国家自然科学基金(30470122)
- 作品数：3 被引量：60H指数：2
- 相关作者：陈建群王友红张鹏飞王强张云华更多>>
- 相关机构：南京大学安徽农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金安徽省高等学校优秀青年人才基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学化学工程更多>>
- 水溞基因组P450基因家族的分析被引量：2
- 2009年
- 利用水溞基因组mRNA和氨基酸数据库对P450基因进行搜索和分析,结果显示:在水溞基因组中发现71个P450基因,它们分别属于15个P450家族和17个亚家族,是一个典型的多基因家族。以氨基酸相似度大于60%为标准对水溞P450基因进行分组,则71个P450基因中,16个为孤儿基因,不能被归入任何一组;其余55个可归入12个组,其中8个组,包含47条序列适合于正选择和基因转换分析。结果表明:有3个组,含22个基因显著受到正选择压力作用,其中的2个组,含18个基因有正选择概率大于95%的氨基酸位点228E或277T,228E和277T分别位于底物识别位点SRS2和SRS5;有5个组,包含19个基因显示显著的基因转换事件;既显著受到正选择压力作用,又参与基因转换的基因共12个;相反,检测出既没有受到显著的正选择压力作用,又没有基因转换的基因18个。可见,发生基因转换的基因与受到显著正选择的基因有高度的相关性:发生过基因转换的基因中63.2%都受到显著的正选择压力作用,同时,受正选择压力作用的基因中有54.5%发生了基因转换。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。
- 张云华王强张鹏飞刘静陈建群
- 关键词：细胞色素P450正选择基因转换基序
- 植物抗病基因及其作用机理被引量：56
- 2005年
- 综合近年国内外对植物抗病基因的研究和我们对水稻抗病基因的研究成果,对植物抗病基因进行归纳分类,并就其结构、功能、作用机理和信号传导进行分析和讨论。根据植物抗病基因编码蛋白的保守结构,将植物抗病基因分成NBS-LRR、eLRR-TM、eLRR-TM-pkinase、STK和其他五大类。不同类型的基因在细胞水平上的分布不一样,NBS、激酶和LRR在不同类型的基因之间结构差异也较大,但是它们通过各不相同的作用机理参与细胞对病原体的防御。
- 王友红张鹏飞陈建群
- 关键词：植物抗病抗病基因基因编码蛋白细胞水平病原体
- 分子进化研究中的几个统计量及其应用被引量：2
- 2005年
- 为在分子水平上快速精确地研究生物的进化关系,提出了分子进化研究中的几个常用统计量及其计算方法.根据这些统计量探测正选择作用,并确定特定基因的进化速度或年龄.这些统计量包括核苷酸同义替换数ds(Ks)、非同义替换数dn(Ka)、Ka／Ks、DNA多态性和遗传距离等.通过植物抗性基因的一个实例揭示了这些统计量在阐明进化机制过程中的重要性.
- 陈建群王友红蒋科张晖
