国家自然科学基金(20803022)
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
- 相关作者：李洪林刘丽沈杰蒋华良蔡超前更多>>
- 相关机构：华东理工大学中国科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基于GPU的矩阵求逆性能测试和分析被引量：9
- 2010年
- 在CPU串行运算模式下实现大规模矩阵求逆是一个非常耗时的过程。为了解决这一问题,基于NVIDIA公司专为GPU(图形处理器)提供的CUDA(计算统一设备架构),从新的编程角度出发,利用GPU多线程并行处理技术,将矩阵求逆过程中大量的数据实现并行运算,从而获得了较大的加速比。同时,根据程序的执行结果,分析了GPU的单精度与双精度的浮点运算能力及其优、劣势。最后,通过分析数据传输时间对GPU性能的影响,总结出适合GPU的算法特征。
- 刘丽沈杰李洪林
- 关键词：CPU矩阵求逆
- 计算系统生物学:理论、方法及在药物研发中的应用被引量：2
- 2010年
- 计算系统生物学是一个多学科交叉的新兴领域,旨在通过整合海量数据建立其生物系统相互作用的复杂网络。数据的整合和模型的建立需要发展合适的数学方法和软件工具,这也是计算系统生物学的主要任务。生物系统模型有助于从整体上理解生物体的内在功能和特性。同时,生物网络模型在药物研发中的应用也越来越受到制药企业以及新药研发机构的重视,如用于特异性药物作用靶点的预测和药物毒性评估等。该文简要介绍计算系统生物学的常见网络和计算模型,以及建立模型所用的研究方法,并阐述其在建模和分析中的作用及面临的问题和挑战。
- 刁妍妍蔡超前蒋华良李洪林
- 关键词：生物模型建模方法
