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嗜热酯酶EstTs1的远源三维结构模建及分子对接: 2011年; 利用Phyre网络服务器,构建嗜热酯酶EstTs1的三维结构,并通过分子动力学优化构型,得到了可靠的构型.分子对接研究表明,p-硝基苯基丁酸酯是EstTs1的最适底物,其大小正适合EstTs1的活性口袋.Thr111是底物与酶结合的重要残基,与底物形成了氢键;Ser85是重要的催化残基.; 詹冬玲邵鸿泽韩葳葳刘景圣; 关键词：分子对接

Sirt1及Sirt2与活性分子INA的作用机制研究被引量：2: 2013年; 应用分子模拟理论与方法研究了人类沉默信息调节因子2相关酶类Sirtuin家族成员Sirt1及Sirt2与一种活性分子(命名为INA)的作用机制.同源模建了Sirt1的三维结构,通过分子对接手段得到Sirt1(NAD+)-INA及Sirt2(NAD+)-INA的两种复合物体系,进行了分子动力学模拟.并且分别计算了两种体系中关键氨基酸残基与INA的结合自由能值,由此推测出Sirt1(NAD+)-INA、Sirt2(NAD+)-INA体系结合位点分别为Val72,Ser73和Arg272及Phe235,Leu264和Gly305,确证了两种体系的结合模式.模拟结果表明,在Sirt1(NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较近,可以相互作用,具有较高活性;在Sirt2(NAD+)-INA体系中,INA与催化底物NAD+距离较远,与在Sirt1体系中比较,INA对Sirt2体系的活性较弱,结果与实验一致.本文的研究,对今后以去乙酰化酶Sirt1,Sirt2为靶点的新药开发具有一定指导意义.; 陈晓光赵晓杰王嵩王丽萍李惟孙家钟; 关键词：分子模拟 SIRT1

NCO自由基与H反应的机理和动力学被引量：1: 2013年; 研究采用密度泛函理论中的B3LYP方法,在6-311G(d,p)基组水平下,优化反应物、产物、中间异构体和过渡态分子,得到可靠的几何构型和频率.通过内禀反应坐标计算,确认了四条反应通道,并且以通道中中间体、过渡态相对能量为基础,讨论了各反应通道的优先顺序.在反应中,H和NCO的初始连接有两种方式,H分别进攻NCO两端的N和O,进行无势垒加合,得到两个低能中间体HNCO和HOCN.HNCO中∠NCO从172.9°减小到69.0°,生成一个相对能量较高但N—C键较长的中间体,该中间体发生N—C键断裂生成主要产物P1(CO+NH).从HNCO和HOCN出发均可生成次要产物P2(CN+OH),而从HNCO出发还有另一条生成产物P3(CH+NO)的路径,反应沿该路径进行的可能性较小.; 赵晓杰牟丹张浩王嵩; 关键词：NCO H 势能面

人参β-香树素合成酶同源模建及高通量虚拟筛选抑制剂的研究被引量：6: 2012年; 人参β-香树素合成酶(β-AS)能催化氧鲨烯环化生成齐墩果烷型皂苷,从而减少植物固醇的生成量,有助于获得高效的人参皂苷.因β-AS的三维结构是未知的,我们以氧鲨烯环化酶为模板,对β-AS进行三维结构搭建.以抑制剂10-aza-10,11-dihydro-2,3-oxidosqualene为先导化合物,通过AutoDockvina进行分子对接,选取结合能量最低的新化合物进行研究.研究结果表明:新抑制剂8442257比先导化合物10-aza-10,11-dihydro-2,3-oxidosqualene的抑制效果更好.Leu287与新抑制剂结合时能量最低,是重要的残基位点;Ser413和Trp613通过氢键与新抑制剂结合,在抑制过程中起重要作用.我们的研究结果为人参β-香树素合成酶抑制剂的研究提供一个有利的依据.; 詹冬玲王嵩韩葳葳刘景圣; 关键词：同源模建分子对接

Pt掺杂碳纳米管吸附气体小分子的DFT计算被引量：9: 2010年; 利用B3LYP/LANL2DZ方法对Pt掺杂(5,5)单壁碳纳米管(SCNT)吸附SO2,HCHO和CO2三种气体小分子进行了详细的理论计算.通过分析吸附气体分子前后Pt掺杂SCNT的几何结构、电子态密度变化、前线轨道成分HOMO-LUMO能隙和红外光谱特征,给出了SCNT-Pt是否有潜力检测这三种气体分子的理论依据.; 尚威王文举王嵩; 关键词：单壁碳纳米管气体传感器过渡金属掺杂

极光激酶A抗癌抑制剂的高通量筛选及对接研究被引量：1: 2011年; 极光激酶(aurora kinases)A是负责调控细胞有丝分裂的一类重要的丝氨酸/苏氨酸激酶.用极光激酶A的一种抑制剂H-89作为先导化合物,通过AutoDock vina软件进行虚拟筛选,选取能量打分最低的抑制剂(命名为H-89-1)做进一步的深入研究.理论对接研究揭示H-89-1是一种比H-89更好的抑制剂,并且Thr217和Arg137是H-89-1和酶作用中的重要残基,因为它们和H-89-1形成了氢键.我们的研究将为极光激酶A专有抑制剂的设计提供可靠的理论线索.; 杨锐韩葳葳王嵩; 关键词：分子对接抑制剂

醇溶性聚芴作为电子注入层对绿光聚合物发光器件性能的影响: 2010年; 将醇溶性含膦酸酯基团的聚芴作为电子注入材料应用到聚合物电致发光器件中,并采用高功函金属铝作为阴极获得了高效率的聚合物电致发光.对聚合物发光器件光电性能的研究结果表明,与传统的Ca/Al阴极聚合物器件相比,以膦酸酯聚芴/Al为阴极的聚合物器件的流明效率达到了15.8cd/A,提高了25%以上,同时器件的工作电压降低了57%。; 牛效迪王虹苏王嵩刘静波; 关键词：聚合物电致发光聚芴膦酸酯

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国家教育部博士点基金(20090061120101)