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江西省自然科学基金(2009GQN0047)

作品数:4 被引量:35H指数:3
相关作者:温强徐林初徐立安江香梅周文才更多>>
相关机构:江西省林业科学院南京林业大学更多>>
发文基金:江西省自然科学基金江西省科技支撑计划项目国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学

主题

  • 4篇油茶
  • 2篇微卫星
  • 1篇研究利用现状
  • 1篇遗传资源
  • 1篇栽培
  • 1篇栽培品
  • 1篇栽培品种
  • 1篇指纹
  • 1篇指纹图
  • 1篇指纹图谱
  • 1篇山茶
  • 1篇山茶属
  • 1篇微卫星标记
  • 1篇良种
  • 1篇良种化
  • 1篇聚类分析
  • 1篇基因
  • 1篇基因组
  • 1篇SSR
  • 1篇SSR指纹

机构

  • 4篇江西省林业科...
  • 3篇南京林业大学

作者

  • 4篇徐林初
  • 4篇温强
  • 3篇徐立安
  • 2篇江香梅
  • 2篇周文才
  • 1篇顾胤聪
  • 1篇李江
  • 1篇黄敏仁
  • 1篇叶金山
  • 1篇段伟华
  • 1篇王建文
  • 1篇伍艳芳
  • 1篇阮文越

传媒

  • 1篇林业科学
  • 1篇江西林业科技
  • 1篇经济林研究
  • 1篇分子植物育种

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2014
  • 2篇2013
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析被引量:21
2013年
采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的;在所有被检索序列的二至六碱基微卫星中,均以二碱基微卫星最多(>55%),并以(AG)n类型为主,但三碱基微卫星在所有EST序列中以(AAG)n类型最多,而在普通油茶基因组序列中则以(AAT)n最多;除六碱基微卫星外,二至五碱基微卫星均表现为不同微卫星重复单元的丰度随着微卫星碱基长度增加而减少。在转录组序列中,除六碱基微卫星之外,不同微卫星单元重复数的变异与重复单元长度呈负相关,推测二碱基微卫星理论多态性最高,而五碱基微卫星理论多态性最低;对在无冗余独立基因各区域中的微卫星进行统计,显示分布比例依次为3'UTR>CDS>5'UTR,在相同区域内比较,UTR区域中二碱基微卫星占总数量比例最大,CDS区域内三碱基微卫星的比例最高,此外5'UTR区域的三碱基微卫星的分布比例均高于3'UTR,初步推断5'UTR区域的微卫星相对3'UTR要保守些。
温强徐林初江香梅李江顾胤聪徐立安黄敏仁
关键词:山茶属微卫星
磁珠富集法快速制备油茶基因组微卫星标记
2014年
利用磁珠富集高效微卫星分离法,设计生物素标记的寡核苷酸(AG)15与(AC)15作为探针,快速分离油茶微卫星序列并建立其SSR分子标记体系。从获得的52份具微卫星序列的克隆测序结果中,成功开发40对油茶SSR引物,序列开发引物成功率在76.9%;对扩增结果进行比较分析后,共得到14对具有清晰扩增条带的SSR引物,占总引物的35%;进一步利用18个油茶无性系开展引物多态性检测,显示6对SSR引物具良好的多态性。研究结果可为油茶遗传学研究提供新的分子标记工具,同时为山茶属其他重要经济树种的相关研究提供很好的借鉴。
温强叶金山周文才段伟华伍艳芳江香梅徐林初
关键词:油茶磁珠富集基因组微卫星
油茶栽培品种SSR指纹图谱构建及聚类分析被引量:10
2017年
本研究首次利用从油茶DNA序列中开发的SSR标记及其近缘种通用性的SSR标记开展油茶栽培品种的分子甄别研究。7对通用性高、多态性好、扩增清晰的SSR标记构建了油茶43个栽培品种的DNA指纹图谱。遗传参数统计显示,43个油茶品种遗传多样性指数为0.347 1,Shannon指数为0.517 2;7对SSR引物扩增共得到位点36个,其中多态性位点35个,位点多态性达97.22%,其中利用4个标记CO_g SSR16、CO_gssr37、CO_e SSR4和CO_e SSR44两两组合可以完全鉴别出43个油茶栽培品种。聚类结果表明油茶品种的亲缘关系与地理来源存在一定的相关性,如来自江西的赣无系列品种大多能够成组聚类,而来自广西的品种(桂软11号,桂软24号,岑软2号,陆川大果)与来自越南的品种(和江2号,越南油茶,东孝2号)聚在一个类群;但也有一些品种地理来源不同而同样聚在同一类群,显示了油茶遗传背景的多样性与复杂性。本研究为油茶品种鉴定及遗传学研究等提供技术基础及理论依据。
周文才温强杨军王建文徐立安徐林初
关键词:油茶指纹图谱SSR聚类分析
越南国内油茶研究利用现状与良种化探讨被引量:6
2013年
油茶是重要的木本油料树种,在越南亦有广泛的分布与栽培。为了提高越南国内油茶栽培的良种化水平,文中介绍了越南国内的油茶资源分布情况与开发利用现状及其相关研究进展,并针对当前越南国内油茶资源特点及油茶生产中存在的主要问题,提出了今后越南国内油茶发展的良种化建议。
阮文越温强徐林初徐立安
关键词:油茶遗传资源良种化
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