国家自然科学基金(20505018)
- 作品数：9 被引量：47H指数：5
- 相关作者：钱小红张养军蔡耘贾伟卢庄更多>>
- 相关机构：军事医学科学院北京蛋白质组研究中心北京理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划北京市科委重大项目更多>>
- 相关领域：理学生物学更多>>
- 另辟蹊径——串联质谱肽段断裂的新军“电子捕获解离”被引量：10
- 2007年
- 一种新型的串联质谱断裂方式——电子捕获解离,以其完全不同于其他串联质谱肽段断裂的机理,提供了全新的肽段序列标签。它集众多优点于一身:对蛋白质和多肽的主链断裂无偏好;高断裂覆盖度;优先断裂二硫键;保留翻译后修饰基团;中性丢失少、可区分亮氨酸和异亮氨酸等。这些特点使电子捕获解离充满魅力,特别在Top Down技术和翻译后修饰中具有广阔的应用前景。
- 贾伟应万涛钱小红
- 同系物标记结合凝胶电泳和质谱技术用于蛋白质N端肽鉴定及相对定量被引量：1
- 2008年
- 通过酸酐同系物标记蛋白质的N-末端,经过凝胶电泳分离,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪进行鉴定,建立了一种基于化学标记和质谱技术的、用于蛋白质的N-末端鉴定和相对定量新方法。标记后的蛋白质的N端肽以相差14 Da的成对峰形式在质谱中出现,而非N-末端肽则是以单峰呈现,从而实现了末端肽的特异性识别;通过端肽的信号强度对3种标记蛋白质的不同比例的混合溶液实现了相对定量分析。
- 赵丽艳周春喜张养军刘新蔡耘钱小红
- 关键词：化学修饰电泳分离蛋白质组学
- 磺化修饰结合离子交换色谱和生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段被引量：3
- 2009年
- 通过在肽段的N端引入磺酸基,从而使含组氨酸的肽段与其他肽段在pH<3.0的条件下产生电荷差异,建立了一种基于强阳离子交换色谱(SCX)结合生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段的方法,并以含有组氨酸的标准蛋白质为模型,进行了方法学考察。结果表明,经N端磺酸化后,含组氨酸的肽段能有效地被阳离子交换色谱富集,且在肽的N端引入磺酸基促进了肽的裂解,使之产生简单而信息丰富的二级质谱图,从而得到完美的质谱鉴定结果。这说明磺化修饰结合强阳离子交换色谱用于含组氨酸肽段的富集鉴定是可行的,且具有在蛋白质组研究中应用的潜力。
- 曹冬周春喜张养军韩春光邓玉林钱小红
- MALDI-TOF-MS靶上亲和富集鉴定磷酸肽的研究
- 对磷酸化肽段进行选择性富集,不仅可以增加可检测的磷酸化肽的绝对量,还能消除信号抑制效应,从而极大地提高磷酸肽的质谱检测灵敏度。本文利用磁性的Fe3O4／TiO2纳米粒子对 MALDI靶进行修饰以选择性富集磷酸化肽。 1 ...
