上海超级计算中心
- 作品数：187 被引量：375H指数：11
- 相关作者：李根国丁峻宏郭培卿徐莹徐磊更多>>
- 相关机构：上海交通大学上海大学中国科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学交通运输工程建筑科学更多>>
- nPME对GROMACS软件并行计算性能的影响分析
- 2014年
- 在分子动力学并行计算的过程中,正确地处理好并行规模与PME(Particle-Mesh Ewald)方法的任务分配,对于提高分子动力学的并行效率具有非常重要的影响。以常用的分子动力学软件Gromacs[1-3]为例,利用上海超级计算中心"魔方"超级计算平台,就不同并行规模与不同PME任务分配方式下的计算性能进行测试。发现并行能在一定的范围内显著的提高Gromacs的计算效率,但是当并行规模超过一定值后,计算效率反而下降。另一方面,当并行规模较小时,不设置PME专属节点的计算效率较高;但当并行规模较大时,合理的设置PME专属节点,能显著地提高计算的效率。这一结果能对从事分子动力学模拟的研究人员合理分配并行资源提供帮助。
- 寇大治左光宏
- 关键词：并行计算分子动力学GROMACSPME
- 超算中心Xfinity高性能计算平台软件v1.0
- 李根国姜恺吴建成刘杰徐彬魏玉琪邓雪滨张挺刘波刘晶张伟刘祎洋徐磊张丹丹陈家慧徐莹薛刚戴坚君邹伟新王涛寇大治时伟
- 该软件面向高性能计算用户，整合上海超级计算中心及用户内部资源，为用户提供方便、快捷的使用资源的方式，包括文件管理、作业提交、作业管理、动态信息查询、统计信息查询、交流空间、命令行以及用户管理、项目管理等功能；保证用户使用...
- 关键词：
- 高性能计算在材料科学中的应用被引量：1
- 2011年
- 在当今的科学研究中，计算已和实验、理论并列为三大科学方法。随着计算技术的迅猛发展、科学理论模型日渐成熟．高性能计算在科学、工程和社会等领域都有了广泛应用，用它来模拟或代替实验已成为可能。在地球地质、气象气候、测绘科学、天体空间物理、凝聚态物理、高能物理、计算化学、分子生物学、基因测序、材料科学等领域，高性能计算已是必备的研究手段。
- 胡双林
- 三维Navier-Stokes方程分步法的并行算法在异构平台上实现初探被引量：1
- 2012年
- 本文选取了三维不可压缩流动方程的分步法(fractional-step method),其中动量方程使用BiCGSTAB算法进行迭代求解,而压力泊松方程使用Fourier变换法进行直接求解。本文研究该算法在集群平台上的并行算法,从区域分解入手,分析一维、两维、三维区域划分三种情况下,各并行处理器上的计算量与通讯量,根据分析结果使用两维区域分解。分析BiCGSTAB算法和泊松Fourier变换法在GPGPU异构平台上的移植方法。最后,本文分析了BiCGSTAB和泊松方程Fourier变换法两种算法在CPU集群和GPGPU异构平台上的并行性能结果。
- 徐莹徐磊姜恺
- 关键词：异构平台GPGPU分步法
- 爆炸冲击波对建筑玻璃幕墙破坏作用的三维数值模拟研究
- 基于建筑玻璃幕墙防爆炸实验，建立了包括炸药、空气、幕墙防爆炸测试系统、地面等多个对象在内的精细三维分析模型。在高性能计算平台上应用LS-DYNA显式程序，采用多物质的ALE 有限元法实现爆炸冲击波与玻璃幕墙结构间的耦合作...
- 邓荣兵金先龙陈峻丁峻宏
- 关键词：爆炸冲击波建筑玻璃幕墙ALE方法数值模拟有限元法爆炸荷载
- 文献传递
- 高性能计算在制造业和工程领域的若干应用
- <正> 上海超级计算中心成立于2000年12月,由上海市政府投资建设,是国内第一个面向社会开放、资源共享、设施一流、功能齐全的高性能计算公共服务平台。首先介绍近年来高性能计算在工程计算方面的快速发展情况;其次介绍作为高性...
- 李根国
- 关键词：CAE有限元数值仿真
- 文献传递
- 异构分类器堆叠泛化及其在恶意评论检测中的应用被引量：3
- 2019年
- 恶意评论检测是预防社会媒体平台给用户带来负面影响的一项重要工作,是自然语言处理的重要领域之一.为解决单分类器实现恶意评论检测时模型精度不稳定、boosting集成模型精度较低的问题,提出一种异构分类器堆叠泛化的方法.该方法用深度循环神经网络将多标签的恶意评论分类问题转变为二类分类,防止了模型精度不稳定;用堆叠泛化集成时单个分类器GRU(Gated Recurrent Unit)和NB-SVM(Naive Bayes-Support Vector Machine)在模型结构和分类偏差上的差异性,改善了模型精度.在维基百科恶意评论数据集上的对比实验证明:提出的方法优于boosting集成,说明堆叠泛化异构分类器实现恶意评论检测是可行且有效的.
- 吕品于文兵汪鑫计春雷周曦民
- 关键词：循环神经网络
- 高性能计算促进多学科优化设计发展
- 2010年
- 由于计算机计算速度的持续提升,当前工业产品研发过程中的大部分实验被计算模拟所取代,本文以飞机空气动力学设计、汽车安全性设计以及大型土木工程为例,说明计算模拟在工业工程中已发挥巨大作用,工业产品设计中比较单一的模拟或简化计算已转变为整机系统模拟和多学科优化设计。本文介绍了上海超级计算中心在大飞机和核电工程方面的典型应用,最后分析了工业产品多学科优化设计所面临的新挑战。
- 李根国
- 关键词：计算机辅助工程
- 服务器多网卡高可用技术的应用研究
- 2011年
- 随着服务器地位在企业内部的提高,它的可靠性、可用性及其I/O速度就显得非常的重要,保持服务器的高可用性和安全性是企业IT环境的重要指标,其中最重要的一点是服务器网络连接的高可用性。介绍了Linux服务器网卡高可用Bonding技术及采用Bonding技术的服务器,如何与交换机配合构建高可用的网络环境,并介绍了超算中心服务器与交换机模式不匹配问题的解决方法。
- 姚青
- 关键词：BONDING高可用性VRRP
- 高性能计算中的亚式期权蒙特卡罗加速方法被引量：1
- 2013年
- 研究蒙特卡罗控制变量方法在CPU(central processing unit)集群和GPU(graphic processing unit)计算环境中的实现问题.以离散取样的随机波动率下的算术平均亚式期权为例,选取合适的控制变量,分别研究了在CPU集群和GPU计算中算法与硬件并行加速两者的运算效率,并讨论了模型参数的变化对计算结果的影响.数值试验表明采用算法与硬件加速相结合的方法可以极大提高计算效率、缩短运算时间.
- 姜广鑫徐承龙寇大治徐磊
- 关键词：蒙特卡罗方法随机波动率
