中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室
- 作品数：62 被引量：209H指数：9
- 相关作者：杨勇田新莉朱颖旻陈振华成秋香更多>>
- 相关机构：华东理工大学生物工程学院生物反应器工程国家重点实验室华东理工大学生物工程学院中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学理学更多>>
- 一株真菌所产环缩酚酸肽类化合物的分离和鉴定
- 2014年
- 对一株真菌ZME及其所产的次级代谢产物进行分离鉴定。通过形态观察和ITS测序对真菌ZME进行菌株鉴定,并对其发酵液上清液和菌丝体分别用乙酸乙酯和甲醇萃取;萃取后的有机试剂粗提物经硅胶柱层析和半制备HPLC分离纯化;纯化后的各组分利用光谱分析进行结构解析。结果表明,真菌ZME初步判断属于Beauveria felina。对这株真菌次级代谢物结构解析,共鉴定5个化合物Isaridin B、Isaridin A、Roseocardin、Roseotoxin B和Destruxin B,这5个化合物均为环缩酚酸肽类化合物,其中Roseocardin具有抗细菌活性。
- 张明娥熊智强刘巧霞杨迎迎王勇
- 海洋微生物来源的天然产物开发研究进展被引量：18
- 2011年
- 综述了近年来海洋微生物来源天然产物研究的新进展,总结了该类天然产物的开发策略.通过对样品采用不同的预处理方式、不同的分离培养基以及新的培养方法,讨论如何获得海洋来源的特有微生物和增加海洋来源微生物类群的多样性.阐述了在海洋微生物天然产物的开发过程中,采用宏基因组技术及基因组测序等手段,来发现难培养或不可培养微生物中的天然产物以及处于"沉默"状态的天然产物.最后介绍了异源生物合成、组合生物合成以及核糖体工程等技术在海洋微生物天然产物开发和改造中的应用,并举例论述了海洋微生物天然产物的开发.
- 陈菲菲王勇王以光赫卫清
- 关键词：海洋微生物基因组测序组合生物合成
- 六蕊假稻Leersia hexandra病原真菌稻平脐蠕孢Bipolaris oryzae的分子鉴定及致病性研究被引量：1
- 2013年
- 为了筛选获得具除草潜力的病原真菌菌株,经形态学观察和18s rDNAITS序列分析,6株分离自感病六蕊假稻的菌株被鉴定为稻平脐蠕孢Bipolaris oryzae。采用培养皿生测法和盆栽生测法分别评价其发酵液毒素和菌丝体悬浮液的除草活性,同时用盆栽生测法测定了菌丝体悬浮液对主要作物的安全性。试验结果表明:6株稻平脐蠕孢培养14 d的发酵液对稗草根长、芽长均有很高的抑制作用,根长和芽长最高抑制率分别为100%和80.38%。培养7 d的菌丝体悬浮液对稗草的感病率、感病指数、株高抑制率、鲜重抑制率最高可达100%、72.00、50.29%和63.31%。6株稻平脐蠕孢菌丝体悬浮液对稗草、千金子、六蕊假稻、鸭舌草、矮慈姑、野荸荠具有不同程度的致病性,对双穗雀稗、异性莎草、看麦娘不致病。6株稻平脐蠕孢对主要农作物安全或致病性很弱,具有进一步开发为生物除草剂的潜力。
- 韩川段桂芳张建萍陆永良余柳青
- 关键词：分子鉴定
- 元基因组来源新型木聚糖酶的功能研究与分子改造
- 木聚糖酶是一类将木聚糖降解成低聚木糖或木糖的水解酶,其广泛应用于造纸、食品、饲料和果蔬制品等工业领域。木聚糖是自然界中第二大丰富的多聚糖,大约占地球上所有可再生有机碳的三分之一,因此木聚糖酶在可再生能源的生产中具有更重要...