- 谭峰张养军王京兰蔡耘钱小红
- 关键词：PROTEOMICSENRICHMENT
- 文献传递
- 基于生物质谱的蛋白质组学绝对定量方法研究进展被引量：12
- 2008年
- 蛋白质组学定量方法包括相对定量和绝对定量两部分。相对定量蛋白质组学(也称比较蛋白质组学)是指对不同生理病理状态下细胞、组织或体液蛋白质表达量的相对变化进行比较分析;绝对定量蛋白质组学是测定细胞、组织或体液蛋白质组中每种蛋白质的绝对量或浓度。目前蛋白质组学的绝对定量方法主要有基于内标法的蛋白质组学绝对定量方法和基于质谱数据统计分析的非标记方法。蛋白质组学定量的信息可以帮助了解蛋白质在相互作用网络中所起的作用;通过对临床生物标记物绝对量的分析,可以帮助直观地判断疾病的发生和发展过程,这对于临床诊断和疾病治疗都具有现实的指导意义。
- 曹冬张养军钱小红
- 关键词：生物质谱
- 麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解被引量：4
- 2009年
- 蛋白质的糖基化是最重要的翻译后修饰之一,与蛋白质结构和功能的关系密切。凝集素亲和色谱是蛋白质糖基化研究中很常用的工具,不同的凝集素可以对不同的单糖或寡糖有特异的富集作用。麦胚凝集素(W GA)由于其特异作用的糖型广泛存在而成为使用最多的凝集素之一。在本研究中,发现将W GA用于糖肽亲和富集会导致部分肽段的降解,从而导致后续的肽段序列分析的失败。本文用4种标准蛋白质对这种现象进行了验证,结果表明肽段的降解可以发生在多个位点,其中较多地发生在酪氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端。这一结果提示:在糖蛋白质组研究中,如果应用W GA富集糖肽并采用质谱进行鉴定,则采用半酶切或非特异性酶切的检索策略更为合适。
- 卢庄王京兰贾伟杨兵蔡耘邓玉林张玉奎钱小红
- 关键词：糖肽肽键蛋白质组学
- 稀土元素金属螯合标记结合Q-TOF-MS的定量蛋白质组新方法
- 近年来,定量蛋白质组学主要采用以质谱检测为核心的稳定同位素化学标记方法。但是受到稳定同位素试剂合成困难,价格高等因素的制约。Meares C．F．等人以化学性质很相近的稀土金属元素作为质量标签,提出了“元素标记亲和标签”...
- 刘慧玲张养军钱小红
- 文献传递
- 基于强阳离子交换色谱分离的磷酸化肽段富集策略被引量：5
- 2008年
- 为了在短时间内获得相对含量高的磷酸化肽段,以标准磷酸化蛋白质为模型对强阳离子交换色谱(SCX)分离磷酸化肽段体系的缓冲溶液和梯度设置进行了研究,并用酵母酶切肽段混合物考察了该路线在较复杂的样品中的应用。实验结果表明优化后的体系能够在30min内分离出磷酸肽段,而且非磷酸化肽段的干扰很少,这样便相对提高了磷酸化肽段在质谱仪中的响应强度,重要的是该体系可以对复杂样品进行很好的分离。这说明SCX用于规模化磷酸化肽段富集的策略是可行的。本研究为磷酸化蛋白质组学规模化分析提供了实用技术。
- 隋少卉王京兰卢庄蔡耘张养军蔚文峰钱小红
- 关键词：磷酸化位点蛋白质组学
- 串联质谱肽段断裂新技术--电子转移解离及其在蛋白质组学中的应用被引量：5
- 2008年
- 电子转移解离(ETD)作为一种新型的肽段序列测定技术,克服了电子捕获解离技术(ECD)中热电子传递和转移时间长的缺点。双离子源技术将供电子的蒽阴离子引入反应体系,直接快速地完成电子转移等一系列反应步骤,同时保留了ECD不断裂微弱的翻译后修饰化学键,得到近乎完全的包含了翻译后各种修饰的肽段序列信息的优势。电子转移解离技术能够分析相对分子质量较大的非酶切肽段,这对于Top-down技术和含有翻译后修饰的大相对分子质量肽段的鉴定具有重要意义。
- 刘科辉钱小红
- 关键词：蛋白质组学翻译后修饰磷酸化修饰
- 基于18O稳定同位素标记的磷酸化蛋白质组学定量方法的研究
- 生物体中蛋白的表达是高度动态的,即使同一细胞在不同生理或病理环境中,其蛋白表达也是不同的,这种差异蛋白往往是某些疾病发生的标志。利用比较蛋白质组研究技术,可以批量观察正常与疾病细胞(组织)在蛋白质表达谱上的差异,从整体水...
- 隋少卉王京兰贾伟卢庄刘金风宋丽娜蔡耘钱小红
- 关键词：QUANTITATIVE
- 文献传递
