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国家高技术研究发展计划(2013AA102503): 作品数：62 被引量：189H指数：7; 相关作者：冉雪琴王嘉福牛熙刘畅彭英林更多>>; 相关机构：贵州大学铜仁学院湖南省畜牧兽医研究所更多>>; 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金贵州省农业攻关项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>

香猪ADAMTS-1基因克隆及遗传效应分析: 2018年; 为了研究繁殖候选基因ADAMTS-1对香猪繁殖性状的调控机理，本研究以高产、低产两个香猪群体为实验材料，克隆ADAMTS-1基因全长，分析其存在的多态性位点，并对第七外显子5996位进行产仔数的遗传效应分析，同时检测两个香猪群体中该基因的拷贝数变异。结果表明，ADAMTS-1基因包含8个内含子和9个外显子区域。该基因第七外显子5996位存在多态性，香猪品种中以B等位基因为主，基因型频率BB〉AB，未检测到纯合AA基因型的个体，而西方猪种中以AA或AB型为主。高产和低产两个香猪群体中的ADAMTS-1基因的拷贝数都是复制型为主，但存在拷贝数的差异，高产香猪群体中的拷贝数增加较多，多为3个或3个以上拷贝，而低产群体中多为双拷贝，低产群体中的拷贝数明显低于高产群体。结果提示，ADAMTS-1基因的拷贝数变异以及第7外显子5996位的多态性可能是影响香猪繁殖力的重要因素之一。; 赵永霞许瑶喻昌燕谢健; 关键词：香猪 ADAMTS-1 繁殖拷贝数

Statistical considerations for genomic selection: 2017年; Genomic selection is becoming increasingly important in animal and plant breeding, and is attracting greater attention for human disease risk prediction. This review covers the most commonly used statistical methods and some extensions of them, i.e., ridge regression and genomic best linear unbiased prediction, Bayesian alphabet, and least absolute shrinkage and selection operator.Then it discusses the measurement of the performance of genomic selection and factors affecting the prediction of performance. Among the measurements of prediction performance, the most important and commonly used measurement is prediction accuracy. In simulation studies where true breeding values are available, accuracy of genomic estimated breeding value can be calculated directly. In real or industrial data studies, either trainingtesting approach or k-fold cross-validation is commonly employed to validate methods. Factors influencing the accuracy of genomic selection include linkage disequilibrium between markers and quantitative trait loci, genetic architecture of the trait, and size and composition of the training population. Genomic selection has been implemented in the breeding programs of dairy cattle, beef cattle, pigs and poultry. Genomic selection in other species has also been intensively researched, and is likely to be implemented in the near future.; Huimin KANGLei ZHOUJianfeng LIU

高产从江香猪资源调查及其FSH基因型分析被引量：10: 2014年; 对贵州省从江县养殖的从江香猪资源进行了全面的调查,发现当地存在特殊的高产从江香猪群体。对同龄的高、低产香猪的体尺进行对比,同时采用PCR分析2个群体的促卵泡激素β亚基(follicle stimulating hormone,FSHβ)的基因型,结果表明,高产从江香猪群体的产仔数明显高于低产群体,同时,从江香猪高产群体的体长、体重、胸围、腰围4项指标明显较高(P<0.05),纯合的AA基因型频率也较高。结果表明:高产从江香猪不仅产仔数多,同时生长速度较快,基因更为纯合。从江香猪高产群体的深入研究将为香猪资源的多方位开发利用奠定基础。; 杨廷模刘畅赵恒鑫袁菲田兵冉雪琴王嘉福; 关键词：从江香猪高产

ADCY 3和IGF 1基因结构变异与香猪繁殖性状的关联分析被引量：2: 2021年; 试验旨在研究卵巢类固醇生成信号通路中腺苷酸环化酶3(adenylatecyclase 3,ADCY3)、胰岛素样生长因子1(insulin like growth factor 1,IGF1)基因结构变异的遗传多样性及其与香猪母猪繁殖性状的相关性。采用PCR技术对269头香猪进行ADCY 3和IGF 1基因结构变异研究,利用在线软件计算遗传杂合度(He)、遗传纯合度(Ho)、有效等位基因数(Ne)及多态信息含量(PIC),并利用单因素方差分析、LSD法分析不同基因型与初产和经产香猪的总产仔数、产活仔数、初生重及乳头数等繁殖性状的关联性。结果显示,2个结构变异ADCY3-I_(1)-sv506和IGF1-I_(3)-sv302在香猪群体中均存在多态性,均有3种基因型:DD、DI和II,2种等位基因:D和I。其中,ADCY3-I_(1)-sv506中DI基因型为优势基因型(0.569),D为优势等位基因(0.601);IGF1-I_(3)-sv302中II基因型为优势基因型(0.717),I为优势等位基因(0.816)。ADCY3-I_(1)-sv506和IGF1-I_(3)-sv302多态信息含量(PIC)均为中度多态(0.25; 陈芳陈芳王志勇刘畅黄世会王嘉福王嘉福冉雪琴; 关键词：香猪繁殖性状

