公共文化服务平台

共 7 条记录，以下是 1-8

全选清除导出

排序方式：

G-蛋白偶联受体GPR120分子模建研究被引量：4: 2009年; 新的长链脂肪酸受体G-蛋白偶联受体120(G-protein-coupled receptor120,GPR120)是2型糖尿病的潜在治疗靶标.由于其晶体结构迄今尚未获得,成为基于结构的新药设计的瓶颈.首先,以人体β2肾上腺能素受体(human β2 adrenergic receptor,β2AR)晶体结构为模板,通过同源模建方法构建GPR120三维结构,对整个体系进行包膜的分子动力学模拟.然后采用分子对接技术模建了GPR120的小分子激动剂GW9508与GPR120的相互作用模型,发现了受体分子识别的关键性残基,为开展定点突变实验提供了指导意义.所建模型为研究受体与配体作用提供了合理的初始结构,此方法也适用于其他G蛋白偶联受体的分子模建.; 陆绍永蒋勇军俞庆森邹建卫; 关键词：G-蛋白偶联受体同源模建分子动力学模拟 2型糖尿病

分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用被引量：5: 2009年; 用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键,无法维持磷酸根转移所需的线性关系;由于失去了氢键网络的稳定作用,Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动,并导致Arg96的侧链发生偏转,使Arg96无法保持与Arg180和Lys205之间正常的相对位置,最终影响GSK-3β与底物的结合.; 孙浩蒋勇军俞庆森邹建卫; 关键词：糖原合成酶激酶-3Β 分子动力学模拟

α-咔啉类GSK-3β抑制剂的合成、活性评价和分子对接研究被引量：1: 2012年; 糖原合成酶激酶3β(GSK-3β)是神经退化性疾病如早老性痴呆、II型糖尿病、癌症等多种重复杂性疾病的药物靶标,α-咔啉类化合物具有多种生物活性.以GSK-3β为作用靶点,利用Graebe-Ullmann反应合成了α-咔啉,并采用Buchwald-Hartwig偶联反应合成了9个4位取代的α-咔啉胺类衍生物.体外的GSK-3β激酶酶抑制活性测试表明其中4个化合物具有一定的抑制活性,其中化合物3c的IC50值达到了5.1μmol L-1.同时采用了分子对接方法分别研究了化合物2,3c与大分子蛋白的作用模式,初步探讨了影响抑制活性的原因,为进一步的研究提供了依据.; 王媛蒋勇军张美青沈银; 关键词：分子对接

洋刀豆脲酶与抑制剂相互作用的分子对接和分子动力学研究被引量：7: 2011年; 通过洋刀豆脲酶抑制剂的筛选实验得到具有较好抑制活性的化合物2-乙酰基-γ-丁内酯(COM),其半数抑制浓度在微摩尔浓度级别(IC50=375μmol·L-l).在此基础上,使用分子对接和分子动力学(MD)模拟的方法研究洋刀豆脲酶与抑制剂乙酰氧肟酸(AHA)及活性化合物COM之间的相互作用.用Gold3.0程序将两个小分子与洋刀豆脲酶的晶体结构进行对接,对接得到的复合物模型使用Amber程序进行MD模拟研究.模拟过程中,脲酶结构中的双核镍离子活性中心选用non-bonded模型.研究结果显示:AHA与洋刀豆脲酶结合时,Ni(1)和Ni(2)均为五配位;COM与洋刀豆脲酶结合时Ni(1)为五配位,Ni(2)为六配位的结合模型更加合理.这些研究为了解洋刀豆脲酶与抑制剂之间的相互作用提供了重要的参考信息.; 吕婧蒋勇军俞庆森邹建卫; 关键词：分子对接分子动力学模拟镍离子

GSK-3抑制剂药效团模型的构建: 2012年; 选择活性跨越0.08～100 000nmol.L-1的8类共30个GSK-3竞争性抑制剂小分子作为训练集,其余490个不同结构和活性的小分子作为测试集.采用Accelrys Discovery Stutio Client 2.5软件,筛选得到由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水中心、1个环芳香性和1个排除体积组成的最佳模型(Correl=0.900,Config=13.962,Δcost=90.725),采用测试集与分子对接方法对模型进行评价,表明该模型具有较强的预测能力,为进一步的数据库搜索及寻找新型GSK-3抑制剂先导物提供了依据.; 吕杨蒋勇军潘善飞代娜罗海彬; 关键词：药效团分子对接

糖原合成酶激酶3β结构与功能的分子模拟: 糖原合成酶激酶3β(Glycogen synthase kinase 3β,GSK-3β),催化转移ATPγ位磷酸根至底物丝氨酸/苏氨酸磷酸化底物而发挥调节作用,与多种复杂性疾病如早老性痴呆、癌症、2型糖尿病有密切的关系...; 蒋勇军陆绍永邹建卫; 关键词：糖原合成酶激酶3Β 分子模拟抑制活性

分子动力学模拟研究结构金属镁离子在GSK-3β激酶磷酸化中的作用(英文)被引量：4: 2011年; 糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,调节糖原合成酶的活性,并在生物体内的多条信号通路中发挥作用.GSK-3β是糖尿病,肿瘤,急性炎症,早老性痴呆等多种复杂疾病的药物作用靶标.Mg2+是GSK-3β激酶的保守结构金属离子,与三磷酸腺苷(ATP)分子作用,在激酶的磷酸化中扮演重要的角色,本文阐明了两个Mg2+离子(Mg2I+,Mg2II+)在激酶磷酸化中的作用:Mg2+稳定GSK-3β与ATP的构象.缺乏Mg2+离子,GSK-3β结构的柔性增强,同时ATP的构象发生改变,相对Mg2II+离子而言,Mg2I+离子在磷酸化反应中的作用更突出,但Mg2II+离子也是必不可少的,如果没有Mg2II+离子,Lys183无法独立稳定ATP的合适构象.当两个Mg2+离子都不存在时,ATP形成分子内的氢键,成为一种折叠的构象.; 孙浩蒋勇军俞庆森高慧; 关键词：磷酸化分子动力学模拟

离子液体中有机物溶解度的QSPR模型分析被引量：6: 2010年; 采用偏最小二乘(PLS)分析方法对84个有机物在四种不同的离子液体中的溶解度进行基于VolSurf参数的定量构性关系(QSPR)研究,取得较好的结果.训练集模型对预测集具有良好的预测能力.参数分析表明有机物具有较大体积的亲水区域,对溶解度有利,且有机物与离子液体之间的相互作用能约为-0.84kJ·mol-1.一定的疏水性对溶解度也是有利因素,当离子液体具有小体积的疏水取代基,有机物具有不对称的局部疏水区域对溶解度有利,当离子液体具有大体积或多个疏水取代基,有机物较高的疏水体积对溶解度有利.多元线性回归(MLR)显示亲水参数W1最重要,表明分子的亲水性是影响有机物在离子液体中溶解的关键因素.; 潘善飞胡桂香吕杨邹建卫俞庆森; 关键词：离子液体溶解度定量构性关系 VOLSURF 多元线性回归

全选清除导出

共1页<1>

国家自然科学基金(20803063)