国家自然科学基金(30400001)
- 作品数：4 被引量：20H指数：3
- 相关作者：陈文新陈文峰隋新华严雪瑞傅俊范更多>>
- 相关机构：中国农业大学沈阳农业大学河南农业大学更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 小叶锦鸡儿根瘤菌的分离及其16S rDNA PCR-RFLP分析被引量：8
- 2007年
- 对辽宁地区与小叶锦鸡儿共生的根瘤菌资源进行了初步调查。采自5个不同地区样品的根瘤,通过分离、纯化、回接验证等试验共获得65株供试根瘤菌菌株。进一步选用4种限制性内切酶对供试根瘤菌进行了16S rDNA PCR-RFLP研究,结果表明其系统发育地位位于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobiumspp.),并在96%相似性水平上分为5个不同的类群,分别由相应的rDNA图谱组合代表。丰富度及频度分析表明,组合15是辽宁省的优势群,组合18丰富度居第二位,但频度最高,也是辽宁省的主要类群。
- 严雪瑞陈文峰陈文新傅俊范薛彩云隋新华
- 关键词：小叶锦鸡儿根瘤菌RDNARFLP
- 3株紫花苜蓿根瘤菌sinR基因的克隆、序列测定及系统发育分析被引量：1
- 2008年
- 为从与紫花苜蓿共生的3株不同根瘤菌（CCBAU 30085、USDA 1002和CCBAU QH180）中扩增参与根瘤菌群体感应调控的转录激活蛋白基因（sinR基因）并比较它们的不同，根据文献[1]，设计了一对引物，通过PCR扩增，将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体上，转化大肠杆菌DH5α，经蓝白斑和氨苄青霉素筛选得到阳性转化子，用通用引物测序后将序列与已报道的sinR基因（GenBank登录号为AL591788）进行了同源性比较和系统发育分析，本试验成功克隆到了sinR基因，经同源性及系统发育分析后，结果表明，CCBAU30085、USDA1002和CCBAUQH180这3株菌的sinR基因序列相似性高达99％；它们与已知的Sinorhizobium meliloti 1021中的sinR基因序列相似性到达99．7％-100％，与具有相同功能的豌豆根瘤菌及埃氏菜豆根瘤菌中的raiR基因之间的相似性低于45％，这说明与紫花苜蓿共生的根瘤菌虽然经历了长期的进化，但其sinR基因在长期的进化过程中，却是一个非常保守的基因。
- 陈文峰李洪波
- 关键词：根瘤菌紫花苜蓿
- 合欢、金合欢和银合欢根瘤菌系统发育研究方法比较被引量：8
- 2008年
- 利用位于染色体不同位点的多个基因序列进行分析是原核生物分类与系统发育研究的一个热点。本文采用atpD和glnⅡ两个持家基因的部分序列对9株分离自我国合欢、金合欢和银合欢的根瘤菌进行系统发育研究,并与以16SrDNA基因序列构建的系统发育树进行比较。结果表明三者在属水平上基本一致,CCBAU43060、CCBAU61139位于Rhizobium-Agrobacterium系统发育分支内;CCBAU51471、CCBAU35220、CCBAU51276和CCBAU61158属于Mesorhizobium,CCBAU35234、CCBAU61178和CCBAU35085位于Bradyrhizobium系统发育分支;在属内种间个别菌株(CCBAU61158、CCBAU43060、CCBAU61178)的系统发育地位存在差异,表明属内种间存在较广泛的基因交流。因此利用16SrDNA确定属水平的分类地位比较可靠,但利用系统发育的方法研究属内种间亲缘关系应采用多个功能保守的持家基因同时进行分析才能得出比较可靠的结论。
- 王风芹张勇法刘杰宋安东刘全军陈文新
- 关键词：系统发育
- 辽宁营口地区锦鸡儿与树锦鸡儿根瘤菌遗传多样性研究被引量：4
- 2007年
- 对锦鸡儿与树锦鸡儿根瘤菌进行研究,以了解其系统发育地位及遗传多样性。通过分离、纯化、回接结瘤测定共获得了31株待测菌,并采用16S rDNA PCR RFLP及BOX-PCR等方法对这些菌进行了研究。结果表明,31株待测菌的系统发育地位全部源于中间根瘤菌属(Mesorhizobium spp.),并产生5种不同的rDNA图谱组合。BOX-PCR研究中,待测菌株呈现出较高的多样性,在80%相似性水平上,将待测菌归于17个不同的类型当中。
- 严雪瑞陈文峰陈文新傅俊范周如军隋新华
- 关键词：锦鸡儿树锦鸡儿根瘤菌RFLPBOX-PCR
