广东省科技计划工业攻关项目(2008B030301278)
- 作品数：3 被引量：13H指数：3
- 相关作者：金士正王大明李桢程良红邹红岩更多>>
- 相关机构：深圳市血液中心大连医科大学更多>>
- 发文基金：广东省科技计划工业攻关项目广东省医学科学技术研究基金深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 中国人群人类白细胞抗原A、B和DRB1基因测序分型中模棱两可等位基因的鉴别被引量：5
- 2009年
- 背景:人类白细胞抗原基因测序分型中,当某些等位基因间的差异碱基位于测序范围外时,无法得到清晰的等位基因结果。目的:分析中国人群人类白细胞抗原A、B、DRB1基因测序分型中模棱两可等位基因的分布规律,探讨其在中华骨髓库大样本人类白细胞抗原A、B、DRB1基因的测序分型中的解决方案。设计、时间及地点:采用随机抽样方法对研究样本进行人类白细胞抗原A、B、DRB1基因的测序分型,并对其中的模棱两可等位基因进行验证性实验,于2006-01/2008-06在深圳市血液中心完成。材料:658名深圳骨髓库汉族供者乙二胺四乙酸盐抗凝血5mL。方法:采用聚合酶链式反应--测序分型方法对658名深圳骨髓库供者的人类白细胞抗原A、B和DRB1基因进行高分辨分型,并采用针对相应位点的高分辨聚合酶链式反应-序列特异性引物方法对其中由于碱基差异位于检测区外而产生的模棱两可等位基因进行鉴别。主要观察指标:模棱两可等位基因的分布及确认。结果:658份标本中,人类白细胞抗原A、B和DRB1三个基因座的模棱两可等位基因分别为9个(2种)、140个(5种)、406个(8种),占等位基因总数的14.06%(555/3948)。高分辨聚合酶链式反应-序列特异性引物鉴定结果显示,中国报道的DRB1*1401被全部确认为DRB1*1454;12例B*0705/B*0706中,有1例被确认为B*0706,其他13种等位基因的鉴定结果分别为A*6801、A*7402、B*2705、B*3501、B*4402、B*5801、DRB1*0101、DRB1*0406、DRB1*0803、DRB1*1101、DRB1*1201、DRB1*1302和DRB1*1502。结论:在中华骨髓库大样本人类白细胞抗原基因的测序分型中可以应用直接鉴别的方法区分模棱两可等位基因,但在临床移植前的高分辨确认试验中则需要采用实验方法进行精确分型。
- 程良红邹红岩金士正李桢王大明钱长江陈甜甜
- 关键词：人类白细胞抗原等位基因
- 等位基因频率在鉴别模棱两可HLA基因型中的应用价值分析被引量：7
- 2009年
- 本研究探讨采用等位基因频率直接鉴别模棱两可HLA基因型的应用价值。应用聚合酶链式反应(PCR)-测序分型方法(SBT)对658名汉族供者HLA-A、B、DRB1基因进行测序分型,并分别采用PCR-序列特异性引物法(SSP)和杂合性歧义引物分离法(HAPRs)对其中的模棱两可标本进行精确分型,进而利用等位基因频率计算真基因型的相对概率并与真实结果进行比对。结果表明:222个HLA-A,238个HLA-B和107个HLA-DRB1基因的模棱两可标本中,真基因型的相对概率高于95%的比例分别为99.5%(221/222)、95.8%(228/238)和97.7%(104/107);与PCR-SSP和HAPRs分型结果相比,3个基因座的吻合率分别为100%(222/222)、99.6%(237/238)和99.1%(106/107),仅有B*3501/5501和DRB1*1201/1504不同,其相对概率值分别为40.3%和2.1%。结论:在大规模供者HLA基因的PCR-SBT分型中,应用等位基因频率直接鉴别模棱两可基因型的方法不仅具有较高的准确率和可信度,而且更加经济、简便、快捷,但在移植前供、患者HLA基因的确认试验中必须慎重应用。
- 程良红邹红岩李桢金士正王大明高素青
- 关键词：等位基因频率PCR-SBT
- 中国北方汉族造血干细胞捐献者人类白细胞抗原-A、B、DRB1基因和单倍型高分辨水平的多态性研究被引量：4
- 2010年
- 目的从高分辨率水平研究中国北方汉族人群人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigens，HLA）-A、B、DRBI基因和单倍型的多态性。方法采用聚合酶链反应-测序分型方法（Polymerase Chain Reaction—Sequence Based Typing，PCR—SBT）对631名随机北方汉族个体的HLAA、B、DRB1基因进行序列分析，进而采用最大似然性方法计算等位基因和单倍型的分布频率。结果30个HLA—A等位基因中，频率高于0．05的5种常见等位基因A＊1101、A＊2402、A＊0207、A＊0201和A＊3303的频率总和为69．26％；64个HLA—B等位基因中，频率高于0．05的4种常见等位基因B＊4001、B＊4601、B＊5801和B＊1502的频率总和为38．11％；41个DRB1等位基因中，频率高于0．05的7种常见等位基因DRB1＊0901、DRB1＊1501、DRB1＊1202、DRB1＊0701、DRB1＊0803、DRB1＊1101和DRB1＊0405的频率总和为59．98％。499条AB、659条B—DRB1和2426条A—B-DRB1单倍型中，分别有38、39和31条单倍型频率高于0．005，其频率总和分别为59．82％、53．69％和32．38％，A＊0207-B＊4601、B＊4601-DRB1＊0901和A＊0207-B＊4601-DRB1＊0901分别为其最主要单倍型。结论中国北方汉族人群高分辨水平的HLA—A、B、DRBI等位基因和单倍型的多态性数据可作为人类学、法医学、移植配型和疾病相关性研究和应用的参考数据。
- 邹红岩金士正李桢蓝欲晓鲍自谦程曦王大明朱为刚程良红
- 关键词：人类白细胞抗原单倍型汉族
