国家自然科学基金(21173231)
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
- 相关作者：王建平赵娟石纪培杨帆更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院“百人计划”更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 基于分子力学的β-肽酰胺-Ⅰ带振动
- 利用超快红外光谱实验、量化计算以及分子动力学模拟研究了氮乙基丙酰胺(NEP)的动态结构。建立了基于分子力学的静电频率转换模型(MM-map),研究了NEP溶液相中酰胺-Ⅰ带的光谱。利用此MM-map预测了一个β-七肽分子...
- 赵娟石纪培韩晨王建平
- 关键词：分子动力学模拟FTIR
- 文献传递
- N-乙基丙酰胺的飞秒二维红外光谱被引量：4
- 2013年
- 利用飞秒二维红外实验方法,结合稳态红外光谱实验和计算化学手段,对β-肽模型分子N-乙基丙酰胺(NEPA)的超快结构动力学进行了研究.结果表明,在水溶液中,NEPA具有类α-肽酰胺-I带的振动特征,并表现出对分子结构和化学环境的灵敏性.二维红外光谱动力学结果揭示了一个1ps左右的光谱扩散时间,与酰胺-水之间的氢键结构动力学时间尺度一致.
- 石纪培赵娟杨帆王建平
- 关键词：二维红外光谱分子动力学模拟
- 二羰基茂铁二聚体的动态结构研究
- 利用一维稳态红外光谱,5μm泵浦探测光谱手段,结合量子化学计算,以非桥连三价羰基为探针,研究了二羰基茂铁二聚体[CpFe(CO)]在二氯甲烷中的结构和振动动力学。结果表明,[CpFe(CO)]两个主要结构(顺式cis和反...
- 杨帆刘英亮王建平
- 文献传递
- 金属阳离子与β-肽骨架相互作用的振动光谱特征
- 2016年
- 盐溶液中,金属阳离子(如Na+和Mg2+等)与肽分子骨架的相互作用,在酰胺基团的振动光谱中能得到体现。本工作利用红外光谱实验、分子动力学模拟和量化计算方法,以酰胺-Ⅰ带和酰胺-Ⅱ带为探针,研究了上述金属阳离子与?-肽模型分子-氮乙基丙酰胺(N-ethylpropionamide,NEPA)分子骨架的作用。研究表明在盐溶液中,阳离子/阴离子/水分子之间形成复合物。作为阳离子配体的水分子与NEPA中的羰基氧之间存在动态相互作用,从而使得酰胺-Ⅰ带和酰胺-Ⅱ带的光谱发生劈裂。我们也讨论了酰胺NH与水合离子团簇的相互作用。
- 赵娟王建平
- 关键词：红外光谱
- 含羧基侧链氨基酸衍生物的红外光谱与分子动力学模拟研究
- 天冬氨酸(Aspartic acid,Asp)和谷氨酸(Glutamic acid,Glu)为酸性氨基酸,它们的侧链均含有羧基(COOH)。在生理条件下,Asp和Glu侧链均为去质子化状态(COO~-),即侧链带一个负电...
- 于鹏云王建平
- 关键词：红外光谱分子动力学模拟
- 文献传递
- 碱金属阳离子与β-肽骨架的作用
- 选取β多肽的模型分子N乙基丙酰胺(NEPA)作为研究对象,利用一维红外光谱(FTIR)实验手段得到了NEPA在不同碱金属盐溶液中的一维红外光谱。结合分子动力学模拟和量子化学计算等手段分析了NEPA与碱金属阳离子之间的作用...
- 石纪培杨帆王建平
- 关键词：分子动力学模拟量子化学计算
- 文献传递
