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TCGA数据库372例胃癌组织CXCL10基因表达及临床意义被引量：2: 2020年; 目的胃癌是导致癌症死亡的主要原因之一,是东亚部分地区最常见的胃肠道恶性肿瘤。随着医疗水平的提升,胃癌患者5年生存率有所提高,但至今仍无法做到痊愈根治。本研究对癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中胃癌和癌旁组织的基因测序数据进行挖掘,寻找胃癌治疗的新靶点。方法从TCGA数据库中获取372例胃癌和32例癌旁组织的RNA测序数据,按照logFC>1且P<0.05的标准筛选差异表达基因,通过WGCNA分析并关联胃癌患者的临床表型数据找出标志性基因。结果通过edgeR包和DESeq2包数据分析得到1 355个上调基因和1 774个下调基因。WGCNA分析差异基因得出11个模块,分别与患者临床数据进行相关性分析发现"black"模块与患者的生命状态呈正相关。将"black"模块中的基因进行蛋白质互作分析得到CXCL10基因节点度最高,经生存分析得出CXCL10基因与总生存率存在相关性,P<0.01。结论 CXCL10基因可能在胃癌的早期诊断和临床治疗中有重要的意义。; 曾家豫周秉博张钏袁红霞魏政丽廖世奇; 关键词：胃癌

核酸适配体在肿瘤血清标志物筛选中的应用研究被引量：3: 2018年; 肿瘤血清标志物的核酸适配体是利用指数富集的系统进化技术(SELEX),从体外筛选获得的一种能与肿瘤血清标志物高特异性、高亲和性结合的寡核苷酸分子。利用核酸适配体的优势,探寻对肿瘤更具诊断价值的新的肿瘤标志物。目前在肝癌、胃癌等肿瘤的研究中已经取得了一定成果。本文综述了当前核酸适配体及其在肿瘤血清标志物筛选中的相关研究,讨论了肿瘤血清标志物的核酸适配体在肿瘤诊断中的价值以及目前的研究所存在的问题。期望通过本文的综合描述,有助于人们更好地了解肿瘤血清标志物核酸适配体的筛选,并为新的肿瘤血清标志物的发现提供帮助。; 马淑玲曾家豫; 关键词：核酸适配体肿瘤诊断

双向热循环消减-SELEX方法筛选肝癌血清核酸适配体被引量：1: 2019年; 肝癌位于我国肿瘤死亡率第2位,生存率较低。目前用于肝癌早期诊断的临床检查及血清肿瘤标志物检测的特异性与敏感性均较低,不能满足肝癌早期诊断和治疗的需要。核酸适配体与靶标分子结合的灵敏度高、特异性强,有巨大的临床诊断和治疗应用前景。本文利用双向热循环消减指数富集的配基系统进化(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术,分别以肝癌血清和健康人血清为靶标,经过19轮筛选,获得了肝癌血清特异性核酸适配体序列1000余条,以及健康人血清特异性核酸适配体序列1 000余条,并从中各挑取了1条高丰度适配体序列,分别命名为Tc1和Tn1。采取了50例肝癌病人血清和50例健康人血清,对适配体Tc1和Tn1与靶标血清的结合特异性进行了检测。结果显示,Tc1和Tn1对两种靶标血清的检出率分别为92%和94%。说明Tc1可特异性与肝癌血清结合,Tn1可特异性与健康人血清结合。肝癌血清特异性核酸适配体的筛选获得,将为建立基于核酸适配体的肝癌血清检测新方法奠定基础。; 曾家豫张蕾翟蒙许金苓袁红霞王维君陈聪盈田彩平廖世奇; 关键词：肝癌血清核酸适配体

核酸适配体结合蛋白质靶标的亲和力表征方法及其在疾病诊断中的应用被引量：1: 2018年; 核酸适配体是通过体外指数富集配体系统进化(SELEX)技术筛选获得,并能够和蛋白质靶标高特异性、高亲和力结合的单链寡核苷酸。核酸适配体不但具有抗体的识别特性,而且具有自己独特的优良性能,目前已应用于分析检验、食品安全和生物医药等各个领域。蛋白质具有多种多样的生物功能以及临床诊断价值。因此,核酸适配体针对蛋白质靶标并在蛋白质相关的基础研究领域受到广泛的关注。核酸适配体应用性能的优劣取决于与其靶标蛋白质的亲和力与特异性。本文主要综述核酸适配体对蛋白质靶标的亲和力表征方法,以及在药物研发、肿瘤检测、生物成像以及生物传感器方面的应用。; 汪靖王进曾家豫; 关键词：核酸适配体肿瘤检测

