郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
- 作品数:93 被引量:510H指数:11
- 相关作者:冯丽云王琳琳杨召陈阿群李立更多>>
- 相关机构:华中科技大学同济医学院公共卫生学院华中科技大学同济医学院深圳大学医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于CRISPR对大肠埃希菌O157∶H7的检测被引量:5
- 2016年
- 目的基于成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR),建立对大肠埃希菌O157∶H7的新型检测方法。方法应用PCR扩增实验室保存的443株肠道细菌(310株非O157∶H7大肠埃希菌、35株大肠埃希菌O157∶H7、89株志贺菌和9株沙门菌)的CRISPR1和CRISPR2,并将PCR产物测序;提取CRISPR database数据库中(标准法)100株肠道细菌(47株非O157∶H7大肠埃希菌、5株大肠埃希菌O157∶H7、9株志贺菌和39株沙门菌)的CRISPR1和CRISPR2序列。使用CRISPR Finder在线软件分析PCR产物测序序列和CRISPR database数据库的CRISPR序列。Clustal X软件进行间隔序列比对。比较标准法和PCR扩增CRISPR两种方法检测大肠埃希菌O157∶H7的一致性。结果共分析543株肠道细菌,其中75.6%的非O157∶H7大肠埃希菌、75.5%志贺菌、91.7%沙门菌和95%O157∶H7大肠埃希菌含有CRISPR1,其间隔序列数目为3~26、2~9、2~32、3。57.1%的非O157∶H7大肠埃希菌、77.6%志贺菌、85.4%沙门菌和100%O157∶H7大肠埃希菌含有CRISPR2,其间隔序列数目为1~20、1~6、2~27、1或4个。95%的O157∶H7大肠埃希菌的CRISPR1和90%CRISPR2分别含有3条独特间隔序列(S1-1,S1-2,S1-3)和1条独特间隔序列(S2-1)。间隔序列比对结果显示,S1-1+S1-2+S1-3和S2-1检测O157∶H7大肠埃希菌的特异性分别是100%和99.6%。标准法检测和PCR扩增CRISPR1和CRISPR2检测大肠埃希菌O157∶H7的一致性分别达99.6%和99.3%。基于CRISPR检测大肠埃希菌O157∶H7在模拟样品中的应用,结果显示在原样品大肠埃希菌O157∶H7浓度约2.3CFU/mL时,经12h增菌后即能检测出来。大肠埃希菌O157∶H7聚类分析显示,40株O157∶H7大肠埃希菌可分为3类。结论基于CRISPR的大肠埃希菌O157∶H7的检测方法,可以作为监测大肠埃希菌O157∶H7感染和高毒株大肠埃希菌O157∶H7有价值的流行病学工具。
- 梁文娟张荣光段广才王颖芳洪丽娟张冰王鹏飞郗园林杨海燕
- 关键词:聚合酶链反应
- 两类医疗机构医务人员结核病职业防护现况对比研究
- 2015年
- 目的对比分析综合性医院、传染病防治医院的医务人员对结核病知识的知晓水平、职业防治行为,探讨两类医疗机构结核职业防护的管理策略。方法用横断面研究的方法,对河南某市一综合性医院和一传染病医院医务人员作结核医院管理现状的问卷调查,内容包括结核知识知晓、职业防护行为等,对纳入对象作结核菌素皮肤(tuberculin skin test,TST)试验或收集既往TST检测结果。结果综合性医院、传染病医院完成问卷调查的对象分别是333人、398人,有TsT检测结果的分别是325人、312人;综合性医院人员TST阳性率(34.2%)低于传染病医院(48.7%)(x^2=13.93,P〈0.001)。综合性医院人员对9个结核知识单项的正答率除一项外均低于传染病医院(均有P〈0.05);对职业防护各项措施的使用率低于传染病医院(P〈0.001);两医院对医院防护口罩的使用率均极低。结论两类医疗机构,尤其是综合性医院应重视医务人员结核杆菌感染的医院管理,以降低其医务人员结核感染的职业风险。
- 卢洁王一然赵鲜丽郝义彬王晓楠刘建民王屹周枫
- 关键词:广泛耐药结核医务人员职业卫生
- 应用人工神经网络预测个体患2型糖尿病危险度
- 目的 以2型糖尿病流行病学现场调查资料为基础,探讨人工神经网络模型(artificial neural network,ANN)在个体2型糖尿病患病风险预测中的应用,评价预测个体患2型糖尿病的新方法.方法 通过横断面调查...
