国家自然科学基金(30771545)
- 作品数:9 被引量:21H指数:4
- 相关作者:李加琪张豪李仕新王翀陈赞谋更多>>
- 相关机构:华南农业大学仲恺农业工程学院佛山科学技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 不同猪种乳铁蛋白基因5'侧翼区SNP分析
- 引言乳铁蛋白能增强铁的传递与吸收,具有抑菌、抗病毒等作用。乳铁蛋白基因启动子上单核苷酸突变可能会影响到该启动子的活性进而影响到基因的表达。本研究以广东省地方猪种蓝塘猪、大花白猪以及外来猪种长白猪作为研究对象,通过分析3个...
- 张爱玲刘晓静姚志文李兆能何必宏吴琳兰高萍李加琪
- 文献传递
- 鸭肝脏基础型脂肪酸结合蛋白Lb-FABP基因的克隆、组织表达谱和序列特征分析
- 2010年
- 【目的】克隆仙湖肉鸭肝脏基础型脂肪酸结合蛋白Lb-FABP基因的cDNA,并进行组织表达谱和蛋白结构分析,为肉鸭的分子育种提供基础资料。【方法】通过比较基因组学,采用RT-PCR和RACE技术,获得了Lb-FABP基因的cDNA序列全长序列;并采用半定量PCR分析了Lb-FABP基因在16个组织的表达;通过生物信息学方法预测了Lb-FABP基因的蛋白结构。【结果】仙湖肉鸭Lb-FABP基因的cDNA全长548bp,包括97bp长的5′非翻译区(5′UTR)和70bp长的3′非翻译区(3′UTR)以及381bp开放阅读框(ORF,含终止密码子)。Lb-FABP基因组序列包括4个外显子和3个内含子,3个内含子分别长为991bp、292bp和713bp。在所检测的16个组织中Lb-FABP基因mRNA均有表达,尤其在肝脏组织中的表达明显高于其它组织。Lb-FABP理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白,无明显的信号肽和跨膜区域;蛋白二级结构主要由β折叠和少量的α螺旋、loop环构成,预测发现在第5—22氨基酸残基处存在一个细胞溶质脂肪酸结合蛋白活性功能区;其三维结构由反向平行的10条β链及2条短α链组成的有一开口的"蛋白桶"构成。Lb-FABP基因氨基酸序列与鸡的该基因氨基酸的相似性为97.0%,与其它非哺乳脊椎动物的同源性达80%以上,比对尚未发现哺乳动物存在该基因。【结论】成功克隆肉鸭Lb-FABP基因cDNA序列以及基因组序列,该基因在肝脏组织的表达高于其它组织,并获知在5—22氨基酸处存在其蛋白活性功能区。
- 钟万福李加琪杨承忠王翀张豪张爱玲
- 关键词:克隆组织表达谱蛋白结构预测
- 猪泛素-B基因的克隆及组织表达谱分析被引量:3
- 2008年
- 从人泛素-B(Ubiquitin B,UbB)基因mRNA序列出发,在猪的ESTs库中进行同源性搜索,通过电子克隆和进一步RT-PCR方法从猪肌肉组织总RNA中扩增出泛素-B基因部分cDNA序列(GenBank登录号:EF688558),长894bp,其中在89~778bp处包含一个完整的开放阅读框,编码229个氨基酸。猪泛素-B基因由2个外显子和1个内含子构成(GenBank登录号:EF688559),内含子长657bp,符合GT-AG规则。序列分析结果表明:猪泛素-B基因与已报道的人、黑猩猩、小家鼠、大鼠、鸡等物种的泛素-B基因高度同源,同源性分别为92%、91%、91%、91%、89%,氨基酸序列同源性为100%。半定量RT-PCR结果表明:泛素-B基因在150日龄肥育猪心脏、肝脏、肾脏、小脑中的表达量较高,脾脏、肺脏、胃、膀胱、背最长肌、大脑次之,脂肪和下丘脑中的表达量最低,其在蓝塘与长白猪肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、膀胱、背最长肌等7个组织中的表达量存在差异。