中小养殖规模条件下湘村黑猪养殖技术要点: 2019年; 湘村黑猪是湘村高科农业股份有限公司(以下简称湘村股份)和湖南省畜牧兽医研究所等单位以湖南地方品种桃源黑猪为母本、引进品种杜洛克猪为父本,经杂交合成和群体继代选育而培育的国家级新品种,2012年9月经国家畜禽遗传资源委员会审定为新品种,湘村黑猪新品种选育及推广示范在2014年获湖南省科技进步二等奖。; 龚赐成彭志豪崔清明张星杨文莲刘建彭英林; 关键词：养殖规模黑猪群体继代选育畜禽遗传资源

5个猪种HSD17B12基因结构变异SV225的多态性研究被引量：6: 2018年; 基于香猪基因组重测序结果,发现HSD17B12基因内含子3中存在一个254 bp的结构变异位点,命名为SV225。为探索SV225在不同猪群体间多态性分布以及基因型与香猪产仔数的关系,选取4个贵州地方猪种（香猪、柯乐猪、江口萝卜猪、黔北黑猪）和1个欧洲猪种（大白猪）为动物样本,利用PCR检测5个猪种中结构变异SV225的分布频率。结果显示,4个贵州地方猪种中均检测到3种基因型：插入型Ⅱ,杂合型DI与缺失型DD,SV225多态性丰富,大白猪仅检测到Ⅱ型。4个贵州地方猪群相比,香猪和柯乐猪的D等位基因占优势,江口萝卜猪和黔北黑猪中Ⅰ等位基因比例更高。经卡方检验,香猪、柯乐猪的D等位基因频率显著高于江口萝卜猪和黔北黑猪（P〈0.01）,且4个贵州地方猪种的D等位基因均显著高于大白猪（P〈0.01）。分析3种基因型与香猪产仔数的关系,发现Ⅱ型个体的第三胎平均产仔数比DI型多2.25头（P〈0.01）。本研究结果提示HSD17B12基因中的结构变异SV225与地方猪的产仔数可能存在一定的联系。; 卢圣菲冉雪琴刘畅牛熙李升黄世会王嘉福; 关键词：多态性产仔数

畜禽分子育种技术研究进展及趋势被引量：7: 2015年; 简要介绍了畜禽分子育种技术的背景、现状、趋势。阐述了分子育种技术在动物性状改造方面的应用范例,对各应用领域的进展进行了简略回顾,同时指出了分子育种技术在动物种业领域的主要任务和发展重点、对策措施与政策建议。; 王嘉福; 关键词：畜禽分子育种

从江香猪RYR1基因2个SNP位点的多态性被引量：1: 2015年; 兰尼定受体1(Ryanodine Receptor1,RYR1)基因的n等位基因是导致猪应激综合征的主效基因。为探明主产区从江香猪群体中是否存在n等位基因的污染,采用PCR-RFLP和AS-PCR方法对贵州从江香猪群体中n等位基因的多态性进行了检测。结果表明:从江香猪血液基因组DNA经扩增得到659bp的DNA片段,200头从江香猪的基因型均为纯合NN型,N等位基因频率为100%;对659bp扩增片段克隆测序发现1个新的变异位点(T1922C),导致成熟肽V641A替换。T1922C位点基因型均为TC杂合型,T等位基因和C等位基因频率均为50%。经三维结构预测,V641A替换位于RYR1蛋白SPRY1结构域的上游,T1922C变异对猪的兰尼定受体功能可能没有直接影响。; 王龙龙冉雪琴王嘉福; 关键词：从江香猪应激综合征

