国家自然科学基金(39970481)
- 作品数：12 被引量：113H指数：7
- 相关作者：郭坚华葛芸英张晓梅尹燕妮郭亚辉更多>>
- 相关机构：南京农业大学河北工程大学江苏省出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 小麦苗枯病菌的ITS分析及PCR检测被引量：21
- 2003年
- 小麦苗枯病菌 (Clavibacterfangii,Cf)是引起小麦细菌性苗枯病的病原 ,本研究用 16S～ 2 3SrDNA间的内源转录间隔区 (inter nallytranscribedspacer,ITS)序列通用引物L1(5 ' AGTCGTAACAAGGTAGCCGT 3' )和L2 (5 ' GTGCCAAGGCATCCACC 3' )扩增Cf和其它相关细菌的基因组DNA ;并对其PCR产物进行回收、克隆和测序 ,将所获序列和其它已报道的细菌ITS序列进行多重比较后设计出Cf的特异性引物I1(5 ' TGCCAAGTCACACTGAGACGA 3' )和I2 (5 ' CAATGATCTACCACCCTCCGA 3' )。此引物可以从Cf中扩增出 35 1bp的特异性片段 ,而其余参试的 2 1个细菌PCR反应结果均为阴性。该方法可以应用于小麦苗枯病菌的快速、可靠检测。此外 ,本研究对多种植物病原棒形杆菌的ITS序列进行比较研究 ,发现其具有一定的分类意义。
- 葛芸英郭坚华
- 关键词：小麦ITS分析PCR检测ITS序列
- 白叶枯病菌毒素对水稻根冠细胞微丝分布的影响被引量：4
- 2004年
- 用白叶枯病菌株Ah28产生的毒素,处理水稻野败型细胞质雄性不育系珍汕97A,以异硫氰酸荧光素-鬼笔环肽为探针,观察了毒素处理前后微丝骨架的形态及分布变化。结果显示,毒素处理后,珍汕97A的根冠细胞微丝的密集分布被破坏,纤丝状微丝不复存在,微丝集聚成粗束,有的呈碎片状。说明毒素影响微丝的分布,并探讨了毒素致病机理及微丝参与信号转导的可能性。
- 雷宇华马春红魏建昆
- 关键词：毒素微丝雄性不育细胞质信号转导
- 小麦的细菌性病害被引量：4
- 2006年
- 从病害的报道及病原物的鉴定、病害的分布、危害症状、病害流行及防治等4个方面系统介绍了小麦细菌性病害,并对国内外的有关研究进行综述,为小麦病害的早期诊断和防治提供技术支持。
- 尹燕妮张晓梅郭坚华
- 关键词：小麦细菌性病害
- 番茄溃疡病菌分子检测技术被引量：14
- 2005年
- 对中国三类检疫性有害生物番茄溃疡病菌(Clavibactermichiganensissubsp.michiganensis)进行PCR检测方法的研究。利用1对特异性引物ClaF1ClaR2,对5个番茄溃疡病菌进行特异性扩增,得到了一段长250bp的PCR产物,参试的其他棒形细菌以及其他属的植物病原细菌均无扩增产物。该检测方法特异性强、灵敏度高,在50pg的模板DNA浓度下还能检测到很强的条带。利用此引物可以检测到1×105个菌体。
- 付鹏郭亚辉张晓梅郭坚华
- 关键词：溃疡病菌分子检测技术番茄检疫性有害生物植物病原细菌PCR产物
- 几种常用植物病原细菌分子检测方法被引量：10
- 2006年
- 植物病原细菌(phytobacteria)是植物上一类重要的病原菌,这些细菌能引起多种农作物、经济作物、花卉、树木及牧草上的病害。它的快速检测是病害防治、预测预报及植物检疫必不可少的重要工作。其中,以PCR为基础的分子检测技术的进步使植物病原细菌的检测更快速、灵敏和可靠。本文对近年来植物病原细菌分子检测技术进行介绍,尤其是应用广泛的ITS-PCR(intergenictranscribedspace-PCR)、ARDRA(amplifiedribosomalDNArestric-tionanalysis-PCR)、rep-PCR(repetitiveDNA-PCR)和实时荧光定量PCR(real-timequantitativePCR)技术,旨在促进我国植物病原细菌研究的快速发展。
- 尹燕妮黄艳霞葛芸英郭坚华
- 关键词：植物病原细菌分子检测PCR
- 植物病原棒形细菌的RAPD分析被引量：13
- 2005年
