重庆市自然科学基金(cstc2012jjA80025)
- 作品数：2 被引量：20H指数：2
- 相关作者：王雪峰周常勇苏华楠李中安黄爱军更多>>
- 相关机构：中国农业科学院柑桔研究所西南大学赣南师范大学更多>>
- 发文基金：重庆市自然科学基金公益性行业(农业)科研专项长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 中国柑橘黄龙病病原菌两个原噬菌体超变异基因遗传多样性被引量：9
- 2013年
- 【目的】通过原噬菌体区域高度变异的基因位点研究柑橘黄龙病病原菌亚洲种(‘Candidatus Liberibacter asiaticus’)的种群分化,探讨病原菌种群遗传多样性水平和遗传结构。【方法】基于2种原噬菌体类型(SC1和SC2)对应的超变异基因区域设计2对引物(Lap-TJ-F/Lap-TJ-R1和Lap-TJ-F/Lap-TJ-R2),对中国不同柑橘产区的224个‘Ca.L.asiaticus’株系进行PCR检测和序列分析。【结果】PCR扩增的条带类型呈多态性,具有4种条带类型(SC1-1、SC1-2、SC2-1和SC2-2),西南地区以SC1-1型为主,广东、广西地区以SC2-1型为主,福建、江西、浙江地区没有明显优势的扩增型。分析SC1-1和SC1-2对应序列表明,其差异系由于132 bp的卫星序列和24 bp的小卫星序列2种串联重复序列数不同引起,而SC2-1和SC2-2的差异系由原噬菌体内部基因重排引起。【结论】中国不同地理来源病原菌株系在原噬菌体区域具有较丰富的多态性,对该基因区域研究将有助于揭示中国‘Ca.L.asiaticus’种群的遗传多样性。
- 谭锦王雪峰苏华楠李中安周常勇
- 关键词：柑橘黄龙病原噬菌体
- 高质量提取柑橘样品中病原总核酸方法的建立被引量：12
- 2014年
- 针对柑橘老熟组织中富含多糖、多酚、色素和其它次生代谢产物的特点,以柑橘老叶老皮为试材,在传统CTAB提取法的基础上通过添加增效剂并优化配方,建立了一种快速、简便的提取植物老熟组织及其内部病原总核酸的CTAB-Triton提取法。新的提取液对细胞的裂解能力更强,且解决了传统CTAB溶液因低温析出而致DNA得率损失的弊端。比较了该法和微量葡聚糖柱纯化法制备模板时韧皮部杆菌的检出率,并用该法制备模板,分析了韧皮部杆菌在柚子叶片中的分布情况,及对其它几种柑橘病原菌进行PCR/RT-PCR检测。结果表明,CTAB-Triton方法能有效提取柑橘老熟叶片的DNA,所得DNA质量高,产量比商品化试剂盒大,提高了韧皮部杆菌的检出率,且可用于柑橘其他病原真菌、细菌,以及DNA或RNA病毒病害的PCR/RT-PCR检测,也可用于定量PCR检测和病原种群多态性分析。
- 苏华楠王雪峰黄爱军李中安唐科志周常勇
- 关键词：柑橘柑橘黄龙病DNA提取