- 王重建翟羽佳王炳源任永成刘晓田张路宁李文杰胡东生
- LASSO及其拓展方法在回归分析变量筛选中的应用被引量:11
- 2023年
- 多重共线性是影响回归分析结果的一个重要问题,近年来发展的LASSO方法对于筛选解释性较高的变量、处理高维数据和解决多重共线性问题具有强大的优势。该方法是在模型估计中增加了惩罚项,能将一些不必要变量的回归系数压缩为零进而从模型中剔除,达到变量筛选的目的。本文将重点介绍LASSO这一方法,并与最优子集、岭回归、自适应LASSO与弹性网络的结果进行比较,结果显示LASSO与自适应LASSO在解决自变量多重共线性问题以及增强模型解释性、预测精度方面均有较好的表现。
- 奚丽婧郭昭艳杨雪珂平智广
- 关键词:多重共线性
- 静息心率与高血压发病风险的关系及性别、年龄对其的修饰效应被引量:4
- 2020年
- 目的探讨我国农村地区成年人群静息心率与高血压发病风险的关系及性别、年龄对其的修饰效应。方法该研究为队列研究。于2007年7月至2008年8月在河南省新安县选取2个镇为研究现场,以自然村为单位采用整群随机抽样的方法抽取调查村庄,进行基线调查。根据标准入选常住居民20194人。于2013年7月至2014年10月对入选者进行随访,最终完成随访者17265人。排除基线高血压患者、基线静息心率资料缺失者、随访期间死亡者、随访时高血压诊断资料缺失者以及诊断为妊娠高血压者,最终共10212人纳入该研究。基线和随访调查均包含问卷调查(人口统计学资料、行为危险因素、疾病史及用药史等)、人体测量(身高、体重、静息心率及血压测量)、空腹血糖以及脂质谱检测。按照静息心率的四分位数值将研究对象分为4组,即Q1组、Q2组、Q3组和Q4组。既往无高血压病史,随访期间收缩压≥140 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa)和/或舒张压≥90 mmHg,或正在服用降压药物定义为新发高血压。以基线静息心率为自变量,以随访与基线的血压差值为因变量,采用多重线性回归分析静息心率与血压差值的关系。采用多因素logistic回归模型分析静息心率与高血压发病风险的关联强度[即比值比(OR)及其95%可信区间(CI)]。然后采用公式计算高血压发病风险,即计算其相对危险度(RR)。该研究还针对性别(男性和女性)和年龄(<60岁和≥60岁)进行了亚组分析。结果研究平均随访6.0年,新发高血压病例累计2059例,其中男性839例。多因素logistic回归分析结果显示,在总人群中校正了潜在混杂因素后,静息心率每增加5次/min,高血压发病风险的RR值为1.04(95%CI 1.01~1.08,P<0.05)。校正潜在混杂因素后,在女性人群中静息心率每增加5次/min,收缩压差值增加0.18 mmHg(95%CI 0.01~0.36 mmHg,P=0.046),同时高血压发病风险增加(RR=1.07,95%CI 1.03~1.11
- 孙浩航牛振民赵阳胡东生
- 关键词:高血压性别因素年龄因素静息心率
- 静息心率与代谢综合征关系的队列研究被引量:3
- 2016年
- 目的 探讨静息心率(RHR)与MS发病的关系。方法 采用整群抽样方法,选择河南省某农村地区≥18岁常住居民为研究对象。2007年7-8月和2008年7-8月进行问卷调查、体格检查、血糖及脂质谱检测。2013年7-8月和2014年7-10月进行与基线相同内容的随访。结果 在平均6年的随访期间,MS累积患病率为21.89%(1 933/8 829),其中男性为16.78%(664/3 957),女性为26.05%(1 269/4 872);控制潜在的混杂因素后,以基线RHR〈60次/min组为参照,RHR 60~69、70~79、80~89和≥90次/min组发生MS的OR值(95%CI)分别为1.24(0.95~1.60)、1.42(1.10~1.84)、1.63(1.24~2.15)和1.62(1.16~2.27),其中男性分别为1.12(0.81~1.55)、1.23(0.88~1.71)、1.42(0.97~2.07)和1.84(1.09~3.11),女性分别为1.46(0.93~2.29)、1.70(1.09~2.65)、1.99(1.25~3.16)和1.78(1.06~2.98)。结论 女性MS发病风险高于男性且升高的RHR增加MS发病风险。应制定针对RHR升高的成年人群尤其是女性的MS综合干预策略和措施。
- 韩成义罗新萍张明张璐任永成王炳源张红艳杨香玉周俊梅赵阳刘雪娇张冬冬李琳琳王重建尹磊庞超冯天平赵景志胡东生
- 关键词:静息心率代谢综合征队列研究
- 中国汉族人群TCF7L2基因与BMI、腰围在2型糖尿病中的交互作用
- 目的 2型糖尿病是一种由多因素引起的复杂性疾病,遗传和环境因素在糖尿病的发病中均起了重要作用.TCF7L2基因是目前公认的与糖尿病存在强关联的基因之一,但TCF7L2基因与人类体重和身体脂肪间的关系目前尚不清楚,因此,本...
