福建省自然科学基金(2011J05022)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：福建师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省自然科学基金福建省高校杰出青年科研人才培育计划项目更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 丙氨酸二肽分子二级结构与振动光谱特性被引量：2
- 2012年
- 利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽的二级结构布居特性以及体系势能变化.引入对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带),借助其光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明:丙氨酸二肽分子处于C7eq构型(Φ/Ψ=-80°/80°)时具有最低能量值,且分子易形成β折叠、PPII、C5及C7等能量较低的稳定构型.通过简正模式分析,得到分子3N-6个振动模式的吸收光谱,并通过势能分布分析方法对分子骨架上酰胺振动吸收带的特征振动模式进行了指认.重点考察分子骨架上酰胺-I带振动光谱参数与分子构型变化之间的相关性,建立振动光谱参数与蛋白质二级结构之间的联系,为在化学键水平上研究蛋白质的结构及其发挥作用的机制提供科学依据.
- 蔡开聪留珊红刘的文林深
- 关键词：从头算振动光谱
- 振动探针用于丙氨酸二肽在氯仿溶剂中的结构研究
- 2014年
- 利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽在氯仿溶剂环境下的二级结构布居特征.借助对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带)的光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明,丙氨酸二肽分子倾向于形成β折叠、PPⅡ、C7eq和C5等构型.简正模式分析结果表明分子内酰胺振动带对分子骨架变化十分敏感,因此可以将酰胺振动吸收带作为结构探针研究蛋白质分子的二级结构信息.
- 蔡开聪杜芬芬刘佳郭碧芬苏婷婷
- 关键词：从头算振动光谱
