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教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-04-0500)

作品数：10 被引量：142H指数：8
相关作者：张天真郭旺珍朱一超郭媖张燕洁更多>>
相关机构：南京农业大学更多>>
发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划更多>>
相关领域：农业科学更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 10篇农业科学

主题

  • 5篇陆地棉
  • 5篇棉花
  • 5篇克隆
  • 4篇纤维
  • 4篇基因
  • 3篇CDNA
  • 2篇优质纤维
  • 2篇纤维品质
  • 2篇基因芯片
  • 2篇合成酶
  • 2篇分子标记
  • 2篇QTL
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白酶抑制剂
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇渝棉1号
  • 1篇伸长
  • 1篇染色
  • 1篇染色体

机构

  • 10篇南京农业大学

作者

  • 10篇郭旺珍
  • 10篇张天真
  • 4篇朱一超
  • 2篇张燕洁
  • 2篇郭媖
  • 1篇王长彪
  • 1篇蔡彩平
  • 1篇贺亚军
  • 1篇佘义斌
  • 1篇吕俊宏
  • 1篇胡文静
  • 1篇张晓阳
  • 1篇房栋
  • 1篇王娟

传媒

  • 6篇作物学报
  • 2篇棉花学报
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇科学通报

年份

  • 1篇2009
  • 4篇2008
  • 2篇2007
  • 3篇2006
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
棉花纤维伸长发育期的基因表达分析被引量：18
2006年
利用cDNA芯片技术分析陆地棉显性单基因突变的李氏超短纤维突变体(Li1li1)和其野生型(li1li1)纤维发育4 DPA(day post anthesis)的基因差异表达情况。RT-PCR验证4DPA芯片结果,得到15个差异表达的EST(expressed sequencetag),其中9个下调表达,即野生型(li1li1)中的表达量低于李氏超短纤维突变体(Li1li1)中的表达量;6个上调表达,即野生型(li1li1)中的表达量高于李氏超短纤维突变体(Li1li1)中的表达量。推测这些基因在棉花纤维伸长发育时期起了比较重要的作用。
朱一超张天真贺亚军郭旺珍
关键词：棉花纤维CDNA芯片基因表达
一个新的棉花MYB类基因(GhTF1)的克隆及染色体定位分析被引量：9
2008年
MYB类转录因子是指含有MYB结构域的一类转录因子,广泛参与植物发育和代谢调节。含2个MYB结构域的R2R3类MYB转录因子在植物体内主要参与次生代谢的调节和控制细胞的形态发生。从优质材料7235不同发育时期的棉纤维混合cDNA文库中克隆了一个棉花MYB转录因子基因GhTF1(GenBank登录号:EF651783)。该cDNA序列长1115bp,其开放读码框长度为771bp,编码256个氨基酸。表达特征分析表明,该基因在陆地棉7235不同组织中均表达,但表达量不同,特别在开花前1d,开花后8d和11d的纤维细胞中优势表达。该基因在二倍体棉种非洲棉和雷蒙德氏棉中开放读码框区的序列较保守,但在非编码区差异较大,在内含子区存在大片段插失和碱基替换现象。Southern杂交结果表明该基因在陆地棉基因组中存在2个拷贝,推测A、D亚组中各有1个拷贝。利用海7124和TM-1两亲本配置的BC1作图群体,将GhTF1定位在染色体10上。
房栋吕俊宏郭旺珍张天真
关键词：棉花MYB基因克隆基因定位
雷蒙德氏棉EST-SSRs分布特征及开发与利用被引量：30
2006年