- 李琳琳王重建王炳源任永成赵阳韩成义胡东生
- 基于心理健康维度的农村老年人健康预期寿命测算——多状态马尔科夫模型被引量:1
- 2024年
- 目的 评估农村老年人基于心理维度的预期寿命(life expectancy, LE)和健康预期寿命(healthy life expectancy, HLE),以便提出延长农村老年人LE和HLE的对策建议。方法 基于“河南农村队列”基线和随访调查数据,通过多状态寿命表法分年龄性别计算农村≥60岁老年人群的LE和HLE。所计算的HLE指标包括无抑郁或焦虑症状预期寿命(depression-or anxiety-free life expectancy, DAFLE)、无抑郁症状预期寿命(depression-free life expectancy, DFLE)和无焦虑症状预期寿命(anxiety-free life expectancy, AFLE)。结果 60岁总人群的DAFLE、DFLE和AFLE分别为20.081 5岁、20.230 1岁和20.435 2岁,分别占LE的95.85%、96.28%和96.99%;60岁男性的DAFLE、DFLE和AFLE分别为18.076 8岁、18.012 8岁和18.166 5岁,分别占LE的96.70%、97.10%和97.41%;60岁女性的DAFLE、DFLE和AFLE分别为22.811 6岁、23.325 3岁和23.492 2岁,分别占LE的95.33%、95.59%和96.57%。结论 农村老年女性HLE/LE值低于男性,提示抑郁症状和焦虑症状对女性生命质量的影响大于男性。
- 王重建胡泽江凤刘晓田李润鑫
- 关键词:抑郁焦虑
- CRISPR1上游侧翼序列用于大肠埃希菌和志贺菌鉴定的效果评价被引量:2
- 2018年
- 目的探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列(CRJSPR)1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas),并分析其种系;选取CRISPRs上、下游各500bp侧翼序列,使用ClustalX进行序列比对;采用PCR方法扩增CRISPR1上游侧翼序列,以确定其对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。结果73.4%(149/203)的大肠埃希菌存在I-E型CRISPR/Cas系统,包含了A、B1、D种系;8.4%(17/203)的大肠埃希菌存在I-F型CRISPR/Cas、17.2%(35/203)的大肠埃希菌不存在CRISPR/Cas,这2种大肠埃希菌均属于B2种系;9株志贺菌均存在I-E型CRISPR/Cas。在大肠埃希菌(B2种系外)、志贺菌CRISPR1上游和大肠埃希菌(B2种系)各存在61bp侧翼序列,序列一致性为99%,且有种属特异性,PCR扩增此区域鉴定大肠埃希菌和志贺菌的灵敏度和特异度均>91%。结论基于CRISPR1上游序列可用来鉴定大肠埃希菌和志贺菌,且具有良好的效果。
- 梁文娟梁文娟段广才刘慧莹段广才郗园林杨海燕陈帅印
- 关键词:大肠埃希菌志贺菌侧翼序列
- 应用人工神经网络预测个体患2型糖尿病危险度
- 目的 探讨人工神经网络模型在个体2型糖尿病患病风险预测中的应用,评价预测个体患2型糖尿病的新方法。方法 通过横断面调查对河南某农村社区8640名居民进行流行病学调查,按3∶1的比例随机分为训练集(6480例)与检验集(2...
- 王高帅郭奕瑞王重建张路宁刘晓田张红艳李文杰胡东生
- 关键词:2型糖尿病人工神经网络LOGISTIC回归