中国博士后科学基金(20080431156)
- 作品数：4 被引量：4H指数：1
- 相关作者：刘志文韩旭陈温福周索童李宪臻更多>>
- 相关机构：大连工业大学沈阳农业大学更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金国家自然科学基金辽宁省教育厅科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 杂草稻nrDNA ITS序列的测序分析
- 2010年
- 杂草稻nrDNAITS序列的直接测序和克隆测序比较结果表明直接测序和克隆测序均能得到准确的杂草稻nrD-NAITS序列。尽管直接测序方便和经济,但它的峰图差,有叠峰出现。杂草稻的ITS序列在587-589bp之间,其中ITS1长度为193-194bp,ITS2的长度为230-232bp,而5.8S均为164bp。与已公布的部分稻属的ITS进行多重比较,该序列蕴含了大量的系统学信息,可在分子水平为杂草稻的发生机理提供证据。
- 刘志文王英陈温福
- 关键词：杂草稻ITS序列直接测序克隆测序系统学
- 杂草稻nrDNA ITS片段的PCR扩增条件优化及测定被引量：2
- 2008年
- 对杂草稻的nrDNA ITS片段的PCR扩增条件进行了优化并测定,建立的PCR最优体系为:20μL反应体系含1μL模板DNA,0.125 mmol/L dNTPs,0.5μmol/L正反向引物,1 UTaq酶,2.0μL 10×TaqPCR Buffer;退火温度为57℃。这样的条件下充分保证了ITS PCR产物的质量和纯度要求,直接测序结果为600 bp左右,与网上结果十分类似,表明结果准确可靠。这些ITS片段的系统学信息将为杂草稻的起源进化提供有力的分子水平证据。
- 刘志文韩旭周索童王丽李宪臻陈温福
- 关键词：杂草稻NRDNA测序
- 水稻叶绿体的petG-trnP片段的测定和系统学分析被引量：1
- 2010年
- 本研究主要是对水稻的叶绿体petG-trnP片段进行PCR直接测序和序列结构的分析。结果表明,水稻的petG-trnP的序列十分保守,其间隔区全长为316bp,扣除trnW序列后的非编码区长为242bp,其中两端非编码区分别为116bp和126bp。非编码区中G+C含量在37.19%～38.02%之间。对5种水稻材料进行ClustalW等分析表明,它们的序列结构有所变异,共有7个变异位点,比例为2.89%,这预示着水稻的petG-trnP的非编码区中有着一定的系统学信息,可在分子水平上为稻属的系统关系提供一定的证据。
- 刘志文韩旭
- 关键词：水稻系统学
- 杂草稻叶绿体psbA-trnH片段的PCR扩增条件优化被引量：1
- 2008年
- 对杂草稻叶绿体psbA-trnH片段的PCR扩增条件进行了优化,建立的最优体系为:20μL反应体积含1μL模板DNA,0.125mM dNTPs,0.5μM正反向引物,1U Taq酶,2.0μL 10×Taq PCR buffer;退火温度为61℃,在此条件下充分保证了psbA-trnH PCR产物的质量和纯度要求。对该片段进行了直接测序,结果为510bp左右,在NCBI中比较分析表明其测序结果准确可靠,经ClustW分析表明含有丰富的系统学信息。
- 刘志文周索童韩旭曲佐寅王占久孙之音李宪臻陈温福
- 关键词：杂草稻测序
