国家自然科学基金(30860167)
- 作品数：3 被引量：23H指数：2
- 相关作者：徐小彪廖娇黄春辉辜青青曲雪艳更多>>
- 相关机构：江西农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 植物矮化相关基因研究进展被引量：9
- 2011年
- 矮化植株株型紧凑,冠幅小,抗倒伏,且生产管理方便,丰产性能好,矮化育种是植物育种的发展趋势。国内外学者对植物矮化的机理、矮化基因、矮化育种等进行了比较深入的研究。我们对植物矮化的遗传特点、分子标记在矮化基因研究上的应用、矮化基因的定位、矮化基因的分离与克隆、矮化转基因等方面的研究进展进行了概述。
- 廖娇黄春辉辜青青徐小彪
- 关键词：矮化基因分子标记基因定位克隆植物
- 猕猴桃EST序列的SSR信息分析(摘要)(英文)
- 2009年
- [目的]通过筛查猕猴桃EST数据库中的SSR重复序列,为开发出新型的猕猴桃EST-SSR标记和分子生物学研究奠定理论基础。[方法]从NCBI公共数据库中最新公布的猕猴桃表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)中随机抽取56 400条序列,应用SSRHunter软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列。搜索的标准是:二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸最少重复次数分别为7次、5次、4次、4次、3次,包括复合型微卫星。微卫星的重复次数越多,相应的检验出等位基因数目就越多。[结果]从猕猴桃EST序列中获得了7 939条SSR,其中包括二核苷酸重复5 131条(64.63%),三核苷酸重复1 237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%),六核苷酸重复890条(11.21%)。大约每2.48 kb长度的单一基因序列中即存在1个SSR,即平均7个单一基因中存在1个SSR。在二核苷酸重复序列中,AG/CT共分布4 654条(90.70%)。在三核苷酸中,较为丰富的3种重复基元是ACC/GGT,AAG/CTT和CGC/GCG,共分布817条,它们占三核苷酸重复中各重复基元的66.04%。在其他基元中,还包括AGG/CCT,AGC/GCT,AAC/GTT,ATC/GAT,AGT/ACT,CGA/TCG,AAT/ATT7种重复基元,共420条SSR序列,占33.96%。AGT与CGT重复基元未见分布。[结论]在称猴桃EST序列中,二核苷酸重复序列是最丰富的重复单元,其次为三核苷酸重复和六核苷酸重复。在所获得的SSR重复单元中,AG/CT为优势重复。
- 姜春芽徐小彪廖娇倪志华李晶
- 关键词：猕猴桃表达序列标签微卫星
- 基于EST-SSR标记分析猕猴桃种质遗传关系被引量：14
- 2012年
- 利用开发的11对EST-SSR引物分析了33份猕猴桃种质资源的遗传多样性及其遗传关系。结果表明,11对EST-SSR引物在所有供试材料中均可扩增出清晰条带,其中有8对引物呈现多态性,多态性扩增率为72.7%,对33份种质材料的区分率达100%。8对多态性引物共检测到61个等位基因,每对引物可检测到的等位基因数为2-17,平均为7.6个。利用NTSYS-pc软件,以不加权成对算术平均法(UPGMA)对扩增结果进行聚类,谱系图显示,33份种质材料之间的相似系数在0.60～0.97,表明猕猴桃种质之间遗传关系相对来说不是很远。在相似系数0.73的水平上可将供试猕猴桃材料分为7个类群,其结果与传统的形态分类大体一致。从分子角度揭示了猕猴桃种质资源的遗传多态性及其遗传关系。可为猕猴桃种质改良提供理论依据。EST-SSR是非常有效和可靠的分子标记,可为猕猴桃分子育种及遗传连锁图构建奠定基础。
- 徐小彪廖娇黄春辉辜青青曲雪艳刘善军陈金印
- 关键词：猕猴桃种质资源
- 基于EST-SSR标记的江西部分猕猴桃种质遗传关系分析
- 新型的EST-SSR标记已成为重要农艺性状定位,基因作图,遗传多样性,比较基因组学研究的重要工具。EST-SSR标记具有信息量大,通用性好,开发简单快捷,费用低等优点,是一种有效和可靠的分子标记。在一些果树中已建立了ES...
- 徐小彪廖娇黄春辉辜青青曲雪艳刘善军陈金印
- 关键词：猕猴桃EST-SSR种质资源
- 文献传递
