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福建省自然科学基金(2011J05056)

作品数:2 被引量:9H指数:2
相关作者:黄小菁陈宇航杨菁肖冬来陈丽华更多>>
相关机构:福建省农业科学院更多>>
发文基金:福建省自然科学基金福建省农科院青年科技人才创新基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学

主题

  • 2篇正红菇
  • 2篇红菇
  • 1篇多样性
  • 1篇遗传多样性分...
  • 1篇真菌多样性
  • 1篇真菌群落
  • 1篇群落
  • 1篇菌根
  • 1篇菌根菌
  • 1篇PCR
  • 1篇ITS
  • 1篇变性梯度凝胶...

机构

  • 2篇福建省农业科...

作者

  • 2篇肖冬来
  • 2篇杨菁
  • 2篇陈宇航
  • 2篇黄小菁
  • 1篇陈丽华

传媒

  • 1篇福建农业学报
  • 1篇热带作物学报

年份

  • 2篇2013
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
福建正红菇遗传多样性分析被引量:5
2013年
以采自福建省山区的正红菇Russula griseocarnosa为研究材料,进行ITS(internal transcribed spacer)、RPB2(the second largest subunit of the nuclear RNA polymerase enzyme II)保守区段克隆测序和序列同源性比对。将从GenBank中获得的部分红菇属物种ITS和RPB2序列与正红菇序列通过最大简约法进行系统发育分析。基于ITS序列构建的系统发育树表明,福建正红菇与云南大红菌Russula griseocarnosa X.H.Wang,Zhu L.Yang&Knudsen,sp.nov.间序列差异较小,亲缘关系较近,以99%的支持率聚为一簇。福建正红菇与欧洲红菇Russula vinosa及玫瑰红菇Russula rosea间序列差异较大,亲缘关系较远,在系统发育树上聚为不同分枝。基于RPB2序列构建的系统发育树也表明福建正红菇与云南大红菌聚为一簇(支持率94%),而与玫瑰红菇聚为不同分支。
肖冬来陈宇航杨菁黄小菁
关键词:正红菇菌根菌ITS
利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性被引量:4
2013年
以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,GroupⅠ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda)。
肖冬来陈丽华陈宇航杨菁黄小菁
关键词:正红菇真菌多样性
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