江苏省农业科技支撑计划项目(BE2008379)
- 作品数：4 被引量：26H指数：2
- 相关作者：陈克平姚勤王勇郭敏党春望更多>>
- 相关机构：江苏大学更多>>
- 发文基金：江苏省农业科技支撑计划项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 动物bHLH转录因子家族成员及其功能被引量：16
- 2010年
- bHLH转录因子在真核生物生长发育调控过程中具有重要作用。动物bHLH转录因子包含45个家族,分别参与调控神经元发生、肌细胞生成、肠组织发育以及环境毒素响应等生物学过程。过去20年里,研究人员对动物bHLH家族成员鉴定及其生物学功能开展了广泛的研究。文章在介绍动物45个bHLH家族名称来源的基础上,综述了小鼠、果蝇和线虫3种模式动物bHLH家族成员及其功能的研究进展。小鼠、果蝇和线虫中分别有114、59和42种bHLH蛋白。其中,小鼠108种、果蝇47种和线虫20种bHLH蛋白的功能已比较明确,功能未知的22种线虫bHLH蛋白中还有15种尚未归入相应家族。文章也对部分被误用的bHLH家族成员名称做了说明,可为相关研究人员深入开展bHLH转录因子结构与功能的研究提供较为清晰和系统的背景资料。
- 王勇姚勤陈克平
- 关键词：BHLH转录因子家族成员生长发育
- 系统发生分析程序MrBayes 3.1使用方法介绍被引量：10
- 2009年
- 在介绍MrBayes3.1程序基本特点以及Nexus文件准备的基础上,选取普通DNA序列、普通蛋白质序列、含编码区域的DNA序列、mRNA序列以及混合型数据文件为例分别介绍了MrBayes3.1程序的基本使用方法,为初学者正确使用该程序提供了操作指南,同时为深入学习与掌握该程序的特殊用途打好基础。
- 王勇陈克平姚勤
- 关键词：系统发生分析MRBAYES
- 家蚕bHLH基因的染色体定位与系统发生分析被引量：1
- 2010年
- bHLH转录因子在真核生物生长发育调控中具有重要作用。以原有家蚕bHLH基序为查询序列,从最新版本的家蚕基因组数据库(SilkDB)中鉴定出52个家蚕bHLH家族成员,并将其中47个成员的编码区域定位到家蚕染色体上。分析家蚕与黑腹果蝇、蜜蜂、赤拟谷盗bHLH基序氨基酸序列的系统发生,结果呈现如下特点:(1)4种昆虫ASCa家族中的Ase蛋白功能相近,家蚕中有2种果蝇Ac蛋白的同源蛋白,而没有果蝇Sc和Lsc的同源蛋白;(2)4种昆虫HES家族中的Hairy蛋白功能相近,家蚕BmHES3可能是果蝇Dpn或Side的同源蛋白,家蚕BmHES1和BmHES2分别是赤拟谷盗HES1和蜜蜂HES2的同源蛋白;(3)家蚕比其它3种昆虫分别多出1个Clock家族与AHR家族成员,意味着家蚕在长期的人工驯化过程中可能在昼夜节律的调控与对外源毒素刺激的响应方面演化出了新的机理。汇总了与家蚕52个bHLH成员对应的果蝇、蜜蜂和赤拟谷盗同源蛋白序列及44种家蚕bHLH蛋白序列登录号。以上结果可为进一步开展家蚕bHLH基因结构与功能研究提供较为系统、完整的背景资料。
- 王勇党春望郭敏姚勤陈克平
- 关键词：家蚕生长发育染色体定位同源蛋白
- 一种新的家蚕信息素相关蛋白基因BmP218的生物信息学分析及功能预测
- 2009年
- 在进行抑制性减法杂交实验中,我们获得一条差异基因片段,EST拼接终获得了这一个654bp ORF阅读框, NCBI数据库检索未发现同源基因。但在家蚕数据库检索有同源基因存在为一种信息素相关的结合蛋白,PCR实验结果表明该基因确实在家蚕多种组织中存在转录,证明是一种新的基因,暂命名为BmP218。进一步生物信息学分析表明该定位在家蚕的第23号染色体上,有7个外显子。其同源物物有8个,虽然基因结构不同,但结构域非常相似。蛋白质分析中发现蛋白结构中包含有6个α螺旋,12个不规则卷曲,在氨基酸序列中存在有一段与昆虫细小病毒衣壳蛋白类似的区域(100-183)。
- 杨哲高路陈慧卿陈克平
- 关键词：家蚕幼虫蜕皮激素结合蛋白