- 谢水华李加琪陈瑶生张豪王翀梅盈洁莫德林李泽月
- 关键词:基因表达
- 长大二元杂交猪胎儿成纤维细胞的生物学特性被引量:5
- 2012年
- 【目的】研究长大二元杂交猪胎儿成纤维细胞的生物学特性。【方法】采用室温消化法从妊娠30d的长大二元杂母猪胚胎中分离胎儿成纤维细胞,利用MTT法检测第5、10、15、25、35、45、60、70代胎儿成纤维细胞的增殖能力,通过倒置显微镜观察不同代数的细胞形态,流式细胞仪分析细胞周期变化,DAPI染色观察细胞核染色质的形态以及衰老相关β-葡糖苷酶活性的染色测定等方法来判断细胞的衰老程度。【结果】①采用消化液室温消化法成功分离到猪胎儿成纤维细胞,细胞具有典型的成纤维细胞形态。②猪胎儿成纤维细胞于生长初期1~6d呈对数增长,此后进入平台期。【结论】随着细胞代数的增加,细胞的增殖能力虽有所下降,但仍然呈稳定的增长状态,各代次猪胎儿成纤维细胞生长良好。
- 李仕新陈松玲李加琪张豪臧莹安
- 关键词:体外分离培养生物学特性
- 猪APOE基因5'调控区的功能分析
- 引言人APOE位于19号染色体上,全长3597bp,与其它载脂蛋白基因具有相似的结构,均由四个外显子和三个内含子组成。ApoE是一种多功能分子,是血浆脂蛋白的主要组分,通过低密度脂蛋白受体途径负责对脂蛋白残粒的摄取。在体...
- 李仕新张豪李加琪
- 文献传递
- 猪胎儿成纤维细胞APOE基因的差异表达研究(英文)被引量:1
- 2011年
- [目的]研究APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中的差异表达。[方法]收集正常传代生长的第1、10、15、20、25、50代猪胎儿成纤维细胞,分别提取细胞总RNA。采用RT-PCR技术,检测不同代数猪胎儿成纤维细胞中APOE基因的表达。[结果]猪APOE基因在第1代猪胎儿成纤维细胞中表达水平最高,随着细胞代数的增加,表达量逐渐下降,到第50代表达量最低。[结论]APOE基因在不同代数的猪胎儿成纤维细胞中有选择性表达的趋势。
- 李仕新高萍陈赞谋张豪王翀李加琪
- 关键词:胎儿成纤维细胞衰老APOE基因表达
- 不同代次猪胎儿成纤维细胞CLK1基因差异表达分析
- 引言CLKs(CDC-2-like kinase homologs)激酶家族存在于包括果蝇、小鼠、人类等许多生物中,是进化上保守的双特异性激酶。而CLK1(CDC-2-like kinase 1)是CLKs激酶家族的一员...
- 颉孝贤贺艳芬李加琪
- 关键词:胎儿成纤维细胞实时荧光定量
- 文献传递
- 猪E-FABP基因在不同猪种组织的差异表达
- <正>引言脂肪酸结合蛋白(Fatty acid-binding proteins,FABPs)是低分子(14~15 kDa)细胞溶质蛋白,能够特异地与脂肪酸结合,是细胞内运输脂肪酸的重要蛋白。目前,在哺乳动物中发现了9种...
- 钟玉宜杨莉李加琪颉孝贤
- 关键词:十二指肠背最长肌背膘
- 文献传递
- 猪载脂蛋白E基因的表达调控研究
- 生物的寿命受遗传和环境的影响,利用模式生物对衰老相关基因的研究已取得一定成果,这些研究已经初步阐明寿命受某些特定基因的调控.人载脂蛋白E (apolipoprotein E,APOE)基因与人类寿命密切相关.载脂蛋白E是...
- 李仕新李加琪
- 关键词:基因表达转录调控
- 猪CAT基因克隆及在不同代次猪胎儿成纤维细胞中的表达规律
- 引言过氧化氢酶(catalase,CAT)广泛存在于动物、植物和微生物体内,它以HO为底物,通过催化一对电子的转移而最终将其分解为水和氧气,是体内清除自由基的重要酶之一。测定CAT基因在不同代次猪胎儿成纤维细
- 冯小曼侯海军李加琪
- 关键词:胎儿成纤维细胞基因克隆生物信息学分析基因表达
- 文献传递