浙江省医药卫生科学研究基金(2003Z003)
- 作品数：5 被引量：31H指数：4
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- 一例HLA-A新等位基因A＊3308的测序分析被引量：4
- 2006年
- 目的研究HLA新的等位基因HLA A3308的分子机制。方法样本DNA抽提采用PEL FREEZ抽提试剂盒,应用PCR方法扩增先证者HLA A基因的第1～8外显子,PCR产物直接经TOPO转染克隆到质粒载体中获得等位基因的单链,对所得克隆进行第2、3、4外显子双向测序分析。结果先证者样本克隆测序得到两个等位基因,其中1个等位基因为A0201,另一个经BLAST验证其为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ089631,DQ089632,DQ089633)。与最接近的A3303等位基因序列相比,新的等位基因在第2外显子上有5个核苷酸不同,即第240位A→T,第256位C→G,第259位A→G,第261位C→G和第270位T→A;这导致3个氨基酸改变:第62位Arg→Gly、第63位Asn→Glu和第66位Asn→Lys。结论该等位基因为新的HLA A等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLAA3308。
- 吕沁风章伟何吉王炜韩浙东朱发明严力行
- 关键词：人类白细胞抗原-A等位基因克隆测序
- 新的HLA-DRB1等位基因DRB11212的核苷酸序列分析被引量：5
- 2006年
- 目的验证一个新的HLA等位基因HLA-DRB11212的序列。方法采用盐析法抽提样本基因组DNA,利用HLA-DRB1组特异性引物PCR扩增先证者HLA-DRB1等位基因的第2外显子,PCR产物经割胶回收后进行测序分析,通过聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针方法验证测序发现突变点。结果先证者有两个HLA-DRB1等位基因,其中一个为HLA-DRB1090102,另一个HLA-DRB1等位基因,经BLAST验证为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(AY899825)。与最接近的DRB1120101等位基因序列相比,新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同,即第199位A→C,导致第67位氨基酸Ile→Leu。结论该等位基因为新的HLA-DRB1等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB11212。
- 朱发明章伟吕沁风何吉王炜韩浙东严力行
- 关键词：人类白细胞抗原-DRB1等位基因测序核苷酸
- 浙江汉族人群细胞因子基因多态性分析被引量：7
- 2007年
- 为了探讨浙江汉族人群13种细胞因子基因多态性的分布情况,采用PCR-SSP对100名汉族人群的IL-1α(T/C-889)、IL-1β(C/T-511,T/C+3962)、IL-1R(C/TPst-I1970)、IL-1RA(T/CMspa1-I1100)、IL-2(T/G-330,G/T+166)、IL-4(T/G-1098,T/C-590,T/C-33)、IL-4Rα(G/A+1902)、IL-6(G/C-174,G/Ant565)、IL-10(G/A-1082,C/T-819,C/A-592)、IL-12(C/A-1188)、γIFN(A/TUTR5644)、TGFβ(C/Tcodon10,G/Ccodon25)、TNFα(G/A-308,G/A-238)等细胞因子基因多态性进行分型。结果显示,(1)在检测的13种细胞因子中,TGF(Gcodon25)等位基因频率为1.00,未检测到TGF(Ccodon25)等位基因;(2)细胞因子等位基因频率大于0.95的有IL-1α(C-889)、IL-1β(C+3962)、IL-4(T–1098)、IL-6(G-174)、IL-6(Gnt565)、IL-10(A–1082)和TNFα(G-238);频率低于0.05的有IL-1α(T-889)、IL-1β(T+3962)、IL-4(G–1098)、IL-6(A-174)、IL-6(Ant565)、IL-10(G–1082)和TNFα(A-238);(3)IL-10高表达单倍型GCC频率为0.05,低表达单倍型ATA频率为0.735;TGFβ高表达单倍型TG频率为0.49,低表达单倍型CC频率为0;TNFα高表达单倍型AG和AA频率为0.055,低表达单倍型GG和GA频率为0.945。结果表明,浙江汉族人群细胞因子基因多态性较为丰富,具有地区性遗传特征。
- 章伟祝宏吕沁风王炜韩浙东朱发明严力行
- 关键词：细胞因子基因型单倍型汉族人群
- HLA-DRB1新等位基因DRB1＊1610的发现
- 2008年
- 目的对HLA新的等位基因HLA-DRB1＊11610的分析。方法采用商用DNA试剂盒抽提样本基因组DNA，利用HLA-DRB1组特异性引物PCR扩增先证者HLA-DRB1基因的第2外显子，PCR产物经割胶回收后进行测序分析。结果先证者有两个HLA-DRB1等位基因，其中一个为HLA-DRB1＊1202，另一个HLA-DRB1等位基因经BLAST验证为新的等位基因，新的等位基因序列已递交GenBank（DQ192647）。与最接近的DRB1＊1160201等位基因序列相比，新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同，即第227位A-T，导致第47位氨基酸Tyr→Phe。结论该等位基因为新的HLA-DRB1等位基因，被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊1610。
- 章伟朱发明王炜韩浙东严力行
- 关键词：等位基因测序
- 一例新的HLA-B等位基因B*5614的核苷酸序列分析被引量：18
- 2005年
- 目的研究HLA新的等位基因HLAB5614的分子基础。方法样本DNA抽提采用盐析法,利用PCR方法扩增先证者HLAB基因的第2～4外显子,PCR产物直接经TOPO转染克隆到质粒载体中分离其等位基因,对所得克隆进行第2～4外显子双向测序分析。应用序列特异性引物PCR方法证实测序所发现的突变。结果先证者样本克隆测序得到两个等位基因,其中1个等位基因为B1502,另一个经BLAST验证为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(AY601726,AY601727,AY601728)。与最接近的B5608等位基因序列相比,新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同,即第277位G→C,导致第93位氨基酸Gly→Arg。结论该等位基因为新的HLAB等位基因,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLAB5614。
- 朱发明吕沁风章伟张海琴傅启华严力行
- 关键词：HLA-B等位基因核苷酸序列
