肝细胞肝癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是世界范围内最常见的癌症之一,也是导致患者因癌症死亡的一个重要原因。据估计每年约新增50万～100万的HCC患者,其中80%的病例发生在发展中国家[1]。发展成HCC的高危因素有乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）或丙型肝炎病毒（hepatitis C virus,HCV）慢性感染、
乙型肝炎病毒X蛋白（hepatitis B virus X protein,HBx）全长154个氨基酸,与肝癌发生密切相关.为确定HBx的优势氨基酸序列和热点突变位点,在GenBank中下载所有HBx的氨基酸序列13950条,剔除插入突变、缺失突变和起始密码子非甲硫氨酸的序列,最后保留7126条.通过分析这7126条序列,计算出HBx每个位点的氨基酸分布情况,出现频率最高的氨基酸为该位点的优势氨基酸,其他氨基酸为突变氨基酸.154个位点的优势氨基酸组成HBx优势氨基酸序列.突变率〉10.0%的热点突变位点有32个.其中第36、42、44、87、88和127位氨基酸有4种（突变率〉1.0%）以上突变形式,具有较高的多态性.与肝癌密切相关的K130M/V131I双突变率为34.7%.通过7126条HBx序列与优势序列的同源性比较,随机选出其中50条序列（2条与优势序列同源性〈75%,48条同源性为76%~99%）,与23条参考序列及优势序列共同构建系统发生树.结果显示,HBx优势氨基酸序列属于基因型C,这与基因型C为全球主要流行型一致.本研究首次系统性分析了GenBank中HBx的优势序列,确定了32个HBx热点突变位点和6个多态性较高的位点,为基于HBx突变的基础和应用研究奠定了基础.