母猪日粮中添加低聚壳聚糖对哺乳仔猪生长、抗氧化能力和免疫功能的影响被引量：15: 2019年; 本试验旨在探讨母猪日粮中添加低聚壳聚糖对哺乳仔猪生长、血液生化指标、抗氧化能力及免疫功能的影响。选用24头胎次、体重和预产期相近的健康大白猪母猪,随机分为3组,每组8个重复,每个重复1头母猪。对照组饲喂基础日粮,Ⅰ、Ⅱ组饲喂分别添加50和100g/t低聚壳聚糖的基础日粮,试验从母猪妊娠第85天开始至分娩后第21天时结束。结果显示:(1)Ⅱ组哺乳仔猪腹泻率显著低于对照组和Ⅰ组(P<0.05),Ⅰ组与对照组差异不显著(P>0.05);与对照组相比,Ⅰ、Ⅱ组仔猪21日龄体重显著提高(P<0.05)。(2)Ⅰ组仔猪血浆乳酸脱氢酶(LDH)活性和甘油三酯(TG)浓度,Ⅱ组α-淀粉酶(α-AMY)、LDH活性和低密度脂蛋白(LDL)浓度均显著低于对照组(P<0.05)。(3)Ⅱ组哺乳仔猪血清超氧化物歧化酶(SOD)活性,皮质醇、白介素-10(IL-10)、白介素-1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)和干扰素-γ(IFN-γ)含量均显著高于对照组和Ⅰ组(P<0.05),而丙二醛(MDA)浓度显著低于对照组(P<0.05)。(4)低聚壳聚糖组母猪初乳中免疫球蛋白G(IgG)、IgA和IgM含量均显著高于对照组(P<0.05);Ⅰ组仔猪血清IgG和IgA含量、Ⅱ组仔猪血清IgA含量均显著高于对照组(P<0.05)。综上所述,母猪日粮中添加一定量的低聚壳聚糖能够提高哺乳仔猪的抗氧化能力、增强机体免疫能力、降低腹泻率,从而提高哺乳仔猪生长性能。; 刘莹莹任慧波任慧波邓缘张星陈晨邓缘朱吉罗璇; 关键词：低聚壳聚糖哺乳仔猪血液生化指标

香猪基因组外显子SNPs检测及繁殖和体型性状候选基因分析: 2021年; 为从基因组水平上探究香猪性成熟早、产仔数少、体型小的分子机理,本研究下载与香猪在繁殖和体型性状方面有明显差异的梅山猪、杜洛克猪的重测序数据作为参照,对26头香猪、24头梅山猪和24头杜洛克猪的重测序数据进行SNPs检测和等位基因频率差值分析,筛选香猪基因组外显子上与梅山猪、杜洛克猪高度分化的SNPs位点,并使用AS-PCR方法和Sanger测序方法统计其中8个SNPs位点的群体等位基因频率。最后,对含有高度分化SNPs位点的基因进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果显示,SNPs检测获得香猪基因组外显子上SNPs共236710个,包括193个终止密码子丢失、1238个终止密码子获得、90945个错义SNPs和144334个同义SNPs。得到1046个香猪高度分化SNPs,包括429个错义SNPs、2个终止子丢失、6个终止子获得和609个同义SNPs,影响524个蛋白质编码基因;并发现X染色体上44-58 Mb的一段富含高度分化SNPs的热点区域。群体等位基因频率验证结果与重测序结果一致,鉴定了8个位点均为香猪与梅山猪、杜洛克猪高度分化的SNPs。对524个含有高度分化SNPs的基因进行GO和KEGG分析,富集到卵母细胞减数分裂、雌激素信号途径等繁殖相关通路;GO功能注释到细胞内雌激素受体信号、纤毛运动等繁殖相关条目,骨骼系统形态发生、骨骼发育、成骨细胞分化等体型相关条目。得到含有香猪高度分化SNPs的18个繁殖性状候选基因PTGFR、TRO、DNAH17、PKDREJ、KAT8、DNAI2、VDR、TEX14、QSOX1、AR、WNK3、ADCY3、SPEF1、MIGA2、SLC2A8、PSMF1、TBC1D20、IFT 172和7个体型相关基因IBSP、NR6A1、HSPG2、TARS、PDZD2、FGF4、AMER 1,可能是决定香猪性成熟早、产仔数少、体型小的关键基因。; 孙凌翥冉雪琴刘畅刘畅牛熙王嘉福; 关键词：SNPS 香猪繁殖体型

国家高技术研究发展计划(2013AA102503)

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