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草莓miR390基因及其启动子的鉴定与表达分析被引量：5: 2014年; 【目的】明确草莓miR390基因的表达特性,为进一步揭示其与草莓白粉病抗性的关系奠定基础。【方法】采用PCR和qRT-PCR的方法,从栽培草莓‘全明星’中克隆了miR390基因及其启动子序列,系统研究了高盐、低温、不同培养方式、IAA处理等对草莓miR390基因表达的影响。【结果】克隆到的418 bp的草莓miR390基因序列中,包含97 bp的茎环结构及侧翼序列,并且高度保守的21 nt的成熟miR390序列位于茎环的5′端臂上。利用生物信息学软件分析草莓miR390基因的启动子序列发现,除了具有TATA/CAAT-box外,还含有spl、HSE等特异作用元件。定量RT-PCR结果表明,高盐能明显抑制草莓miR390的表达,而低温对其表达影响不大,相同条件下固体培养基比液体培养基更能促进草莓miR390的表达;与GA3等激素相比,IAA能显著增加草莓miR390的表达。【结论】采用IAA质量浓度为0.01 mg·L-1的固体培养基,最能增加草莓微繁殖苗miR390的表达量。; 李贺毛健鑫戚华彩张志宏纪明山; 关键词：草莓启动子定量RT-PCR

草莓MicroRNA研究进展: miRNA是一类真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,主要在转录后水平上负调控基因表达,在植物生长发育、胁迫应答等方面起着重要作用。本文综述了草莓miRNA的表达特性、检测技术等方面的进展,指出了草莓miRNA研究存在...; 李贺戚华彩张志宏纪明山; 关键词：草莓 MIRNA; 文献传递

草莓CO同源基因FaCO-2的克隆及表达分析: 2012年; 以草莓(Fragaria×ananassa Duch.)品种花姬为试材,通过PCR和RT-PCR方法克隆出草莓CO同源基因FaCO-2的CDS和DNA全长序列,在此基础上通过实时定量PCR的方法检测了其在草莓植株各组织和花器官中的表达。结果表明,该基因DNA序列长度为1 882 bp,含1个内含子,其CDS长度为1 146 bp,编码382个氨基酸,与其他物种的CO同源基因氨基酸序列有较高的同源性,生物信息学分析表明该蛋白分子量为42 021.69 D,等电点pI=5.49。实时定量RT-PCR结果表明,在不同的组织、花器官中,FaC0-2的表达量存在差异,在充分展开的较大叶片中的表达量最高;在4轮花器官中,只在萼片中表达,而其他花器官中不表达。; 刘月学邹冬梅李贺张志宏马跃代红艳; 关键词：草莓

草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析被引量：4: 2013年; 以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3′-和5′-RACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的Poly A尾巴及2个高度保守的ta-siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5′端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT-box外,还含有G-box、Cbox等特异作用元件。实时定量RT-PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。; 李贺毛健鑫戚华彩张志宏纪明山; 关键词：草莓

草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析: 2016年; micro RNA(miRNA)是来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,在转录后水平上负调控基因表达,在植物的生长发育和胁迫应答等方面起重要作用。以栽培草莓艳丽为试材,利用RT-PCR技术克隆草莓叶片中5种新miRNA的前体及靶基因,分析靶基因的结构特征与功能,结果表明:草莓mi R-6,mi R-12,mi R-13,mi R-14,mi R-29的前体长度分别为513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的茎环结构,其中mi R-12、mi R-13的成熟miRNA序列在茎环3'端臂上,mi R-6、mi R-14、mi R-29成熟miRNA序列在茎环的5'端臂上。mi R-14与mi R-29的靶基因分别为854bp和690bp,与森林草莓基因组对应序列一致性为98.72%和99.42%,其中mi R-29靶基因是GRP基因,编码143个氨基酸,推测mi R-29靶基因在草莓植株的胁迫响应中有重要调控作用。本研究丰富了草莓miRNA的研究,为揭示草莓miRNA的生物学功能奠定基础。; 张馨宇戚华彩董向向李贺张志宏; 关键词：草莓 MIRNA 靶基因功能分析

果树microRNA研究进展被引量：2: 2015年; micro RNA(mi RNA)是一类来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,通过互补配对原则作用于靶基因,从而调控植物的生长发育、激素信号以及胁迫响应等生物过程。扼要总结了果树mi RNA的生物学功能,分析了果树作物与模式植物mi RNA保守性的差异,从mi RNA的分离鉴定、表达检测及靶基因验证等方面介绍了果树mi RNA的研究方法,同时对该领域的研究进展及存在的问题进行讨论。; 李贺毛健鑫董向向张志宏纪明山; 关键词：果树 MICRORNA 保守性研究方法

草莓LFY同源基因的克隆及其表达分析被引量：5: 2012年; 以草莓(Fragaria×ananassa)品种‘花姬’为试材,通过PCR和RACE的方法克隆出LFY同源基因的cDNA全长序列,命名为FaLFY(GenBank收录号JN788260),通过定量PCR的方法检测了该基因在草莓植株各组织和花器官中的表达。结果表明FaLFY编码区长度为1236bp,编码412个氨基酸,与其他物种的氨基酸序列都有一定的同源性,其中与蔷薇科玫瑰的LEAFY-1同源性最高,达到88%。实时定量RT-PCR结果表明,在不同的组织、不同的花器官中FaLFY的表达量存在差异,其中在花芽中的表达量最高,在营养生长的组织中基本不表达,在成熟花器官中同样不表达,说明该基因在草莓的成花进程中发挥重要作用。; 刘月学邹冬梅李贺张志宏马跃代红艳; 关键词：草莓 LFY 同源基因

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国家自然科学基金(31101524)