北京市自然科学基金(6103025) 作品数:5 被引量:43 H指数:3 相关作者: 王丽侠 程须珍 王素华 马燕玲 钟敏 更多>> 相关机构: 中国农业科学院作物科学研究所 更多>> 发文基金: 北京市自然科学基金 国家食用豆产业技术体系建设专项 农业部作物种质资源保护项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
Ceratotropis亚属基于SSR标记和ITS序列的分类与进化分析 2010年 利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异。初步筛选出分布于11个连锁群(linkage group,LG)的74对小豆引物及14对黒吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料(除HAI_103)划分为两大类,第I类包括Ceratotropis组所有种质和3个"过渡"种质;第Ⅱ类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上。对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小(0-0.005),V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树(maximum parsimony,MP)和邻接树(neighbor-joining,NJ),将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致。 马燕玲 程须珍 王丽侠 王素华 赵丹关键词:SSR标记 ITS序列 进化 DNA甲基化作用模式及生物学效应 被引量:1 2010年 表观遗传学为分子遗传学研究的一个新热点。DNA甲基化是表观遗传学的核心领域之一,近年来获得了迅速的发展。概述了真核生物DNA甲基化的模式特点、参与DNA甲基化模式改变与维持的酶类及DNA甲基化分析的方法等,同时对DNA甲基化的生物学效应,如基因表达调控和生物进化调节进行了讨论,并对不同效应的应用前景进行了简要探讨。 马燕玲 王丽侠 程须珍关键词:DNA甲基化 RDDM 基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究 被引量:4 2013年 作为Ceratotropis亚属起源中心之一,中国有丰富的Ceratotropis亚属种质资源,但种间遗传进化研究相受落后。为探索该亚属各种间的亲缘关系及遗传演化规律,对Ceratotropis亚属18个种及亚种共110份材料的叶绿倒基因组2个内含子(rpll6、rpsl6)和3个基因(psbA-trnH、rpoB-trnC和trnL-trnF)的间隔区序列进行了研究。结果摹明,各序列的信息位点百分率在3.63%~24.28%之间,其中rpsl6最高,rpoB.trnC最低。序列拼接的Kimura进化距声分析发现,各种间进化距离介于0~0.057之间,矿minima复合体(矿minima、V.riukinensis和V.nakashime)和psubramaniana的进化距离最大。基于单个序列,利用MEGA5.1和PAUP4.0软件构建的邻接树和最大简约树的结芽均将Ceratotropis亚属18个种及亚种划分为2个大支,其中第Ⅰ类包含9个种和亚种,为3个组似ngulares、Ceratotropis和Aconitifoliae)的混合体,第Ⅱ类也包含9个种和亚种,全部属于Angulares组。系统发育树的分化同质性检验表明其拓扑一致性较高(P=0.87)。psbA-trnH等5个序列的分子系统进化研究对阐明Ceratotropis亚属种问著缘关系和系统演化具有重要的理论和现实意义。 刘岩 程须珍 王丽侠 王素华 白鹏关键词:叶绿体DNA 遗传进化 基于SSR标记分析小豆及其近缘植物的遗传关系 被引量:12 2011年 本研究利用87对SSR引物分析了80份栽培小豆(Vigna angularis)、22份野生小豆(V.angularis var. nipponensis)以及10份豇豆属(共7个种)近缘植物,旨在比较豇豆属不同种的遗传多样性,并分析种间的遗传关系。结果显示87对SSR引物在112份小豆及其近缘植物资源中共检测到667个等位变异,其中有75个、71个和82个SSR位点分别在栽培小豆、野生小豆和近缘植物中表现为多态。随机抽样分析发现,平均每SSR位点检测到的等位变异数目为近缘植物>野生小豆>栽培小豆,与多态信息含量(PIC)值一致,说明近缘植物及野生小豆中蕴含着丰富的遗传变异,是栽培小豆育种的重要基因来源。聚类分析显示,栽培小豆、野生小豆和近缘植物间的遗传分化比较明显,分别聚为三大类,其中栽培小豆的遗传背景与其生态环境相对应;近缘植物又可以分为三个亚类,亚类间的遗传距离与其亲缘关系相对应。本研究结果也说明利用SSR标记辅助豇豆属的种间分类是可行的。 王丽侠 程须珍 王素华关键词:SSR 绿豆基因组SSR引物在豇豆属作物中的通用性 被引量:29 2012年 分子标记的种间通用性可降低其开发成本,提高利用效率,也有助于促进遗传研究较薄弱物种的分子遗传学研究。本文选取绿豆、小豆、豇豆及饭豆材料各3份,分析1205对新开发的绿豆基因组SSR引物在这些材料中的扩增效果,结果显示绿豆基因组SSR引物在豇豆、小豆和饭豆中的通用性比率分别为50.0%、73.3%和81.6%;多态性比率分别为4.1%、1.7%和1.5%;在4个种间均通用的引物469对。这些通用性SSR引物将有助于这4种食用豆类在多样性评价、连锁图谱的构建、基因定位及比较基因组学等方面的研究。 钟敏 程须珍 王丽侠 王素华 王小宝关键词:豇豆属 SSR