巴德仁贵
- 作品数：10 被引量：22H指数：3
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- 几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析被引量：11
- 2015年
- 以拟南芥和蓖麻为重点,利用生物信息学对不同植物的类伐昔洛韦水解酶(valacyclovir hydrolase-like,VACVase-Like)蛋白的理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、导肽、亲疏水性、二级结构及三级结构等进行预测和分析,并构建了该家族系统发生树。结果表明,除了可可树属于稳定蛋白外,其余均属于不稳定蛋白。该基因家族均含有明显的信号肽、导肽、跨膜结构和亲疏水结构,且结构组成上相似,属于分泌蛋白,但是对亚细胞定位分析发现,在不同植物中存在和发挥功能部位均不相同。分析结果可为植物VACVase-like的研究提供有价值的信息,为进一步研究其在植物体内的功能和作用机理提供依据。
- 巴德仁贵李爽王绍萌马勇哈斯阿古拉
- 关键词：伐昔洛韦生物信息学
- 甜瓜14-3-3基因家族全基因组鉴定与进化分析被引量：3
- 2013年
- 以拟南芥的14-3-3蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得9个14-3-3蛋白序列,其中ε类5个、非ε类4个。对甜瓜14-3-3基因家族进行了系统发生分析、内含子数量分析、序列相似性比对,通过对所有甜瓜的14-3-3蛋白相匹配的Unigene分析后发现,部分基因在多种组织中均有表达,部分基因在甜瓜果实以及花中高丰度特异表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大差异。甜瓜14-3-3基因家族成员的分子进化及表达模式的研究结果表明基因重复后发生功能分化。
- 马勇刘嘉荣巴德仁贵哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜基因家族进化分析
- 抑制性差减杂交法分离鉴定甜瓜果实呼吸跃变过程中特异表达基因
- 高峰郝金凤巴德仁贵姚远张立全牛一丁哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜
- 抑制性差减杂交法分离鉴定甜瓜果实呼吸跃变过程中特异表达基因
- 果实成熟是高等植物生命周期中的一个重要环节,而呼吸跃变是果实成熟过程中特有的重要生理现象,是果实从成熟到衰老的转折期。为阐明甜瓜果实呼吸跃变的分子机理,本研究以典型的呼吸跃变型甜瓜品种河套蜜瓜为研究对象,采用抑制性差减杂...
- 高峰郝金凤巴德仁贵姚远张立全牛一丁哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜呼吸跃变抑制性差减杂交特异表达基因
- 文献传递
- 甜瓜持绿蛋白的生物信息学分析被引量：2
- 2014年
- 采用生物信息学方法,对甜瓜持绿蛋白(stay-green protein,SGR)理化性质、信号肽、前导肽、功能型位点、疏水性和亲水性、跨膜结构域、蛋白质二级结构和三级结构进行预测和分析,并构建系统进化树.结果表明:甜瓜含有4个持绿蛋白家族成员,进化分析发现有2个同源基因对,同源的基因对之间功能上完全冗余,4个蛋白都不具有信号肽和跨膜结构域,属于非分泌型蛋白,推测SGR可能在细胞质基质中发挥功能.采用同源建模法预测其三级结构,并通过拉氏构象图分析准确性和合理性,证明了同源建模的结果相对可靠性.
- 巴德仁贵殷振琦李爽马勇哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜基因家族生物信息学分析
- 甜瓜ERF转录因子基因家族的全基因组鉴定与进化分析
- AP2/ERF蛋白是广泛分布于植物界的转录因子,是一个由众多成员组成的转录因子超家族,该家族参与植物生长发育及调控生物和非生物胁迫反应.根据序列相似性和AP2/ERF结构域的数量,可将AP2/ERF转录因子超家族分为AP...
- 马勇巴德仁贵哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜ERF转录因子进化基因组
- 甜瓜α-甘露糖苷酶基因cDNA片段的克隆、RNAi载体构建及转化
- α-甘露糖苷酶/(α-mannosidase, α-man/)是植物细胞壁糖蛋白代谢过程中的关键性糖苷酶,在植物果实发育成熟过程中起着重要的作用。本研究以呼吸跃变型甜瓜品种河套蜜瓜为研究对象,利用RT-PCR技术从甜瓜果...
- 巴德仁贵
- 关键词：甜瓜RNA干扰果实软化
- 文献传递
- 甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析被引量：4
- 2014年
- 以拟南芥的EIN3/EILs蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,搜索后获得4个EIN3/EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3/EILs基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构进行了分析。通过对所有甜瓜的EIN3/EILs基因的表达谱分析得知该基因家族在各组织中均有表达,其中在果实以及愈伤组织中高丰度特异表达,不同基因之间的表达模式差异明显。
- 马勇莘少红巴德仁贵哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜基因家族进化分析
- 甜瓜伐昔洛韦水解酶和持绿蛋白基因家族的全基因组鉴定及分析
- 甜瓜（Cucumis melo L.）是世界十大水果之一，具有重要的经济价值，也是研究葫芦科植物果实发育成熟的模式植物。2012年6月甜瓜全基因组测序已完成并公布，为利用生物信息学方法研究新基因及其功能奠定了基础。本研究...
- 巴德仁贵
- 关键词：甜瓜基因家族
- 文献传递
- 甜瓜持绿蛋白基因家族的全基因组鉴定及进化分析被引量：3
- 2014年
- 持绿蛋白在调节植物叶绿素降解和衰老过程中起到非常重要的作用,利用公布的甜瓜基因组数据,使用生物信息学方法对甜瓜全基因组SGR基因的结构、系统进化关系、保守基序及表达谱进行分析.结果表明：甜瓜中共有4个SGR类型基因,命名为CmSGR01～CmSGR04,其蛋白质在167～257 aa之间,通过系统进化树分析,发现甜瓜与黄瓜属同一科,它们的SGR聚在一起,说明相对其他物种,二者的SGR蛋白在其他物种分化后进化较小;MEME软件分析发现了SGR基因含有5个保守的基序.通过甜瓜SGRs基因家族的系统分析,为进一步阐明甜瓜中SGR蛋白结构及功能提供理论基础和有价值的资料.
- 巴德仁贵赵乾任凤蕊马勇哈斯阿古拉
- 关键词：甜瓜基因家族生物信息学分析