- 钱昌丽刘宁王钱福周志华
- 关键词：木聚糖酶热稳定性定向进化结构域
- 文献传递
- DNA组装新方法的研究进展被引量：2
- 2013年
- 2010年,蕈状支原体Mycoplasma mycoides的人工合成,迎来了合成生物学的崭新时代。这种突破性的进展主要得益于酵母自身强大的DNA体内重组能力。近几年来,除了利用体内重组的DNA大片段拼接技术,基于连接或聚合思想的不同尺度的DNA体外组装方法也相继出现,如Biobrick\Bglbrick、SLIC与Gibson等温一步法等,这些方法的应用加快了合成生物学功能元件库、生物合成途径乃至微生物染色体的人工构建。事实上,目前所建立的各种DNA组装方法,均是由DNA分子拼接理念(包括两分子衔接思想与多片段组装模式)衍生而来。文中将在介绍DNA组装基本理念的基础上,对体内、体外主要的DNA组装方法进行简要梳理,希望为不同类型的合成生物学功能器件及生物合成途径的构造提供参考与借鉴。
- 李雷芦银华姜卫红
- 关键词：合成生物学生物合成途径
- 复杂天然产物合成人工生物系统的设计与构建被引量：1
- 2013年
- 天然产物是人类疾病预防和治疗药物的最重要来源。合成生物学技术的蓬勃发展为天然产物的开发注入了全新的活力。文中重点介绍了如何利用合成生物技术进行复杂天然产物合成人工生物系统的设计与构建,包括与此相关的生物元件理性设计、生物元件挖掘、途径装配与集成,模块的组装与系统的适配等内容。
- 汪建峰蒙海林熊智强王勇
- 关键词：合成生物学
- 基因组工程改良多拉菌素和尼莫克汀工业生产菌
- 多拉菌素(Doramectin)是辉瑞公司于20世纪90年代开发的阿维菌素结构类似物,通过在前体合成缺陷的除虫链霉菌(Streptomyces avermitilis)突变株发酵过程中添加环己烷羧酸生产.尼莫克汀(Nem...
- 夏海洋党福军黄隽徐晴雨王海彬覃重军
- 植物细胞壁松弛因子被引量：13
- 2011年
- 植物细胞壁的松弛是细胞伸长必需的一个生理过程,发生于植物生长发育的各个阶段。研究发现参与细胞壁松弛的因子有多种,主要包括膨胀素(expansin)、木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(XTH)、糖基水解酶和羟基自由基(·OH)四大类。本文主要对这些细胞壁松弛因子的结构特征、作用机制及其在植物生理过程中的作用等方面的研究进展进行综述。
- 赵运军李来庚
- 关键词：膨胀素羟基自由基
- 利用合成调控RNA技术提高大肠杆菌异源合成红霉素前体6-脱氧红霉内酯B产量被引量：1
- 2015年
- 红霉素为代表的聚酮类化合物已经成功的在大肠杆菌中实现了异源合成,但其产量仍然较低（仅-10 mg/L）。本研究基于大肠杆菌全基因组代谢模型iAF1260,利用通量平衡分析预测了红霉素母核6-脱氧红霉内酯（6-Deoxyerythronolide B,6-d EB）生物合成的关键靶点,通过合成调控RNA技术（Synthetic small regulatory RNAs,sRNAs）对预测的靶点进行验证。结果表明,以弱化lsrC（编码LsrABC转运蛋白）和ack A（编码乙酸激酶蛋白）为代表的关键靶点改造可以显著提高6-d EB异源合成,提高幅度可达48.7%。通过弱化靶点的组合,进一步改善了6-d EB的异源合成,产量最终可达22.8 mg/L,比出发菌株产量提高59.9%。本研究发现和确认了6个有效的调控靶点,最终成功地改善了6-d EB在大肠杆菌中的异源合成。研究表明,通量分布比较分析结合sRNAs技术是一种有效的方法提高6-d EB异源合成,也为改善其他代谢产物的异源合成提供了可供借鉴的研究思路。
- 宋书杰熊智强王勇
- 关键词：大肠杆菌
- 代谢调控的新发现被引量：1
- 2010年
- 能量代谢一直是最为热门的研究领域之一.对乙酰化调控代谢的机理的研究发现,代谢酶类赖氨酸残基的乙酰化修饰与很早就发现的转录调控、反馈抑制、变构调节及磷酸化修饰一样是一种广泛存在于原核和真核生物体内的保守代谢调控机制,即乙酰化修饰不仅可以抑制/激活代谢酶的催化活力、影响蛋白的稳定性,还可能协调代谢途径中各个代谢酶类的活性,并在协调不同通路的代谢流分布中发挥更为广泛的生理功能,进而在细胞整体水平上调控代谢.最近还发现一些中间代谢物在细胞信号中起重要作用,不平衡地积累2-羟基戊二酸或减少α-酮戊二酸会对加双氧酶蛋白家族产生重要的影响,改变包括HIF途径在内的肿瘤相关信号通路,并可能引起组蛋白甲基化修饰的改变.由于代谢与人类疾病紧密相关,这些新的发现在科学界引起了人们广泛的兴趣.
- 王启军赵世民
- 关键词：代谢调控乙酰化信号通路