微卫星或简单重复序列（simple sequence repeats，SSR）存在于表达序列标签（expressed sequence tags，ESTs）中．为了在棉花中开发EST—SSR功能性标记，利用生物信息学方法对NCBI网上公开的63485条雷蒙德氏棉（Gossypium raimondii Ulbrich）ESTs序列进行EST-SSRs特征分析．剔除冗余序列，得到非冗余序列58906条．在非冗余序列中发现含不同重复基元SSRs的EST序列有2620条，共2818个EST-SSRs，EST-SSRs序列的频率是4．45％，平均相隔14．8kb出现一个SSR．在1～6bp的重复基元中，三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高（38．31％），其次是二核苷酸（24．09％）、单核苷酸（23.35％）．对所有的重复基元类型进行统计分析发现，所占比例最大的是A/T（18．67％），其次是AT／TA（14．83％）．在复合型（compound）中发现三核苷酸串联三核苷酸的重复基元出现频率最高，为48．65％．利用Prime3软件，设计了1554对EST-SSRs引物，随机选用300对对本室四倍体作图亲本陆地棉TM-1和海岛棉海7124进行多态性检测，其中129对有多态性，多态性频率为43％．这些EST-SSRs将有效用于不同棉种间的分布特征比较及染色体定位等方面研究．
王长彪郭旺珍蔡彩平张天真
关键词：EST-SSRS分子标记多态性
与棉纤维发育相关基因GhSAMS、GhNLP的克隆、鉴定与定位被引量：1
2008年
【目的】克隆陆地棉纤维伸长发育相关的基因,并做初步功能验证。【方法】以陆地棉李氏超短纤维突变体Li1li1自交后代野生型li1li1和超短纤维突变体Li1li1开花后4d的胚珠纤维复合体为探针,通过基因芯片筛选优质材料7235棉纤维伸长、次生壁加厚不同发育时期混合cDNA文库,分离出两个在两种材料中差异表达的cDNA序列。【结果】测序结果表明,两个cDNA均为完整的基因序列,分别命名为GhSAMS(GenBank登录号:EF643509),GhNLP(GenBank登录号:EF643508)。RT-PCR分析表明:开花后4d,GhSAMS、GhNLP在陆地棉李氏野生型li1li1纤维中的表达量低于无纤维突变Li1li1。Southern杂交结果表明两个基因在陆地棉基因组中都存在少数拷贝。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的140个BC1作图群体,将GhSAMS和GhNLP分别定位在染色体14(D2)和19(D5)上。【结论】克隆了两个棉纤维伸长发育相关基因GhSAMS和GhNLP,推测其高表达阻止纤维伸长生长,为进一步分析功能和用于分子育种打下基础。
张燕洁朱一超郭旺珍张天真
关键词：陆地棉基因芯片S-腺苷甲硫氨酸合成酶
渝棉1号优质纤维QTL的标记与定位被引量：40
2007年
利用陆地棉遗传标准系TM-1和优质品种渝棉1号组建了（TM-1X渝棉1号）R和R2，3分离群体。通过5544对SSR引物对亲本进行筛选，获得178个多态性标记，用其中138个构建了总长为959．7cM的遗传图谱，覆盖棉花基因组的19％。应用复合区间作图法分析了该组合的R单株和R：，家系纤维品质性状，共检测到12个纤维品质数量性状基因座（QTL），包括1个纤维长度的、4个纤维强度的、3个马克隆值的、3个整齐度的和1个伸长率的，分别解释各性状表型变异的6．1％、5．3l％～14．62％、7．88％～19．17％、7．4％～11．71％和8．26％。研究还发现Chr．23和Chr．24是优质纤维QTL的富集区。
王娟郭旺珍张天真
关键词：陆地棉纤维品质QTLS
棉纤维发育相关基因GhCHS、GhCPI的克隆与鉴定被引量：1
2009年
以陆地棉李氏超短纤维突变体Li1li1自交后代野生型li1li1和超短纤维突变体Li1li1开花后4 d的胚珠纤维的复合体的RNA为探针,通过基因芯片的方法筛选优质材料7235棉纤维伸长、次生壁加厚不同发育时期混合cDNA文库,分离出两个在两种材料中差异表达的cDNA序列,分别命名为GhCHS(GenBank登录号:EF643506)和GhCPI(GenBank登录号:EF643507)。RT-PCR分析表明:开花后4 d,GhCHS,GhCPI在陆地棉李氏野生型li1li1纤维中的表达量低于超短纤维突变体Li1li1。Southern杂交结果表明两个基因在陆地棉基因组中都存在两个拷贝。
张燕洁朱一超郭旺珍张天真
关键词：陆地棉基因芯片查尔酮合成酶半胱氨酸蛋白酶抑制剂
两个陆地棉过氧化物酶cDNA的克隆和鉴定被引量：11
2007年
