深圳市科技计划项目(200802116)
- 作品数：4 被引量：18H指数：3
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- 南方汉族强直性脊柱炎患者及健康人群HLA-B27基因的分子多态性及分布被引量：5
- 2009年
- 目的研究南方汉族强直性脊柱炎(AS)患者及健康人群HLA-B27亚型等位基因的多态性和分布特点。方法采用HLA测序分型方法,对收集到的46份B*27阳性的南方汉族AS患者血样以及随机选择的80份经rS-SOHLA流式磁珠低分辨检测为B*27阳性的造血干细胞南方汉族捐献者血样,做HLA-B基因的第2—4外显子测序分型,测序反应产物用ABI PrismTM3730测序仪检测,Assign3.5分析软件分析结果。对检出的模棱两可结果及"罕见型"等位基因,辅以PCR-SSP法HLA-B27高分辨基因分型。结果46名南方汉族AS患者中,共检出4个HLA-B*27相关的等位基因:B*2704的检出比例最高,为82.98%(39/47);其次是B*2705,为12.77%(6/47);B*2707和B*2724各为2.13%(1/47)。80名南方汉族造血干细胞捐献者中,共检出7种B*27相关等位基因:以B*2704的检出比例最高,为57.32%(47/82);其次为是B*2705,为26.83%(22/82);B*2706和B*2707各为6.10%(5/82);B*2703、B*2715和B*2724各为1.22%(1/82)。结论南方汉族AS患者HLA-B*27基因中以B*2704最为常见,健康人群以B*2704和B*2705等位基因为主要亚型。
- 邓志辉高素青曾健强王大明范新徐筠娉魏天莉
- 关键词：HLA-B27抗原强直性脊柱炎测序分型
- 五例样本HLA-C基因测序分型中等位基因丢失及其原因分析被引量：7
- 2009年
- 目的探讨HLA-C基因测序分型时等位基因漏检和丢失的原因，以提高HLA测序分型的成功率和准确性。方法620份随机选择的深圳健康捐血者血样，采用AlleleSEQRHLA—Cplus测序分型试剂盒进行检测，对无完全匹配、分型结果“异常”的标本，采用分子克隆和测序方法进行全长单倍体序列分析；对未检出新的碱基点突变的样本，进一步采用自行设计的PCR引物和AlleleSEQR试剂盒中的测序引物进行再测序，分析测序分型结果“异常”的原因。结果620份经AlleleSEQRHLA—C测序分型的样本中，发现5例样本无完全匹配的基因型，与之最接近的多种等位基因型均存在单个碱基的不匹配；并且在第4外显子出现碱基杂合，但第2和第3外显子区域内无杂合碱基。经分子克隆和单倍体测序，以及采用自行设计的PCR引物和AlleleSEQR试剂盒中的测序引物再测序，证实了5例标本均存在Cw＊0706等位基因漏检和丢失现象，未发现新的碱基点突变。结论HLA-C基因测序分型时，因PcR引物与模板DNA不匹配会导致等位基因的漏检和丢失。根据中国人群HLAC分子全长序列特点，开发适合于中国人群的测序分型试剂十分必要。
- 曾健强徐筠娉王大明邹红岩邓志辉杨宝成
- 关键词：人类白细胞抗原测序分型测序分析等位基因丢失
- Bel亚型α1，3半乳糖基转移酶新等位基因的鉴定被引量：3
- 2009年
- 目的分析1例罕见B放散型的ABO血型分子背景，鉴定ABO新等位基因。方法对1例正反定型未能鉴定其ABO血型的捐血者，分别采用ABO基因第6及第7外显子直接序列测定及单倍体克隆测序进行基因分型，以及检测AB0基因CBF／NF—Y微卫星增强子区域。结果血清学鉴定为Bel的个体中发现了一个突变的B等位基因，该等位基因与B101等位基因相比，差异在nt905位A〉G突变。该突变导致αl，3半乳糖基转移酶Asp302gly，定为Bel新基因，Genbank注册号为FJ009674。AB0基因微卫星增强区域序列测定为G／C型。结论α1，3-D-半乳糖基转移酶基因中nt905A〉G突变可能是Bel分子遗传机制之一，第302位氨基酸变异大大影响了糖基转移酶的活性。
- 曾健强
- 汉族人群中22个HLA-Cw等位基因全长序列单核苷酸多态性分析被引量：3
- 2010年
- 为探讨HLA-Cw(Human leukocyte antigen-Cw)基因全长序列分子遗传多态性,文章对28个HLA-Cw基因型已知的汉族个体样本,采用长距离PCR技术和高保真性的Pfu酶,扩增HLA-Cw基因全长序列4.5kb,进行分子克隆和单倍体测序。采用群体遗传学研究方法分析了HLA-Cw等位基因全长序列中各亚区的单核苷酸多态性。结果表明:在28个样本中共检测出22种等位基因,序列均已提交GenBank和国际IMGT/HLA数据库并获得了认可;其中Cw*0706、Cw*030301、Cw*140201的全长序列为首次报道,尤其是Cw*0706内含子序列的获得,能够重新设计对该等位基因测序分型的引物,避免测序分型中可能对这一等位基因的漏检。将28个样本的56条单倍体序列用Clustal软件进行序列排比,输入到DnaSP4.0进行多态性分析,共发现244个SNPs,10处插入/缺失多态性。对HLA-Cw等位基因各亚区多态性的分析,发现第4内含子及以前并没有受到关注的第5外显子受到平衡选择的作用,在进化中受到了选择压力,预示着它们在免疫系统的进化过程中可能扮演着重要的角色。
- 曾健强徐筠娉王大明高素青邹红岩邓志辉
- 关键词：人类白细胞抗原单核苷酸多态性
