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水稻低温响应基因OsCR1的克隆与表达分析: 2011年; 低温、高温、干旱等非生物胁迫是影响水稻产量与品质的重要非生物逆境因子。为了探索水稻耐逆的分子机理并挖掘新的水稻耐逆基因,采用Affymetrix 60K水稻基因表达芯片分析了培矮64S全基因组在上述逆境下的表达谱变化,筛选出一个受低温诱导表达水平显著升高的基因OsCR1(Oryza sativa L.cold responsive gene1,GenBank登录号:AK066066)。实时定量PCR进一步证实该基因受低温诱导高表达。利用RT-PCR方法扩增获得其cDNA序列。生物信息学分析表明,OsCR1位于水稻第10号染色体上,包含两个内含子并存在选择性剪接现象,可编码含195个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白等电点为5.78,分子量为21.9kD。拓扑结构预测显示OsCR1蛋白上含有2个Ser/Thr蛋白激酶磷酸化位点;疏水性分析显示该基因为亲水性蛋白;启动子区域分析发现5类逆境相关的顺式作用元件。氨基酸序列比对分析显示OsCR1为未知功能基因。; 宋书锋徐国云王曼玲崔延春夏新界; 关键词：水稻芯片克隆表达谱

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湖南省科技重大专项(009FJ1012)