癌胚抗原特异性单克隆抗体(Anti-CEA)核酸适配体的筛选被引量：3: 2015年; 目的 :筛选癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)特异性单克隆抗体(Anti-CEA)的核酸适配体(aptamers),为肺癌血清肿瘤标志物核酸适配体的筛选奠定实验基础。方法:利用羧基化琼脂磁珠作为筛选介质,以Anti-CEA为筛选的目标靶分子,通过消减SELEX技术及实时定量PCR技术,从随机ss DNA文库中筛选出与Anti-CEA特异性结合的aptamers,并通过凝胶阻滞实验(EMSA)鉴定筛选到的Anti-CEA-aptamer复合物,然后将得到的第10轮富集文库扩增为双链DNA,通过切胶纯化后,连接PMD18-T载体,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,同时利用交错PCR技术鉴定阳性克隆,经测序,获得aptamers的序列。结果:经过10轮筛选得到了4条与Anti-CEA结合的aptamers,测序结果显示均为不同序列。结论:验证筛选出的与Anti-CEA结合的aptamer,特异性检测结果表明2号aptamer与靶分子结合的特异性很高,且与非特异蛋白无明显吸附,筛选出的aptamers用于识别Anti-CEA,将为肺癌的早期诊断和早期治疗提供新的突破口。; 曾家豫万波马瑾袁红霞李星赵运旺廖世奇; 关键词：核酸适配体

琼脂磁珠介导的核酸信标配基免疫PCR检测HBsAg: 重症肝炎病情危险,死亡率高诊断表型表现出时大都为肝炎晚期,此时诊断治疗已晚,因此,找到一种能高效、灵敏、快速准确地识别乙肝表面抗原的方法,对乙肝病毒感染的早期诊断和治疗具有非常重要的意义。本文采用小鼠IgG的Fc核酸信标...; 李东东廖世奇袁红霞赵运旺李星王靖王进田彩平魏政丽; 关键词：免疫-PCR; 文献传递

基于细胞的指数富集配体系统进化技术的肺癌细胞核酸适配体的筛选及其在肿瘤诊治中的应用被引量：1: 2018年; 核酸适配体是经过指数富集配体系统进化技术(SELEX)筛选得到的寡核苷酸序列。已有研究表明,核酸适配体在肿瘤诊断及治疗方面具有良好的应用前景。因此,本文主要针对肺癌细胞核酸适配体的筛选、表征等方面展开论述,初步探讨核酸适配体作为靶向载体和靶向药物在肿瘤诊断治疗中的作用,为肿瘤的早期诊断及早期治疗提供新思路。; 许金苓廖世奇田彩萍张蕾翟蒙陈聪盈唐金舟曾家豫; 关键词：核酸适配体肺癌细胞

核酸适配体及其亲和力的表征方法被引量：1: 2018年; 介绍核酸适配体及体外指数富集配体系统进化技术的原理,着重介绍核酸适配体不同靶标的亲和力表征方法,并对这些方法的优、缺点进行比较,建议未来可以联合多种互补的检测技术进行亲和力的相互印证。; 汪靖王进曾家豫廖世奇; 关键词：核酸适配体解离常数

肺癌血清肿瘤标志物及其检测方法研究进展被引量：7: 2013年; 肺癌是当前全世界发病率和死亡率增长最快的恶性肿瘤之一,严重威胁人类的身体健康及生命。肺癌血清肿瘤标志物的检测,对于肺癌的早期诊断、病理分型、临床分期、预后判断以及疗效评估等方面有重要的应用价值。本文综述了近年国内外临床应用的肺癌血清肿瘤标志物及相应的检测方法。; 廖世奇万波曾家豫马梅兰张虹; 关键词：肺癌血清肿瘤标志物

肺癌肿瘤标志物神经元特异性烯醇化酶抗原适配子的筛选及其应用被引量：2: 2017年; 目的提出一种基于适配子快速检测肺癌肿瘤标志物的方法。方法利用指数级富集配体的系统进化技术筛选其高特异性适配子,通过流式细胞术检测亲和力,最终选出一条高亲和力、强特异性的适配子。枸橼酸钠还原法制备纳米金颗粒。建立基于免标记纳米金和适配子的分析方法,并对其方法进行考察。结果通过6轮筛选得到三条NSE的高特异性、强亲和力的适配子,其中,a适配子特异性最高。同时利用筛选得到的肺癌肿瘤标志物a适配子和纳米金颗粒建立一种快速检测NSE抗原的方法。结论该方法具有较好的准确度,为肺癌的早期检测提供了一种新的手段。; 赵运旺朱家宁; 关键词：适配子纳米金肺癌肿瘤标志物

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