从陆地棉优质材料7235不同发育时期的棉纤维混合cDNA文库中分离出2个与过氧化物酶相关的cDNA克隆GhPOD1和GhPOD2。GhPOD1是利用5′RACE技术得到的长度为1 489 bp的完整cDNA序列,开放读码框长度为816 bp,编码271个氨基酸,BLAST结果表明,该基因和拟南芥中已报道的过氧化物酶基因同源性最高。GhPOD2是通过对cDNA克隆直接测序获得,其插入片段长度为1 355 bp,开放读码框长度为999 bp,编码332个氨基酸,BLAST结果表明,该cDNA序列与已报道的1个陆地棉纤维过氧化物酶基因(pod8,L08199)氨基酸相似性达99%。RT-PCR分析表明GhPOD1是一个组成性表达的基因,而GhPOD2在根中不表达,而在茎、叶、胚珠和纤维细胞中表达,并从开花后14 d起,在纤维细胞中表达量逐渐减弱。进化树分析显示GhPOD1与已知的11个过氧化物酶基因距离都较远,是1个新的陆地棉过氧化物酶基因;GhPOD2与相似性高的pod8在同一分支,但与其余的第3类过氧化物酶也有较大的差异。Southern杂交结果表明这两个基因在陆地棉基因组中都存在2个拷贝,推测A、D亚组中各有1个拷贝。GhPOD1和GhPOD2的棉花转基因功能验证正在进行。
郭媖郭旺珍张天真
关键词：棉花过氧化物酶克隆
一个新的棉纤维表达蛋白cDNA的克隆、表达及功能初步分析被引量：14
2006年
通过陆地棉高品质纤维种质系7235的棉纤维混合cDNA文库随机测序,得到一个开放阅读框(open reading frame,ORF)完整的棉纤维表达蛋白(GhCFE,GenBank登录号:DQ073045)cDNA序列。该cDNA序列全长1274bp,最大的ORF为996bp,编码332个氨基酸,其理论上的等电点pI=6.14,分子量Mw=37.7KD。它的N-末端存在一个长度为27个氨基酸残基的信号肽。RT-PCR分析表明,该基因在根、茎中不表达,在叶片中微弱表达,在不同发育时期的纤维细胞中均表达,且在纤维伸长期表达量最高。进化树显示GhCFE与已报导的3个棉纤维表达蛋白cDNA有很高的同源性。通过构建酵母表达载体,发现该基因对酵母细胞的伸长和细胞壁加厚没有显著影响。利用pBI121质粒构建了含35S启动子的正义表达载体和含棉纤维特异表达启动子E6的正义和反义表达载体,正在通过农杆菌介导的遗传转化,开展该基因的功能验证。
郭媖郭旺珍张天真
关键词：棉花
棉花腺苷高半胱氨酸水解酶cDNA的克隆、表达及染色体定位被引量：13
2008年
腺苷高半胱氨酸水解酶是调节细胞内甲基反应的一个关键酶。通过对高品质纤维陆地棉品系7235的棉纤维混合cDNA文库随机测序,得到一个棉花腺苷高半胱氨酸水解酶(编号:g073a03a,GhSAHH)的cDNA序列。该cDNA序列长1598bp,利用5′RACE技术得到上游318bp的片段,序列拼接获得全长为1916bp的cDNA序列,ORF为1458bp,编码485个氨基酸,其理论上的等电点pI=5.69,分子量MW=53.2kD。该基因在不同组织、器官中均表达,在根、下胚轴和纤维发育早期优势表达。根据Southern杂交结果推测GhSAHH基因在陆地棉基因组中为单拷贝。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的含140个单株的BC1作图群体,将GhSAHH基因定位在第20号染色体上。
佘义斌朱一超张天真郭旺珍
关键词：棉花克隆
陆地棉优质纤维QTL的分子标记筛选及优质来源分析被引量：20
2008年
利用陆地棉优质品系7235、渝棉1号做亲本,以7235×渝棉1号的F2与F2:3分离群体为材料,开展不同来源棉花高强纤维QTL微卫星标记筛选,为进一步进行优质纤维QTL聚合育种提供基础。通过5514对SSR引物对亲本进行多态性筛选,获得117个多态性标记,用其中80个标记构建了总长为1147.8cM的遗传图谱;应用复合区间作图法分析了该组合的F2单株和F2:3家系纤维品质性状,共检测到36个纤维品质数量性状基因座(QTL),其中与纤维长度、比强度、细度、伸长率及整齐度相关的QTL各6、8、7、8和7个,分别解释各性状表型变异的3.4%～14.4%、5.0%～42.4%、6.5%～11.7%、5.1%～19.4%和6.9%～14.0%。通过分析来源于7235和渝棉1号高强QTL的染色体分布,表明两亲本在D7、D8、D9染色体上都存在控制纤维比强度的QTL,其中存在于D7和D8染色体上来自双亲的QTL紧密连锁,成簇分布在染色体上的一定区间内。而在D7和D9染色体上也发现双亲完全相同的优质QTL,其优质供体可能来自陆地棉优质品系PD4381。进一步分析了获得的QTL在聚合育种中的应用潜力。
胡文静张晓阳张天真郭旺珍
关键词：陆地棉纤维品质QTL
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