广州市科技计划项目(12C22061604)
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 相关作者：陆家海郭中敏申婧朱钧萍叶鹏凌更多>>
- 相关机构：中山大学教育部更多>>
- 发文基金：广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于EV71交叉保护抗原P1的前体蛋白B细胞抗原位点的预测被引量：1
- 2012年
- 目的获得EV71P1保守氨基酸序列COBRA EV71 P1和基于此序列的B细胞抗原表位预测信息。方法从NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)上下载获取1970-2010年间世界各地暴发流行的包含P1或VP1基因片段的EV71源序列和对应的氨基酸序列,根据VP1基因片段信息构建系统进化树,对源序列进行基因分组;对多基因型的EV71 P1氨基酸源序列采用多序列比对,以优势氨基酸位点代替差异氨基酸位点的方法,获得EV71 P1保守序列(COBRA EV71 P1),并运用IEDB Analysis Resource (http://tools.immuneepitope.org/main/)在线预测工具和DNASTAR软件里的Protean模块,运用单参数和二级结构预测综合考虑的方法,对COBRA EV71 P1前体蛋白的B细胞抗原表位进行预测。结果成功比对出COBRA EV71 P1氨基酸序列,预测结果发现在COBRA EV71 P1前体蛋白的第10-24,41-60,68-82,208-225,328-345,498-514,592-609,664-678,772-786和841-855位点均具有较好的亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的无规则卷曲和β-转角,有可能是COBRA EV71 P1前体蛋白的优势表位。结论经生物信息学分析,推测COBRA EV71 P1可能具有三个基因型EV7 1P1前体蛋白的候选B细胞线性抗原表位,为EV71重组多表位疫苗设计和多基因型病毒样颗粒疫苗实验提供了理论基础。
- 叶鹏凌江丽凤高风华冯谦谨郭中敏陆家海
- 关键词：COBRAEV71P1前体蛋白
- 抗菌肽表达系统及应用的研究进展被引量：5
- 2013年
- 抗菌肽是生物体产生的一种具有抗菌活性的多肽类物质,它对细菌、真菌和病毒等都具有明显的杀伤作用。抗菌肽有望开发成为防治人和动物疾病的药物,应用前景广阔。本文就抗菌肽的分类、作用机制、表达系统以及应用前景作一综述。
- 朱钧萍申婧郭中敏陆家海
- 关键词：抗菌肽