- 采用RAPD分析技术对萎蔫短小杆菌落葵致病变种(Curtobacterium flaccumfaciens pv.basellae pv.nov.)和萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种(Curtobacterium flaccumfaciens pv.beticola pv.nov.)及植物病原棒形细菌4个属的15个菌株进行分类研究:从50条随机引物中筛选出20条,共产生225条带,多态性条带占80.4%。遗传相似矩阵及UPGMA聚类分析,表明这两个新致病变种与萎蔫短小杆菌属亲缘关系近,最小相似系数为0.6511;与其他属细菌亲缘关系较远;结合前人研究结果对植物病原棒形细菌新近提出的分类地位的改变进行了探讨。
- 尹燕妮陈永芳李师默郭坚华
- 关键词：RAPD
- 根据16SrRNA序列对假单胞菌属分类学的研究进展被引量：32
- 2004年
- 假单胞菌属是植物病原细菌中一个重要的属 ,而 1 6SrRNA序列分析是当前细菌分类中最精确的一种技术 ,应用这一技术对假单胞菌属进行分类有助于解决目前假单胞菌属分类的混乱 ,弄清假单胞菌属的系统进化关系。
- 郭亚辉郭坚华李斌
- 关键词：假单胞菌属RRNA分类学植物病原细菌系统进化
- 内蒙古糖甜菜叶斑病菌的多样性分析被引量：3
- 2005年
- 采用ERIC-PCR,BOX-PCR和ITS的分析方法,对分离自我国内蒙古自治区5个市的21个糖甜菜叶斑病菌菌株进行多样性分析,并与其他12种病原细菌进行比较。ERIC-PCR揭示,在相似性80%上所有参试菌株分为26簇,而BOX-PCR只得到20个簇,暗示这两种短重复序列在基因组中的分布不同;将两者电泳图谱结合,得到介于上述两者间的结果,分为23个簇;在相似率达87%时,ITS分析将21个糖甜菜叶斑病菌菌株分成7簇。3种分析方法相互验证,均说明内蒙古糖甜菜叶斑病菌基因组存在显著多样性。ERIC和BOX聚类证明了糖甜菜叶斑病菌与短小杆菌属(Curtobacterium)亲缘关系较近,与其他属细菌亲缘关系较远。研究证明,ERIC和BOX扩增基因组DNA指纹比ITS图谱具有更强的多样性。
- 尹燕妮张晓梅葛芸英郭坚华
- 关键词：植物病理学ITS
- 菜豆萎蔫病菌的PCR检测技术被引量：12
- 2004年
- 根据在GenBank已登录的萎蔫短小杆菌 (Curtobacterium flaccumfaciens)的基因间重复序列 ,用DNAman 5 0软件比较同源性 ,设计了一对引物CffF1和CffR2 ,并以菜豆萎蔫病菌的基因组DNA为模板进行扩增 ,得到了一段长 2 80bp的PCR特异产物。参试的其他属如棒形细菌属 (Clavibacter)、节杆菌属 (Arthrobacter)、拉氏杆菌属 (Rathayibac ter)、红球菌属 (Rhodococcus)细菌和萎蔫短小杆菌的其他致病变种 (Cur f pv oortii、Cur f pv poinsettiae、Cur f pv betae) ,以及其他植物病原细菌的基因组DNA均无扩增产物。该检测方法特异性强、灵敏度高 ,在 10
- 张晓梅林友伟吴新华郭坚华
- 关键词：菜豆PCR基因组DNA
- 江苏省小麦苗枯病菌的遗传多样性初析被引量：2
- 2006年
- 采用ER IC-PCR、BOX-PCR和ITS技术,对江苏省6个市的24个小麦苗枯病菌(C lavibacter fangii)进行遗传多样性分析,并与其他10种病原细菌进行比较。结果表明,在相似率达60%时,ITS将24个小麦苗枯病菌分成了5簇。以相似性60%为界,ER IC-PCR将34个参试菌株分为14簇,而BOX-PCR只得到9簇,暗示这两种短重复序列在基因组中的分布不同;将两者电泳图谱结合,得到介于上述两者间的结果,所有菌株被分成12簇,24个小麦苗枯病菌分布在5簇中。3种分析方法相互验证,均说明江苏省小麦苗枯病菌基因组存在显著多样性。ER IC-PCR和BOX-PCR聚类证明了小麦苗枯病菌与棒形杆菌属(C lavibacter)亲缘关系较近,与其他属细菌亲缘关系较远。ER IC-PCR和BOX-PCR扩增基因组DNA指纹比ITS图谱具有更强的多样性。
- 尹燕妮张晓梅葛芸英郭坚华
- 关键词：REP-PCRITS
