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天津市卫生局科技攻关项目(13KG106)
作品数:
1
被引量:10
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相关作者:
白雪
隋涛
穆娟
李青
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相关机构:
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作者
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白雪
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2014
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免疫性血小板减少症患者血浆微小RNA差异表达谱的筛选与验证
被引量:10
2014年
目的:筛选免疫性血小板减少症( ITP)患者血浆差异表达微小RNA( miRNA)。方法收集2012年6月至2013年9月天津市第一中心医院血液科就诊的25例ITP患者及同期20名健康体检者血浆,采用miRNA芯片检测血浆中miRNA表达谱,筛选ITP血浆差异表达的miRNA。通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda进行潜在的靶基因预测,并进行基因本体和信号通路注释分析,探索可能与ITP发病相关的基因和信号通路,并用实时( real-time) PCR对差异表达的miRNA进行验证。结果根据基因芯片结果,发现ITP患者血浆中存在29个差异表达的miRNA,其中上调15个,下调14个,通过靶基因预测程序TargetScan和miRanda预测出608个潜在的靶基因,基因本体分析显示参与生物学过程的基因占78.12%(475/608);参与分子功能的基因占80.76%(491/608);参与细胞组分的基因占87.66%(533/608),富集分析显示P<0.05的基因本体有9个。通路分析显示157个信号通路与608个靶基因相关,富集分析P<0.05的信号通路有25个。其中值得特别关注的信号通路是钙离子信号通路和 T 细胞受体信号通路。 real-time PCR 显示 ITP 患者血浆中miRNA4778-5p、miRNA4800-5p 显著高于健康对照,而 miRNA4707-5p、miRNA4721、miRNA3620-3p、miRNA378i显著低于健康对照(均P<0.05),与芯片结果一致。结论 miRNA芯片初步筛选出ITP患者血浆miRNA差异表达谱,生物信息学分析提示钙离子信号通路和T细胞受体信号通路可能与ITP患者发病和进展有关。
隋涛
马立
李新
李青
白雪
穆娟
赵明峰
关键词:
微RNAS
计算生物学
免疫性血小板减少症
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