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陕西省社会发展科技攻关项目(2010K01-132)
作品数:
2
被引量:14
H指数:2
相关作者:
陈葳
薛梅
李旭
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相关机构:
西安交通大学医学院第一附属医院
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发文基金:
国家自然科学基金
陕西省社会发展科技攻关项目
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相关领域:
医药卫生
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医药卫生
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机构
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薛梅
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陈葳
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李旭
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西安交通大学...
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1篇
2014
1篇
2013
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肿瘤相关长非编码RNA的表达及调控机制的研究进展
被引量:2
2014年
肿瘤相关性长非编码RNA的研究尚处于方兴未艾的阶段,其表达与肿瘤侵袭、转移及预后有着密切的关系,但是有关其转录调控的研究仍然比较少见。本文介绍了长非编码RNA的组织细胞表达、与肿瘤侵袭转移和患者预后的关系、转录调控和表观遗传学调控研究的现状,探讨了本研究领域将来的发展方向。
陈葳
薛梅
关键词:
转录
人UCA1基因转录调控的生物信息学分析与鉴定
被引量:12
2013年
目的生物信息学分析与鉴定人类膀胱癌特异性表达的UCA1基因转录调控作用原理。方法运用CpG岛预测软件EMBOSS CpGplot、CpG Island Searcher、Methprimer、CpG finder对UCA1基因启动子CpG岛进行分析。利用转录因子预测软件MatrixCatch和TFSEARCH对UCA1基因核心启动子区可能结合的转录因子进行分析。染色质免疫沉淀技术对所预测到的转录因子进行分子生物学实验验证。结果 CpG岛预测发现UCA1基因全长启动子区中不存在CpG岛,因此UCA1基因属于组织特异性基因与前期研究报道结果一致。生物信息学预测及筛选发现UCA1基因核心启动子存在4个与肿瘤关系密切的转录因子。根据预测结果选取2个转录因子利用染色质免疫沉淀实验鉴定,确定1个转录因子可与UCA1基因核心启动子区结合。结论 UCA1基因启动子区无CpG岛存在,该基因核心启动子区可能与多种转录因子结合,并确定转录因子c-Myb可以与UCA1基因核心启动子区结合。
薛梅
李旭
陈葳
关键词:
生物信息学
转录调控
转录因子
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