区全长同为6558bp，编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白，氨基酸同源性为99％。VPl区系统发生树分析显示，2株CVB5分离株进化关系较近，同近年来国内其他分离株成一簇，而2009年的河南省CVB5分离株同山东省CVB5分离株成一簇。结论河南省内存在不同CVB5株传播链的流行，此次分离株为近几年内的主要流行株。
- 马红霞潘静静康锴谢志强茹维萍陈豪敏黄学勇许汴利
- 关键词：脑炎系统进化分析
- 病毒性脑炎病例中不同标本肠道病毒检出率分析
- 目的了解不同类型标本及其组合在肠道病毒所致病毒性脑炎病例诊断中的作用。方法配对采集临床诊断为病毒性脑炎病例的临床标本,采用荧光RT-PCR方法检测肠道病毒核酸,包括EV71,CA16和其他肠道病毒。收集病例的临床及流行病...
- 马红霞潘静静李懿康锴黄学勇许汴利
- 关键词：病毒性脑炎标本肠道病毒
- 文献传递
