国家自然科学基金(20775052)
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- Prediction of human microRNA precursors using graph properties and random forest
- ＜正＞MicroRNAs（miRNAs） are short non-coding RNA molecules of～22 nucleotide（nt） in length that can affect stabili...
- Jiamin Xiao
- 关键词：MICRORNASPRECURSOR
- 文献传递
- 基于氨基酸残基网络的蛋白质折叠速率预测
- 蛋白质折叠是由整个分子的非共价键相互作用形成的复杂系统过程。探明蛋白质折叠速率的决定因素和具体机理是分子生物学的一个巨大的挑战。因此,预测蛋白质折叠速率对于理解各种不同的蛋白质折叠机理具有重要作用,如对于理解阿兹海默病（...
- 方亚平郭延芝文志宁李梦龙
- 关键词：QSAR复杂网络遗传算法
- 文献传递
- 基于HMLP参数的二肽logP值支持向量机预测模型
- 2008年
- 肽的亲(疏)水性在生物活性肽的合理设计和药物发现中是非常重要的参数。基于表征氨基酸性质的HMLP参数,分别用直接替代法和加和替代法表征肽段的结构信息,采用留一法交叉检验,利用支持向量回归(SVR)构建了36个二肽辛醇-水分配系数(logP)的预测模型(ε=0.001,σ=7.5,C=200和ε=0.001,σ=10,C=200),结果表明加和替代法要好于直接替代法,且其留一法交叉检验的复相关系为0.8768,其预测结果与实验值一致。但二者都说明了logP主要与肽的分子表面积和亲水指标有关,同时说明HMLP参数能够较好地表征氨基酸或肽链的结构信息。
- 印家健李梦龙
- 关键词：支持向量机
